EcogenO
| Type de service | Plateforme d'acquisition |
|---|---|
| Statut | En production |
| Autres noms | Plateforme Génomique Ecogeno |
| URL | https://ecogeno.univ-rennes1.fr/ |
| Contact | genomics@univ-rennes1.fr |
| Localisation | Rennes |
| Structure d'appartenance | OSUR, AnaEE-France |
| Tutelles | Université de Rennes, CNRS |
Cycle de vie des données
Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :
Dotée de séquenceurs NGS de 2ème génération (Illumina) et d'un grand nombre d'équipements satellites nécessaires à la préparation des échantillons, la plate-forme EcogenO propose la réalisation et l’accompagnement de projets de séquençage, de la préparation des librairies jusqu’à l’analyse primaire bio-informatique des données.
Un équipement de PCR quantitative et de génotypage très haut débit, (Smartchip system, Takara), offre à la communauté scientifique une capacité de conduite de projet pour des analyses fonctionnelles (qPCR et RT-qPCR, dPCR) et du génotypage SNP.
EcogenO dispose d’une grande capacité de stockage et d’analyses des données NGS permettant de développer des analyses bio-informatiques, spécifiques à un projet ou une application sur un mode collaboratif.
Domaines scientifiques :Vie & Santé
LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes; LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution Thématique et/ou mots clés :
- Plateforme de bioinformatique
- Génomique environnementale
Type de données :
Communauté d'utilisateurs : Usagers et bénéficiaires :
Conditions d'usage : Formulaire pour soumettre un projet
Conditions tarifaires :
Certification/Label :IBISA (https://www.ibisa.net/trouver-plateforme/)
ISO 9001-NFX 50-900 (?)
Conditions générales d'utilisation :
EcogenO est en lien avec les services et structures