PSI2BC

  PSI2BC

Type de service	Plateforme de calcul
Statut	En production
Autres noms	Plateforme de séquençage haut débit de l’I2BC
URL	https://www.i2bc.paris-saclay.fr/sequencing/ng-sequencing/
Contact	I2BC-sequencage@i2bc.paris-saclay.fr
Localisation	Gif-sur-Yvette
Structure d'appartenance	France Génomique, I2BC
Tutelles	CEA, CNRS, Université Paris-Saclay

Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :

Collecte

Analyse

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La plateforme PSI2BC est accessible à l’ensemble de la communauté scientifique, académique et industrielle. Elle prend en charge l’intégralité des prestations qui lui sont confiées, de la préparation des librairies et du séquençage à l’analyse primaire des données.

La plateforme propose à ses utilisateurs une large gamme de techniques pour la préparation de banques d’ADN ou d’ARN et pour leur séquençage avec la technologie Illumina ou Oxford Nanopore Technologies (ONT). Elle mène également des analyses bioinformatiques diverses (cartographie, expression différentielle des gènes...) définies en accord avec les utilisateurs en début de projet. Pour les projets complexes, des analyses bioinformatiques plus poussées peuvent être réalisées dans le cadre de collaborations.

Domaines scientifiques :Vie & Santé

LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes Thématique et/ou mots clés :

• Plateforme de bioinformatique
• Génome
• Transcriptome
• Séquençage haut débit
• Bioinformatique
• NGS
• RNA-Seq
• Small RNA-Seq
• Epigénomique
• Epitranscriptomique
• Illumina
• Oxford Nanopore Technologies
• Long reads
• Single cell

Type de données :Données génomiques, Données de séquençage

Communauté d'utilisateurs : Communauté scientifique, académique et industrielle Usagers et bénéficiaires :Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Doctorants, Industriels

Conditions d'usage : Pour soumettre un projet à PSI2BC, il est nécessaire de contacter la plateforme par téléphone ou par mail à l'adresse i2bc-sequencage@i2bc.paris-saclay.fr en expliquant aussi clairement que possible le projet de séquençage. La plateforme déterminera alors si elle est en mesure de prendre en charge le projet. Une réunion sera organisée pour préciser certains détails, analyser le projet ou planifier la réalisation des expériences. La prestation démarrera après réception du devis signé et des échantillons correctement annotés selon la fiche.

Conditions tarifaires : Après validation de la faisabilité du projet, la platforme enverra un devis.

Certification/Label :IBiSA (https://www.ibisa.net/trouver-plateforme/)

ISO 9001:2015 (https://qualite.ibisa.net/certificats/Certificat-haut-débit-gif ISO9001.pdf)

NFX 50-900:2016 (https://qualite.ibisa.net/certificats/certificat-nfx-i2bc.pdf)

Conditions générales d'utilisation :

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
France Génomique	GeT LIGAN-PM GenomiqueENS TGML MGX GenomEast GENOMAX UCA Genomix PSI2BC Biomics ICGex
I2BC	CRISPR-Cas++ ParameciumDB PSI2BC

Centre National de la Recherche Scientifique

Le GIS Infrastructure en Biologie Santé et Agronomie a pour vocation de structurer et de financer les infrastructures de recherche en sciences de la vie, en mutualisant leurs moyens.

2015

Systèmes de management de la qualité

Système de management intégrant un système de management de la qualité ISO 9001:2015 concernant les exigences pour les plateformes technologiques de recherche en sciences du vivant