« PNDB » : différence entre les versions

PNDB
Nom développé	Pôle National de Données de Biodiversité
Autres noms	Pôle de données d’observation pour la recherche sur la biodiversité, ECOSCOPE (ancien nom)
URL	https://www.pndb.fr
Tutelles	MNHN, FRB, Cirad, CNRS, Ifremer, INRAE, IRD, OFB, Université de Bretagne Occidentale, EPHE-PSL, Université Grenoble Alpes, Université de Lille, Université de Montpellier, Université de Rennes, Sorbonne Université, Université Marie et Louis Pasteur
Localisation	Paris

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Dernière version du 7 janvier 2026 à 10:25

Faisant suite à l’initiative ECOSCOPE (2011-2017) portée par la Fondation pour la recherche sur la Biodiversité, le Pôle National de Données de Biodiversité (PNDB) créée en 2018, est, depuis 2024, un pôle de donnée & service de l'infrastructure de recherche Data Terra du Système Terre-Environnement du Ministère de l'Enseignement Supérieur et de la Recherche et de l'Espace (MESRE) aux côtés des autres pôles Odatis (océan), Theia (surfaces continentales), FormaTerre (terre solide), et Aeris (Atmosphère). Le PNDB contribue et participe activement à la politique de Science ouverte du MESRE et de Recherche Data Gouv (Data terra étant centre de référence thématique du système Terre-Environnement).

Les missions du PNDB s’inscrivent dans une approche FAIR (Facile à trouver, Accessible, Interopérable, Réutilisable), et dans le cycle de vie des données et consistent à :

Fournir un accès aux métadonnées et jeux de données, à des services associés, à des produits dérivés des analyses, et à des ressources spécifiques ;
Promouvoir l’animation scientifique pour identifier les lacunes en termes d'accompagnement à l'ouverture et à la réutilisation des données, et favoriser les complémentarités entre les communautés productrices et utilisatrices des données ;
Faciliter le partage des pratiques avec les autres communautés de recherche, favoriser le partage des données et leur réutilisation, via l'IR Data Terra et les autres pôles (Theia, Odatis, FormaTerre, Aeris).
Favoriser la cohérence avec les efforts nationaux, européens et internationaux relatifs à l’accès et à l’exploitation des données de recherche sur la biodiversité, à la promotion de produits et services.

Domaines scientifiques :

Sciences & Technologies, Vie & Santé

PE10 Sciences du Système Terre LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution

Thématique et/ou mots clés :

Biodiversité
Terre solide et environnement
Système Terre et environnement

Offre de services de PNDB

PNDB : Catalogue de métadonnées (Plateforme d'accès)
Galaxy-E (Plateforme de calcul)

PNDB est en lien avec les services et structures

GBIF France, INPN, Phenome-Emphasis France, ELTER-France RZA, SINP, DoHNEE, PatriNat, DATA TERRA, ODATIS, Theia, Aeris, FormaTerre, Dinamis, Recherche Data Gouv, SIE, SIMM, SIB, RECOLNAT, FRB, AnaEE-France, FORESTT, PREZODE, GAIA DATA

Portée internationale de PNDB

GEO BON (https://geobon.org)

iBOL (https://ibol.org)

EOSC (https://eosc.eu/)

OFVi (https://www.oneforestvision.org/)

LifeWatch ERIC (https://www.lifewatch.eu)

GBIF (https://www.gbif.org)

GO FAIR (https://www.go-fair.org)

RDA (https://www.rd-alliance.org)

DataOne (https://www.dataone.org)

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 |NomAlternatifRéduit=Pôle de données d’observation pour la recherche sur la biodiversité, ECOSCOPE (ancien nom)
 |Url=https://www.pndb.fr
-|Tutelle=MNHN, BRGM, Cirad, CNRS, Ifremer, INRAE, OFB, FRB, AgroParisTech, Université des Antilles, Université de Bretagne Occidentale, Université Grenoble Alpes, Université de Lille, Université de Montpellier, Université Paris-Saclay, Université de Perpignan Via Domitia, Université de Poitiers, Université de Rennes, Sorbonne Université
+|Tutelle=MNHN, FRB, Cirad, CNRS, Ifremer, INRAE, IRD, OFB, Université de Bretagne Occidentale, EPHE-PSL, Université Grenoble Alpes, Université de Lille, Université de Montpellier, Université de Rennes, Sorbonne Université, Université Marie et Louis Pasteur
-|InfrastructureNationale=IR
-|TypeInfrastucture=Monosite
 |Localisation=Paris
 |NomStructureAlternatif=Pôle national de données de biodiversité, Pôle de données d’observation pour la recherche sur la biodiversité, ECOSCOPE (ancien nom)
 }}
 {{Coordonnées GPS
-|CoordonneeGeographique=48.84439, 2.34251
+|CoordonneeGeographique=48.84459, 2.35625
 }}
 {{DescriptionStructure
-|Description=Le '''Pôle national de données de biodiversité''', '''PNDB''' est un pôle de données au service des scientifiques produisant, gérant et analysant des données de biodiversité. Il a pour objet l’accès aux '''données d’observation, de collection et d’expérimentation''', en lien avec le réseau européen EU-BON (Biodiversity Observator y Network) et l’Organisation Internationale GBIF (Global Biodiversity Information Facility). Il permet aussi la '''mise en réseau des observatoires de recherche de la biodiversité'''. C'est un pôle de données de [[DATA TERRA]].
+|Description=Faisant suite à l’initiative [https://www.fondationbiodiversite.fr/wp-content/uploads/2019/05/ECOSCOPE.pdf ECOSCOPE] (2011-2017) portée par la Fondation pour la recherche sur la Biodiversité, le '''Pôle National de Données de Biodiversité''' (PNDB) créée en 2018, est, depuis 2024, un pôle de donnée & service de l'infrastructure de recherche [[DATA TERRA|Data Terra]] du Système Terre-Environnement du [[MENESR|Ministère de l'Enseignement Supérieur et de la Recherche et de l'Espace]] (MESRE) aux côtés des autres pôles [[ODATIS|Odatis]] (océan), [[Theia]] (surfaces continentales), [[FormaTerre]] (terre solide), et [[Aeris]] (Atmosphère). Le PNDB contribue et participe activement à la politique de Science ouverte du MESRE et de Recherche Data Gouv (Data terra étant centre de référence thématique du système Terre-Environnement).
-Le PNDB est une e-infrastructure de recherche inscrite à la feuille de route nationale des infrastructures de recherche du MESR depuis mars 2018.
-Les missions du PNDB sont :
-# fournir un accès aux données, à des services associés et à des produits dérivés des analyses ;
-# promouvoir l’animation scientifique pour identifier les lacunes et favoriser l’émergence de dispositifs portés par des communautés d’utilisateurs et producteurs ;
-# faciliter le partage des pratiques avec les autres communautés de recherche, favoriser le partage des données et leur réutilisation, s’insérer dans la réflexion de la future infrastructure Système Terre ;
-# favoriser la cohérence nationale et internationale relatives à l’accès et à l’exploitation des données de recherche sur la biodiversité, à la promotion de produits et services.
-Une partie des publications issues de projets utilisant l’infrastructure est en accès ouvert. Les codes sources produits par l’infrastructure sont ouverts sur une forge logicielle https://github.com/earnaud/MetaShARK-v2. Infrastructure dotée d’une politique de données FAIR en application.
+Les missions du PNDB s’inscrivent dans une approche FAIR (Facile à trouver, Accessible, Interopérable, Réutilisable), et dans le cycle de vie des données et consistent à :
+* Fournir un accès aux métadonnées et jeux de données, à des services associés, à des produits dérivés des analyses, et à des ressources spécifiques ;
+* Promouvoir l’animation scientifique pour identifier les lacunes en termes d'accompagnement à l'ouverture et à la réutilisation des données, et favoriser les complémentarités entre les communautés productrices et utilisatrices des données ;
+* Faciliter le partage des pratiques avec les autres communautés de recherche, favoriser le partage des données et leur réutilisation, via l'IR Data Terra et les autres pôles (Theia, Odatis, FormaTerre, Aeris).
+* Favoriser la cohérence avec les efforts nationaux, européens et internationaux relatifs à l’accès et à l’exploitation des données de recherche sur la biodiversité, à la promotion de produits et services.
 |Discipline=Sciences & Technologies, Vie & Santé
 |SousDisciplineSciences&Technologies=PE10 Sciences du Système Terre
 |SousDisciplineVie&Sante=LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution
 |Thematique=Biodiversité, Terre solide et environnement, Système Terre et environnement
-|Relation=AllEnvi, GBIF France, INPN, Phenome-Emphasis France, eLTER-France RZA, SINP, PatriNat, DATA TERRA, SIE, SIMM, SIB, e-RECOLNAT, FRB, AnaEE-France
+|Relation=GBIF France, INPN, Phenome-Emphasis France, ELTER-France RZA, SINP, DoHNEE, PatriNat, DATA TERRA, ODATIS, Theia, Aeris, FormaTerre, Dinamis, Recherche Data Gouv, SIE, SIMM, SIB, RECOLNAT, FRB, AnaEE-France, FORESTT, PREZODE, GAIA DATA
-|PorteeInternationale=GEO BON;https://geobon.org,iBOL;https://ibol.org,LifeWatch ERIC;https://www.lifewatch.eu,Knowledge Network for Biocomplexity;https://knb.ecoinformatics.org,OCEANOMICS;http://www.oceanomics.eu/,Consortium IndexMed;http://www.indexmed.eu/,GBIF;https://www.gbif.org,GO FAIR;https://www.go-fair.org,RDA;https://www.rd-alliance.org,DataOne;https://www.dataone.org
+|PorteeInternationale=GEO BON;https://geobon.org,iBOL;https://ibol.org,EOSC;https://eosc.eu/,OFVi;https://www.oneforestvision.org/,LifeWatch ERIC;https://www.lifewatch.eu,GBIF;https://www.gbif.org,GO FAIR;https://www.go-fair.org,RDA;https://www.rd-alliance.org,DataOne;https://www.dataone.org
 }}
-[[Catégorie:Feuille de route nationale des Infrastructures de recherche]] [[Catégorie:IR]]
+[[Catégorie:Catalogue CNRS Écologie & Environnement]]
- [[Catégorie:Catalogue CNRS Écologie & Environnement]]