GeT

  GeT

Type de service	Plateforme d'acquisition
Statut	En production
Nom développé	Génome et Transcriptome
Autres noms	Plateforme GeT, GeT-PlaGe
URL	https://get.genotoul.fr
Contact	get@genotoul.fr
Localisation	Toulouse
Structure d'appartenance	GenoToul, France Génomique, INRAE Genomics
Tutelles	INRAE, Inserm, INSA Toulouse

Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :

Planification

Collecte

Analyse

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GeT, plateforme technologique de pointe localisée à Toulouse, met à disposition de la communauté scientifique publique et privée les outils et l’expertise dans les domaines de la génomique et de la transcriptomique. Rattachée au GIS GenoToul, elle a pour missions :

• Proposer un service adapté aux projets de

1. Séquençage nouvelle génération (NGS) haut débit ou séquençage Sanger
2. Transcriptomique
3. Génotypage
4. Analyses bioinformatiques et statistiques de données biologiques

• Conseiller, former et animer un réseau scientifique
• Procurer aux utilisateurs les outils nécessaires, les plus performants
• Répondre au mieux aux attentes des laboratoires publics et privés.

GeT est répartie en quatre sites distribués sur la région toulousaine, proches des communautés scientifiques de prédilection, tout en assurant une ouverture aux laboratoires nationaux : Get-Biopuces (INSA Toulouse), GeT-PlaGe (INRAE Castanet-Tolosan), GeT-Santé (Inserm Toulouse Rangueil) et GeT-TRiX (INRAE Saint-Martin du Touch)

Domaines scientifiques :Vie & Santé

LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions; LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes Thématique et/ou mots clés :

• Génomique
• Transcriptomique
• Cellule unique
• Séquençage de génome
• Séquençage ARN et microARN
• PCR quantitative
• Microarray
• Épigénétique
• Métagénomique
• Génotypage

Type de données :Données génomiques, Données transcriptomiques

Communauté d'utilisateurs : Communauté scientifique publique et privée Usagers et bénéficiaires :Chercheurs (public et privé)

Conditions d'usage : Plusieurs mode d'accès sont proposés : accès en collaboration ou partenariat, accès pour les entreprises, accès accompagné ou accès en autonomie.

Conditions tarifaires :

Certification/Label :IBiSA (http://www.ibisa.net/plateformes/)

ISO 9001:2015 (https://get.genotoul.fr/qualite/)

NFX 50-900:2016 (https://get.genotoul.fr/qualite/)

Conditions générales d'utilisation :

GeT est en lien avec les services et structures

INRAE Genomics, PGTB, EPGV, CNRGV

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
France Génomique	GeT LIGAN-PM GenomiqueENS TGML MGX GenomEast GENOMAX UCA Genomix PSI2BC Biomics ICGex
GenoToul	GeT GenoToul Bioinfo Anexplo MetaToul
INRAE Genomics	GeT Gentyane EPGV PGTB CNRGV INRAE Genomics

Groupement d'intérêt scientifique

Le GIS Infrastructure en Biologie Santé et Agronomie a pour vocation de structurer et de financer les infrastructures de recherche en sciences de la vie, en mutualisant leurs moyens.

2015 Systèmes de management de la qualité

Système de management intégrant un système de management de la qualité ISO 9001:2015 concernant les exigences pour les plateformes technologiques de recherche en sciences du vivant