CID

  CID

Type de service	Entrepôt de données
	Caractéristiques de l'entrepôt Type d’entrepôt Disciplinaire, Institutionnel, Lié à un projet ou un équipement etc Type de restriction Réservé à une institution/ un projet/ un instrument, Soumis à la création d'un compte Hébergement des données France Identifiant pérenne Identifiants fournis Identifiants utilisés Formats de fichiers acceptés Schéma de métadonnées Licence des jeux de données Conditions d'accès aux données Modération / Curation Volumétrie maximale définie Politique de conservation des données Interopérabilité machine Versioning
Statut	En production
Nom développé	Cochin Image Database
Autres noms
URL	https://institutcochin.fr/imagic/cochin-image-database
Contact	CID.u1016@inserm.fr
Localisation	Paris
Structure d'appartenance	Institut Cochin
Tutelles	Université Paris Cité, CNRS, Inserm

Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :

Analyse

Documentation

Stockage

Conservation

Exposition

Réutilisation

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La CID, Cochin Image Database est une solution de gestion multi-plates-formes des données omiques et d’imageries. En lien avec les différentes plateformes de l'Institut Cochin, cette solution permet aux chercheurs internes et externes à l'unité d'importer, sauvegarder, archiver, partager, trier et lancer directement des traitements en ligne via une simple interface web depuis n'importe quel ordinateur (100% cloud de l'Institut Cochin). Aujourd'hui, cela représente plus de 143 000 images avec 704 comptes dans 137 équipes, dont la moitié sont externes.

Le CID prend en charge toutes les étapes du cycle de vie des données, de la production des données à leur publication (attribution de DOI aux datasets liés à une publication).

Les codes sources sont déposés sur GitLab et l'assocation OpenCID a été créée pour déployer la CID sur d'autres sites.

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Since 2015, this solution has been used by numerous researchers inside and outside the unit to import, save, archive, share, sort and directly launch online processing via a simple web interface from any computer (100% Institut Cochin cloud). Today, this represents over 143,000 images with 704 accounts in 137 teams, half of which are external. Optimize : Machine use, storage space, data sovereignty, datasecurity Reduce : computer viruses, the number of copies

The CID handles all stages of the DMP data management plan.

Domaines scientifiques :Sciences & Technologies, Vie & Santé

PE6 Sciences informatiques et informatique LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions; LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes; LS3 Biologie cellulaire, développement, cellules souches et régénération; LS4 Physiologie de la santé, de la maladie et du vieillissement; LS5 Neurosciences et troubles du système nerveux; LS6 Immunité, infection et immunothérapie; LS7 Prévention, diagnostic et traitement des maladies humaines; LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution; LS9 Biotechnologie et ingénierie des biosystèmes Thématique et/ou mots clés :

• Imagerie
• Cytométrie
• Protéomique

Type de données :

Communauté d'utilisateurs : Usagers et bénéficiaires :

Conditions d'usage :

Conditions tarifaires :

Certification/Label :

Conditions générales d'utilisation :

CID est en lien avec les services et structures

IMAG'IC, CYBIO, HIST'IM, GENOM'IC, PIV, PROTEOM'IC, PIME, OpenCID, RTMFM

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
Institut Cochin	IMAG'IC CYBIO GENOM'IC HIST'IM METABOL'IC PIME PIV PROTEOM'IC CID MOUSET'IC

code unique assigné à un objet de façon permanente (DOI, Handle…).

Ensemble structuré d’informations décrivant, expliquant et localisant une ressource physique ou numérique

autorisation par laquelle l'auteur d’une œuvre de l’esprit concède certains des droits que lui offre le droit d'auteur quant à l'utilisation, à la modification, à la rediffusion et à la réutilisation de l'œuvre.

la curation de données consiste à trier, organiser et mettre en forme un ensemble de données, de manière à le rendre exploitable.

capable de communiquer et d’opérer avec d’autres systèmes d’information.

Digital Object Identifier

data management plan ou plan de gestion de données, document exposant comment seront gérées, diffusées et conservées les données produites au cours d’un projet de recherche.