« Bordeaux Metalobome » : différence entre les versions
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|Description=La '''plateforme Bordeaux Metabolome''' fédère les outils et les savoir-faire pour l’étude du métabolome, du lipidome et la mesure de flux métaboliques | |Description=La '''plateforme Bordeaux Metabolome''' fédère les outils et les savoir-faire pour l’étude du métabolome, du lipidome et la mesure de flux métaboliques. | ||
'''Elle réalise des adaptations et des développements technologiques et conçoit et implémente des stratégies analytiques et outils bioinformatiques dans les domaines métabolome, phénotypage métabolique, lipidomique et fluxome'''. | '''Elle réalise des adaptations et des développements technologiques et conçoit et implémente des stratégies analytiques et outils bioinformatiques dans les domaines métabolome, phénotypage métabolique, lipidomique et fluxome'''. | ||
La Plateforme sert de support aux recherches en génomique fonctionnelle, génétique, pathologie, écophysiologie et biologie intégrative des plantes dans le cadre de collaborations régionales, nationales et internationales | La Plateforme sert de support aux '''recherches en génomique fonctionnelle, génétique, pathologie, écophysiologie et biologie intégrative des plantes''' dans le cadre de collaborations régionales, nationales et internationales. | ||
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* L’établissement et l’interprétation de profils métabolomiques, | * '''L’établissement et l’interprétation de profils métabolomiques''', | ||
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La Plateforme Bordeaux Metabolome accueille de manière personnalisée des étudiants et scientifiques et les forme aux technologies et outils métabolomiques, lipidomiques et de phénotypage métabolique. | La Plateforme Bordeaux Metabolome accueille de manière personnalisée des étudiants et scientifiques et les '''forme aux technologies et outils métabolomiques, lipidomiques et de phénotypage métabolique'''. | ||
Elle propose les équipements suivants : | Elle propose les équipements suivants : | ||
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* Systèmes robotisés de phénotypage métabolique à haut débit en microplaques | * Systèmes robotisés de phénotypage métabolique à haut débit en microplaques | ||
|Discipline=Vie & Santé | |Discipline=Vie & Santé | ||
|Thematique=Génomique fonctionnelle, Génétique, Pathologie, Écophysiologie et biologie intégrative des plantes, Bioinformatique | |SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes; LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution | ||
|TypeDonnee=Profils métabolomiques | |Thematique=Génomique fonctionnelle, Génétique, Pathologie, Écophysiologie et biologie intégrative des plantes, Bioinformatique, Métabolomique | ||
|TypeDonnee=Profils métabolomiques, Matrices biologiques | |||
|Communaute=Etablissements publics et entreprises | |||
|Beneficiaire=Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Doctorants, Ingénieurs, Acteurs du secteur privé | |||
|ConditionUsage=Après un premier contact avec le responsable de l’activité, il est nécessaire de soumettre une demande d’analyse (https://mama-webapp.metabohub.fr). Celle-ci est validée ou non après une étude de faisabilité. La réalisation des analyses se fait soit dans le cadre d’une prestation de service, soit dans le cadre d’une collaboration. Dans certains cas, l’établissement d’une convention de recherche est obligatoire. Les analyses s’effectuent par campagne. Un délai de plusieurs mois peut donc séparer l’acceptation d'un projet de sa réalisation. | |||
|ModeleEconomique=Gratuit | |||
|Certification=ISO 9001:2015; https://www.ibisa.net/certificats/certificat_ISO_11.pdf, | |||
IBiSA; https://www.ibisa.net/plateformes/bordeaux-metabolome-11.html | |||
|Relation=MetaboHUB, Phenome-Emphasis France | |||
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Dernière version du 21 août 2024 à 08:10
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Type de service | Plateforme de calcul |
Statut | En production |
Autres noms | Plateforme Bordeaux Metabolome, |
URL | https://metabolome.u-bordeaux.fr |
Contact | bordeaux-metabolome@inrae.fr |
Localisation | Villenave d’Ornon |
Structure d'appartenance | BFP, LBM (UMR 5200), OENO |
Tutelles | CNRS, INRAE, Université de Bordeaux |
Cycle de vie des données
Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :
Elle réalise des adaptations et des développements technologiques et conçoit et implémente des stratégies analytiques et outils bioinformatiques dans les domaines métabolome, phénotypage métabolique, lipidomique et fluxome.
La Plateforme sert de support aux recherches en génomique fonctionnelle, génétique, pathologie, écophysiologie et biologie intégrative des plantes dans le cadre de collaborations régionales, nationales et internationales.
Elle est notamment utilisée pour :
- L’établissement et l’interprétation de profils métabolomiques,
- Le phénotypage biochimique,
- L’étude des aspects dynamiques du métabolisme,
- L’analyse fonctionnelle du métabolisme des lipides.
La Plateforme Bordeaux Metabolome accueille de manière personnalisée des étudiants et scientifiques et les forme aux technologies et outils métabolomiques, lipidomiques et de phénotypage métabolique.
Elle propose les équipements suivants :
- 2 Spectromètre de RMN (500 et 600 MHz)
- 5 Couplages LC-MS (comprenant LC-HRMS)
- 2 Couplages GC-MS
- 2 Couplages GC-FID
- Chaîne UHPLC-DAD
- Systèmes robotisés de phénotypage métabolique à haut débit en microplaques
Domaines scientifiques :Vie & Santé
LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes; LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution Thématique et/ou mots clés :
- Génomique fonctionnelle
- Génétique
- Pathologie
- Écophysiologie et biologie intégrative des plantes
- Bioinformatique
- Métabolomique
Type de données :Profils métabolomiques, Matrices biologiques
Communauté d'utilisateurs : Etablissements publics et entreprises Usagers et bénéficiaires :Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Doctorants, Ingénieurs, Acteurs du secteur privé
Conditions d'usage : Après un premier contact avec le responsable de l’activité, il est nécessaire de soumettre une demande d’analyse (https://mama-webapp.metabohub.fr). Celle-ci est validée ou non après une étude de faisabilité. La réalisation des analyses se fait soit dans le cadre d’une prestation de service, soit dans le cadre d’une collaboration. Dans certains cas, l’établissement d’une convention de recherche est obligatoire. Les analyses s’effectuent par campagne. Un délai de plusieurs mois peut donc séparer l’acceptation d'un projet de sa réalisation.
Conditions tarifaires : Gratuit
Certification/Label :ISO 9001:2015 (https://www.ibisa.net/certificats/certificat ISO 11.pdf)
IBiSA (https://www.ibisa.net/plateformes/bordeaux-metabolome-11.html)
Conditions générales d'utilisation :
Bordeaux Metalobome est en lien avec les services et structures
MetaboHUB, Phenome-Emphasis France
Structure | Services proposés |
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BFP | Maggot Bordeaux Metalobome |
LBM (UMR 5200) | Bordeaux Metalobome |
OENO | Bordeaux Metalobome |