« Bordeaux Metalobome » : différence entre les versions
Aucun résumé des modifications |
Aucun résumé des modifications |
||
(Une version intermédiaire par le même utilisateur non affichée) | |||
Ligne 8 : | Ligne 8 : | ||
|ContactMel=bordeaux-metabolome@inrae.fr | |ContactMel=bordeaux-metabolome@inrae.fr | ||
|Localisation=Villenave d’Ornon | |Localisation=Villenave d’Ornon | ||
|StructureAppartenance=BFP, LBM (UMR 5200), | |StructureAppartenance=BFP, LBM (UMR 5200), OENO | ||
|Tutelle=CNRS, INRAE, Université de Bordeaux | |Tutelle=CNRS, INRAE, Université de Bordeaux | ||
|PhaseCycleVie=Planification, Analyse, Documentation | |PhaseCycleVie=Planification, Analyse, Documentation | ||
Ligne 47 : | Ligne 47 : | ||
|ConditionUsage=Après un premier contact avec le responsable de l’activité, il est nécessaire de soumettre une demande d’analyse (https://mama-webapp.metabohub.fr). Celle-ci est validée ou non après une étude de faisabilité. La réalisation des analyses se fait soit dans le cadre d’une prestation de service, soit dans le cadre d’une collaboration. Dans certains cas, l’établissement d’une convention de recherche est obligatoire. Les analyses s’effectuent par campagne. Un délai de plusieurs mois peut donc séparer l’acceptation d'un projet de sa réalisation. | |ConditionUsage=Après un premier contact avec le responsable de l’activité, il est nécessaire de soumettre une demande d’analyse (https://mama-webapp.metabohub.fr). Celle-ci est validée ou non après une étude de faisabilité. La réalisation des analyses se fait soit dans le cadre d’une prestation de service, soit dans le cadre d’une collaboration. Dans certains cas, l’établissement d’une convention de recherche est obligatoire. Les analyses s’effectuent par campagne. Un délai de plusieurs mois peut donc séparer l’acceptation d'un projet de sa réalisation. | ||
|ModeleEconomique=Gratuit | |ModeleEconomique=Gratuit | ||
|Certification=ISO 9001:2015; https://www.ibisa.net/certificats/certificat_ISO_11.pdf | |Certification=ISO 9001:2015; https://www.ibisa.net/certificats/certificat_ISO_11.pdf, | ||
IBiSA; https://www.ibisa.net/plateformes/bordeaux-metabolome-11.html | IBiSA; https://www.ibisa.net/plateformes/bordeaux-metabolome-11.html | ||
|Relation=MetaboHUB, Phenome-Emphasis France | |Relation=MetaboHUB, Phenome-Emphasis France | ||
}} | }} |
Version du 31 juillet 2024 à 09:48
![]() | |
---|---|
Type de service | Plateforme de calcul |
Statut | En production |
Autres noms | Plateforme Bordeaux Metabolome, |
URL | https://metabolome.u-bordeaux.fr |
Contact | bordeaux-metabolome@inrae.fr |
Localisation | Villenave d’Ornon |
Structure d'appartenance | BFP, LBM (UMR 5200), OENO |
Tutelles | CNRS, INRAE, Université de Bordeaux |
Cycle de vie des données
Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :
Elle réalise des adaptations et des développements technologiques et conçoit et implémente des stratégies analytiques et outils bioinformatiques dans les domaines métabolome, phénotypage métabolique, lipidomique et fluxome.
La Plateforme sert de support aux recherches en génomique fonctionnelle, génétique, pathologie, écophysiologie et biologie intégrative des plantes dans le cadre de collaborations régionales, nationales et internationales.
Elle est notamment utilisée pour :
- L’établissement et l’interprétation de profils métabolomiques,
- Le phénotypage biochimique,
- L’étude des aspects dynamiques du métabolisme,
- L’analyse fonctionnelle du métabolisme des lipides.
La Plateforme Bordeaux Metabolome accueille de manière personnalisée des étudiants et scientifiques et les forme aux technologies et outils métabolomiques, lipidomiques et de phénotypage métabolique.
Elle propose les équipements suivants :
- 2 Spectromètre de RMN (500 et 600 MHz)
- 5 Couplages LC-MS (comprenant LC-HRMS)
- 2 Couplages GC-MS
- 2 Couplages GC-FID
- Chaîne UHPLC-DAD
- Systèmes robotisés de phénotypage métabolique à haut débit en microplaques
Domaines scientifiques :Vie & Santé
LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution; LS9 Biotechnologie et ingénierie des biosystèmes Thématique et/ou mots clés :
- Génomique fonctionnelle
- Génétique
- Pathologie
- Écophysiologie et biologie intégrative des plantes
- Bioinformatique
Type de données :Profils métabolomiques, Matrices biologiques
Communauté d'utilisateurs : Etablissements publics et entreprises Usagers et bénéficiaires :Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Doctorants, Ingénieurs, Acteurs du secteur privé
Conditions d'usage : Après un premier contact avec le responsable de l’activité, il est nécessaire de soumettre une demande d’analyse (https://mama-webapp.metabohub.fr). Celle-ci est validée ou non après une étude de faisabilité. La réalisation des analyses se fait soit dans le cadre d’une prestation de service, soit dans le cadre d’une collaboration. Dans certains cas, l’établissement d’une convention de recherche est obligatoire. Les analyses s’effectuent par campagne. Un délai de plusieurs mois peut donc séparer l’acceptation d'un projet de sa réalisation.
Conditions tarifaires : Gratuit
Certification/Label :ISO 9001:2015 (https://www.ibisa.net/certificats/certificat ISO 11.pdf)
IBiSA (https://www.ibisa.net/plateformes/bordeaux-metabolome-11.html)
Conditions générales d'utilisation :
Bordeaux Metalobome est en lien avec les services et structures
MetaboHUB, Phenome-Emphasis France
Structure | Services proposés |
---|---|
BFP | Maggot Bordeaux Metalobome |
LBM (UMR 5200) | Bordeaux Metalobome |
OENO | Bordeaux Metalobome |