URGI
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| Nom développé | Unité Ressources Génomique-Info |
| Autres noms | URGI, US 1164 |
| URL | https://urgi.versailles.inrae.fr |
| Tutelles | INRAE |
| Identifiants | |
| RNSR | 200217796P |
| Identifiant dans un autre catalogue | https://www.ifb-elixir.fr/ifb-elixir-fr/nos-plateformes/urgi/ (IFB), https://www.ibisa.net/plateformes/plateforme-bioinformatique-plantes-plantbioinfopf-117.html (IBiSA), https://www.universite-paris-saclay.fr/laboratoires/unite-de-recherche-genomique-info-urgi (Université Paris Saclay), https://www.france-genomique.org/plateformes-et-equipements/plateforme-bio-informatique-urgi-versailles/ (France Génomique) |
| Localisation | Versailles |
| Type de service | Plateforme d'accès |
|---|---|
| Statut | En production |
| URL | https://urgi.versailles.inrae.fr |
| Contact | urgi-contact@inrae.fr |
| Structure d'appartenance | URGI, IFB, France Génomique, Université Paris-Saclay |
Cycle de vie des données
Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :
L'URGI est certifiée ISO 9001:2015 et fait partie de l'Institut Français de Bioinformatique (IFB), le noeud français d'ELIXIR, l'infrastructure européenne de bioinformatique pour les sciences de la vie. C'est également l'une des quatre plateformes qui forme BioinfOmics, l'infrastructure de recherche en bioinformatique de l'INRAE.
L’URGI propose une gamme de services pour l'accompagnement de projets, avec des solutions sur mesure et une expertise reconnue :
- Conseils et ressources pour la gestion et l'intégration de données selon les principes FAIR, pour assurer leur accessibilité, interopérabilité et réutilisation
- Développement de portails fédératifs pour faciliter l'accès et l'exploitation de données mondiales (FAIDARE, WheatIS Data Discovery, RARe Data Discovery)
- Analyse avancée des données génomiques avec des outils spécialisés, comme REPET et panREPET.
Domaines scientifiques :Vie & Santé
LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes Thématique et/ou mots clés :
- Biologie
- Informatique
- Plateforme de bioinformatique
- Plantes
Type de données :Données génétiques, données phénomiques, données génomiques, éléments transposables
Périmètre de communauté : thématique, public, privé, national, international
Communauté d'utilisateurs : Communauté scientifique d'INRAE et ses partenaires
Usagers et bénéficiaires :Chercheurs, bioinformaticiens
Politiques : Politique de données
Conditions d'usage : L'URGI propose différents services dont le contour et les conditions d'accès sont décrits sur son site web :
- gestion et publication de données FAIR : https://urgi.versailles.inrae.fr/Data-Services/Services-offers
- fédérations de données : https://urgi.versailles.inrae.fr/Data-Services/Services-offers
- annotation d'éléments transposables : https://urgi.versailles.inrae.fr/Annotation/Service
Il est également possible de solliciter l'URGI par email à l’adresse urgi-contact@inrae.fr.
Conditions tarifaires :
Certification/Label :ISO 9001:2025 (https://urgi.versailles.inrae.fr/Quality)
IBiSA ([https://www.ibisa.net/plateformes/plateforme-bioinformatique-plantes-plantbioinfopf-117.html%0ACNOC_INRAE https://www.ibisa.net/plateformes/plateforme-bioinformatique-plantes-plantbioinfopf-117.html CNOC INRAE])
Conditions générales d'utilisation : https://urgi.versailles.inrae.fr/Platform/General-Terms-of-Use
URGI est en lien avec les services et structures
IFB, ELIXIR, France Génomique, BioinfOmics, INRAE, Université Paris-Saclay, RARe, Phenome-Emphasis France, EMPHASIS
Portée internationale de URGI
WheatIS (https://www.wheatinitiative.org/wheatis)
IWGSC (https://www.wheatinitiative.org/wheatis)
TEHub (https://tehub.org/)
MIAPPE (https://www.miappe.org/)
BrAPI (https://brapi.org/)
AgroServ (https://agroserv.eu/)
PheNet (https://www.phenet.eu/en)
Pro-Wild (https://www.pro-wild.eu/fr/index.html)
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