« TEFOR Paris Saclay » : différence entre les versions

De Cat OPIDoR
Aucun résumé des modifications
Aucun résumé des modifications
Ligne 4 : Ligne 4 :
|TypeService=Plateforme d'acquisition
|TypeService=Plateforme d'acquisition
|StatutService=En production
|StatutService=En production
|NomAlternatif=Trangénèse pour les Etudes Fonctionnelles chez les ORganismes modèles  Paris-Saclay, TPS,
|NomAlternatif=Trangénèse pour les Etudes Fonctionnelles chez les ORganismes modèles  Paris-Saclay, TPS
|UrlService=https://tps.tefor.net/
|UrlService=https://tps.tefor.net/
|ContactMel=https://tps.tefor.net/#contact
|ContactMel=https://tps.tefor.net/#contact
Ligne 15 : Ligne 15 :
}}
}}
{{Service
{{Service
|Description=En collaboration avec ses partenaires au sein de l'infrastructure TEFOR, '''Tefor Paris Saclay (TPS)''' '''développe des méthodes de phénotypage en 3D d’échantillons transparisés et marqués'''. Avec d’autres partenaires dans TEFOR et des collaborateurs internationaux, le TPS développe des stratégies d’archivage des volumes imagés dans des bases de données, notamment sous forme d’atlas digitaux. Ces stratégies sont développées en parallèle chez le poisson-zèbre et la drosophile et coordonnées par le TPS.  Il s’attache également à développer ou adapter des solutions de visualisation des données 3D de grandes tailles gratuites et faciles d’utilisation. Le TPS propose des services standards de phénotypage intégral de larves de poissons-zèbre ou de cerveaux adultes entiers à l’échelle sub-cellulaire ainsi que le service adapté de traitement des données. Il développe des stratégies automatiques d’analyse volumétrique de différents organes par segmentation des volumes d’intérêt pour des projets de criblage à haut contenu.
|Description=TEFOR Paris-Saclay a pour ambition de faciliter l’accès aux organismes modèles aquatiques pour la recherche fondamentale et appliquée. Les modèles développés par TEFOR Paris-Saclay sont les poissons, en particulier le poisson zèbre, et les xénopes.
 
Les services proposés par TPS sont : Hébergement d’animaux, production de lignées d’intérêt par édition du génome, phénotypage par imagerie d’échantillons fixés de grande taille, ainsi qu'un appui pour la gestion et l’analyse de ces données d’images.
 
Sa recherche et développement s'axe sur le raffinement des méthodes d'édition du génome (prime editing). TPS développe aussi des bases de données d'images : atlas avec cerveaux standardisés (modèle poisson zèbre mais aussi drosophile dans le cadre de l'infrastructure TEFOR). TPS s’attache également à développer ou adapter des solutions de visualisation gratuites et faciles d’utilisation d'images 3D de grandes tailles.
 
Elle organise aussi des formations sur les modèles et technologies dont elle est experte. Afin d’être toujours en adéquation avec les besoins de la communauté, elle mène une recherche technologique multidisciplinaire dynamique.
|Discipline=Vie & Santé
|Discipline=Vie & Santé
|SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes; LS4 Physiologie de la santé, de la maladie et du vieillissement; LS9 Biotechnologie et ingénierie des biosystèmes
|SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes; LS4 Physiologie de la santé, de la maladie et du vieillissement; LS9 Biotechnologie et ingénierie des biosystèmes
|Thematique=poisson-zèbre
|Thematique=poisson zèbre, autres poissons modèles, modèles aquatiques, zootechnie, édition du génome, production de lignées d'intérêt, imagerie, reconstitution 3D, gestion de données
|TypeDonnee=Images, reconstitution 3D
|Certification=IBiSA;https://www.ibisa.net/trouver-plateforme/
|Certification=IBiSA;https://www.ibisa.net/trouver-plateforme/
}}
}}
[[Catégorie:Annuaire CNRS]][[Catégorie:Annuaire CNRS-INSB]]
[[Catégorie:Annuaire CNRS]][[Catégorie:Annuaire CNRS-INSB]]

Version du 6 mai 2022 à 10:20

TEFOR Paris Saclay
Type de service Plateforme d'acquisition
Statut En production
Autres noms Trangénèse pour les Etudes Fonctionnelles chez les ORganismes modèles Paris-Saclay, TPS
URL https://tps.tefor.net/
Contact https://tps.tefor.net/#contact
Localisation Saclay
Structure d'appartenance TEFOR, Celphedia
Tutelles CNRS, Université Paris-Saclay, INRAE
Identifiants
RNSR 201922946N


Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :


Chargement de la carte...



TEFOR Paris-Saclay a pour ambition de faciliter l’accès aux organismes modèles aquatiques pour la recherche fondamentale et appliquée. Les modèles développés par TEFOR Paris-Saclay sont les poissons, en particulier le poisson zèbre, et les xénopes.

Les services proposés par TPS sont : Hébergement d’animaux, production de lignées d’intérêt par édition du génome, phénotypage par imagerie d’échantillons fixés de grande taille, ainsi qu'un appui pour la gestion et l’analyse de ces données d’images.

Sa recherche et développement s'axe sur le raffinement des méthodes d'édition du génome (prime editing). TPS développe aussi des bases de données d'images : atlas avec cerveaux standardisés (modèle poisson zèbre mais aussi drosophile dans le cadre de l'infrastructure TEFOR). TPS s’attache également à développer ou adapter des solutions de visualisation gratuites et faciles d’utilisation d'images 3D de grandes tailles.

Elle organise aussi des formations sur les modèles et technologies dont elle est experte. Afin d’être toujours en adéquation avec les besoins de la communauté, elle mène une recherche technologique multidisciplinaire dynamique.


Domaines scientifiques :Vie & Santé


LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes; LS4 Physiologie de la santé, de la maladie et du vieillissement; LS9 Biotechnologie et ingénierie des biosystèmes Thématique et/ou mots clés :

  • poisson zèbre
  • autres poissons modèles
  • modèles aquatiques
  • zootechnie
  • édition du génome
  • production de lignées d'intérêt
  • imagerie
  • reconstitution 3D
  • gestion de données

Type de données :Images, reconstitution 3D

Communauté d'utilisateurs : Usagers et bénéficiaires :


Conditions d'usage :

Conditions tarifaires :

Certification/Label :IBiSA (https://www.ibisa.net/trouver-plateforme/)

Conditions générales d'utilisation :



Services proposés par la structure d'appartenance
StructureServices proposés
CelphediaPHENOMIN-ICS
PHENOMIN-TAAM
PHENOMIN-CIPHE
TEFOR Paris Saclay
TEFOR Fly Facility
TEFOR-TACGENE
AniRA
Chronobiotron
TRIP
SdP
SILABE
MPRC
Anexplo
TEFORTEFOR Paris Saclay
TEFOR Fly Facility
TEFOR-TACGENE