LIGAN-PM

LIGAN-PM

Type de service	Plateforme d'acquisition
Statut	En production
Autres noms	FG LIGAN-PM, Plateforme de séquençage LIGAN, Lille Integrative Genomic Advanced Network Genomic Platform
URL	http://ligan.good.cnrs.fr/
Contact	http://ligan.good.cnrs.fr/informations-pratiques/contact/
Localisation	Lille
Structure d'appartenance	France Génomique
Tutelles	CNRS, Université de Lille

Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :

Collecte

Analyse

Documentation

Stockage

Conservation

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Localisée à l’Institut Européen de Génomique du Diabète (EGID) sur le site du CHRU de Lille, la plateforme lilloise LIGAN-PM est dédiée au séquençage de nouvelle génération (Next Generation Sequencing – NGS) de l’exome, du génome et du transcriptome humain pour une médecine personnalisée, et inclut aussi d’autres technologies de pointe (génotypage, microfluidique…).

La plateforme a développé des protocoles adaptés à la recherche en génétique des maladies humaines. Ceci à des fins de diagnostic étiologique des maladies génétiques rares ou fréquentes et de médecine personnalisée. LIGAN-PM est un outil de collaboration scientifique de haute expertise en génétique humaine et une plateforme de service ouverte aux organismes publics et privés.

L’équipe est constituée de plusieurs groupes : un groupe de biologistes pour le développement et l’application de protocoles, un groupe expérimenté en bioinformatique pour l’analyse des données à l’issue du séquençage, un groupe bio-statistique et un groupe pour le management des ressources informatiques afin de gérer les analyses bioinformatiques et de stoker les données générées pendant la durée du projet, et au-delà.

Domaines scientifiques :Vie & Santé

LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes Thématique et/ou mots clés :

• Plateforme de génomique

Type de données :

Communauté d'utilisateurs : Communautés scientifiques académiques et médicales et laboratoires privés dans le domaine de la génomique. Usagers et bénéficiaires :Chercheur, enseignant-chercheur, médecin

Conditions d'usage : La soumission des projets se fait obligatoirement par l’intermédiaire du portail internet de France Génomique

Conditions tarifaires :

Certification/Label :Mise en place de la certification NF EN ISO 15189 (http://ligan.good.cnrs.fr/qualite/)

Conditions générales d'utilisation :

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
France Génomique	GeT LIGAN-PM GenomiqueENS TGML

Centre National de la Recherche Scientifique