GnpIS

GnpIS

Type de service	Entrepôt de données
Statut	En production
Autres noms	Genetic and Genomic Information System
URL	https://urgi.versailles.inra.fr/gnpis, https://urgi.versailles.inra.fr/Data
Contact	urgi-contact at versailles.inra.fr
Localisation	Versailles
Structure d'appartenance	URGI, PlantBioInfoPF
Tutelles	INRAE
Identifiants
re3data	R3RF6C

Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :

Documentation

Conservation

Exposition

Réutilisation

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GnpIS est un système d’information modulaire interopérable, multi-espèces (plantes et champignons), permettant le stockage et la mise à disposition de données de génomique et de génétique : annotations de génome, cartographie physiques et génétiques (marqueurs, QTL), polymorphismes de séquence issues de reséquençage et de génotypage, génétique d’association entre marqueurs et caractères phénotypiques (GWAS), phénotypage lié à l’environnement (GxE), ressources génétiques (données patrimoniales INRAE venant pour certaines d’entre elles des centres de ressources biologiques).

Domaines scientifiques :Vie & Santé

Génétique, "omiques", bioinformatique et biologie des systèmes« Génétique, "omiques", bioinformatique et biologie des systèmes » n’est pas dans la liste (LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes, LS3 Biologie cellulaire, du développement et régénérative, LS4 Physiologie de la santé, de la maladie et du vieillissement, LS5 Neurosciences et troubles du système nerveux, LS6 Immunité, infection et immunothérapie, LS7 Prévention, diagnostic et traitement des maladies humaines, LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution, LS9 Biotechnologie et ingénierie des biosystèmes, LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions) des valeurs autorisées pour la propriété « Est sous discipline de Vie & Santé ».; Sciences de la vie appliquées, biotechnologie, et ingénierie moléculaire et des biosystèmes« Sciences de la vie appliquées, biotechnologie, et ingénierie moléculaire et des biosystèmes » n’est pas dans la liste (LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes, LS3 Biologie cellulaire, du développement et régénérative, LS4 Physiologie de la santé, de la maladie et du vieillissement, LS5 Neurosciences et troubles du système nerveux, LS6 Immunité, infection et immunothérapie, LS7 Prévention, diagnostic et traitement des maladies humaines, LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution, LS9 Biotechnologie et ingénierie des biosystèmes, LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions) des valeurs autorisées pour la propriété « Est sous discipline de Vie & Santé ». Thématique et/ou mots clés :

Type de données :

Communauté d'utilisateurs : Usagers et bénéficiaires :

Conditions d'usage : L’accès aux données peut être public (par défaut avec une licence CC-BY 4.0) ou données en accès authentifié dans le cadre de projets en collaboration avec la plateforme avant publication.. La durée de conservation des données est déterminée dans les accords consortium ou dans le formulaire de demande d’intégration de données . Les données considérées comme patrimoniales pour l’Institut (ressources génétiques, données phénotypiques) sont conservées de façon permanente.

Conditions tarifaires :

Certification/Label :

Conditions générales d'utilisation :

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
PlantBioInfoPF	GnpIS WheatIS
URGI	PlantBioInfoPF GnpIS WheatIS

capable de communiquer et d’opérer avec d’autres systèmes d’information.