Go@l

Go@l
Type de service	Plateforme d'acquisition
Statut	En production
URL	https://ums-plbs.univ-lille.fr/les-plateformes-constitutives/genomique
Contact	genomique-plbs@univ-lille.fr
Localisation	Lille
Structure d'appartenance	PLBS
Tutelles	Université de Lille, Inserm, CHU de Lille, CNRS, Institut Pasteur de Lille

Page en construction

La plateforme Go@l offre son expertise en étude de faisabilité et en montage de projets d’analyse génomique pour des projets à moyen/haut débit. Elle propose la technologie de séquençage en adéquation avec le projet, sa complexité et en fonction du type d’échantillons. Avec une approche globale ou ciblée, elle assure le suivi et la réalisation des projets de recherche de la qualification des échantillons, de la préparation des librairies et de leurs séquençage, jusqu’à l’analyse bioinformatique et biostatistique de ces données. La plateforme développe son expertise sur les approches suivantes :

Génomique « génomes entiers » : WGS, WES, amplicon-seq, Tn-seq, CGH-arrays.
Transcriptomique : RNA-seq, sRNA-seq, dRNA-seq, NGS-RACE, qRT-PCR, RNA-seq full-length, micro-arrays, DGE, single-cell.
Métagénomique : amplicon-seq ciblé 16S-ITS.

De la réalisation des expérimentations à l’accompagnement des équipes, la plateforme apporte son expertise sur le traitement des données générées :

Assemblage, caractérisation et annotation génomiques, détection et annotation desvariants, étude de transmission mendélienne.
Analyse différentielle d’expression, analyse non supervisée.
Assignation taxonomique, évaluation diversité (α et β), mesure de dysbiose.

La plateforme GO@L comprend deux plateaux spécialisés :

Le plateau Transcriptomics and Applied Genomics (TAG), localisé à l’Institut Pasteur de Lille, est spécialisé dans les applications de microbiologie.
Le plateau de Génomique Fonctionnelle et Structurale (GFS), intégré dans les locaux du Centre de Biologie Pathologie Génétique du CHU de Lille, développe son expertise notamment au service de la génomique humaine associée à des pathologies ciblées (cancers, maladies neuro-dégénératives...) et l'étude de modèles animaux.

Domaines scientifiques :Vie & Santé

LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes Thématique et/ou mots clés :

Type de données :

Usagers et bénéficiaires :

Conditions d'usage :

Conditions tarifaires :

Certification/Label :IBiSA (https://www.ibisa.net/plateformes/genomic-at-lille-go-l-625.html)

Conditions générales d'utilisation :

Go@l est en lien avec les services et structures

France Génomique

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
PLBS	Transcriptomique et Génomique Appliquée Bilille Go@l