TGML

TGML
Type de service	Plateforme de calcul
Statut	En production
Autres noms	Transcriptomique et génomique Marseille Luminy
URL	https://tagc.univ-amu.fr/en/resources/transcriptomic-genomic-platform-marseille-luminy
Contact	denis.puthier@univ-amu.fr, beatrice.loriod@inserm.fr
Localisation
Structure d'appartenance	TAGC
Tutelles	INSERM, Aix-Marseille Université

La plateforme TGML propose son expertise pour l'analyse de différents types de projets liés au séquençage à haut débit. Elle offre une large palette d’outils expérimentaux et bioinformatiques pour l’étude du transcriptome et de la génomique fonctionnelle. Ses ingénieurs assurent le traitement et l’analyse de puces à ADN, la construction de librairies, le séquençage et les analyses de données (primaires et secondaires).

Les services proposés sont :

Construction de librairies de séquençage ChIP-Seq
Construction de librairies de séquençage RNA-Seq : sélection poly(A) et ribo-déplétion
Construction de librairies de séquençage miRNA-Seq
Construction de librairies avec le Chromium Controller : single cell et linked reads
Séquençage,
Réalisation et analyse de puces à ADN : ARN total et petits ARNs
Réalisation d’analyses bioinformatiques.

Domaines scientifiques :Sciences & Technologies, Vie & Santé

PE6 Sciences informatiques et informatique LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes Thématique et/ou mots clés :