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Le service '''ADOO''', '''Atelier de la Donnée d’Occitanie Ouest''' a été labellisé '''Atelier de la donnée'''. Il propose un dispositif complet d’assistance et d’accompagnement des équipes de recherche de la métropole toulousaine sur l’ensemble des volets concernant '''la gestion des données, des codes et des logiciels de la recherche'''.
Les services proposés sont :
* La '''gestion raisonnée des données de la recherche, algorithmes et codes sources'''
* L'accompagnement à la '''rédaction de plan de gestion de données''' : formation, conseils, aide à la création ou demande de relecture
* L'orientation sur le '''stockage des données'''
* L'accompagnement au '''dépôt et au partage''' : formation, conseil, aide au dépôt et au partage
* La coordination de l’accompagnement autour de la mise en réseau et de l’animation des compétences pluri-métiers
* La mise à disposition d'un '''point d'entrée unique''' pour accéder à l'aide de proximité et pour formuler des demandes
Les partenaires impliqués dans l'atelier de la donnée sont Université Toulouse Capitole, Université Toulouse- Jean Jaurès et Université Toulouse III–Paul Sabatier, Toulouse INP, Toulouse School of Economics, IMT Mines Albi, INSA, INU Champollion, ISAE-SUPAERO, ENAC, ENSFEA, CNRS, ONERA ainsi que le Mésocentre CALMIP, le Data Center Drocc, la MSHS-Toulouse en lien avec le pôle qualité des données de l'IR* Huma-Num et la PUD-T. +
Le service '''l'Atelier de la donnée de la Seine-Saint-Denis (ADSSD)''', porté par l’Université Paris 8 (SCD Université Paris 8), propose des services aux chercheurs sous la forme d’un guichet unique.
Les accompagnements proposés sont :
* Un suivi personnalisé des chercheurs de Paris 8 sur les données de la recherche
* Un accompagnement au dépôt des données et à la gestion des projets de la recherche
* Un accompagnement dans la rédaction d’un '''plan de gestion des données''' (Data Management Plan)
Dans ce cadre, ils ont élaboré un modèle de PGD [https://dmp.opidor.fr/template_export/1618280375.pdf DMP - Université Paris 8 Vincennes-Saint-Denis] à l’aide de l’outil DMP OPIDoR.
ADSSD fait partie des '''projets d’ateliers de la donnée en cours de labellisation''' par [[Recherche Data Gouv]]. +
Le laboratoire Architecture et Fonction des Macromolécules Biologiques, AFMB, est un centre de biologie structurale. Les thématiques des équipes de recherche sont : Complexes Macromoléculaires Viraux ; Désordre Structural et Reconnaissance Moléculaire ; Glycobiologie et Neurobiologie Structurales ; Glycogénomique ; Interactions hôte-pathogène ; Réplicases Virales : Structure Mécanisme et Drug-Design. L'objectif de ces recherches est d'acquérir une connaissance détaillée de la structure à l’échelle moléculaire et de la fonction des protéines ou assemblages macromoléculaires en se basant sur des approches pluridisciplinaires (bioinformatique, génie génétique, biochimie, biophysique, chimie et biologie structurale). L’AFMB a développé trois plateformes technologiques labellisées IBiSA (Bioinformatique CAZy, Biologie Structurale, Plateforme de Criblage Marseille-Luminy), une collection de ressources biologiques (Biobanque de produits dérivés viraux) et un service pour la production d’anticorps à domaine unique (Sélection et production de VHH/nanobodies de camélidés). +
L''''Institut Amélioration Génétique et Adaptation des Plantes méditerranéennes et Tropicales''', '''AGAP''', cherche à comprendre les facteurs du développement des plantes et de leur adaptation aux contraintes environnementales, analyse l'organisation et la diversité des génomes et étudie l'agrobiodiversité.
Cette UMR mobilise et intègre ressources et connaissances sur :
*l’organisation et la diversité des génomes ;
*la gestion et la valorisation de l’agro-biodiversité ;
*les bases génétiques et fonctionnelles du développement et de l’adaptation à l’environnement ainsi que de la qualité des produits ;
*l’intégration des données et la modélisation (des plantes en peuplement) pour l’aide à la définition d’idéotypes variétaux ;
*les méthodologies les plus récentes de phénotypage et de génotypage ;
*l’intégration des connaissances vers l’innovation variétale et les méthodes de sélection innovantes. +
L’infrastructure de recherche distribuée '''AGATA''', '''Advanced GAmma Tracking Array''', est un projet européen pour construire, maintenir et exploiter un nouveau type de '''multidétecteur de photons au Germanium''' ultra pur basé sur le concept de tracking gamma (trajectographie gamma).
AGATA est un détecteur mobile qui permet de sonder la structure du noyau atomique produit dans différentes réactions nucléaires induites par des faisceaux d’ions stables et radioactifs.
La conception d’AGATA permet qu’il soit itinérant afin de l’exploiter auprès des meilleures installations européennes de faisceaux relativistes (comme à [[FAIR]], Allemagne) ou de faisceaux exotiques du [[GANIL]] ou du Laboratoire National de Legnaro (Italie) pour des mesures de haute précision.
Les codes sources produits par l’infrastructure sont ouverts sur une forge logicielle https://gitlab.in2p3.fr/IPNL_GAMMA. Les données validées et décrites sont publiées sur un entrepôt de données https://cc.in2p3.fr. +
La '''plateforme des données de la recherche AGORHA''' donne un accès unifié aux '''bases de données''' produites par l’'''INHA et ses partenaires'''. Ces données sont issues de programmes de recherche scientifique en '''histoire de l’art et archéologie'''. La plateforme se développe continuellement, témoignant de la diversité des problématiques de ces disciplines.
Les données produites sont organisées dans des '''notices''' décrivant des œuvres, des personnes et organismes, des '''références bibliographiques et d’archives''', des '''collections''' et des '''événements'''. Ces notices sont enrichies collaborativement. L’éditorialisation (articles scientifiques, parcours thématiques, visualisations de données…) facilite la navigation pour tous les publics, amateurs ou spécialistes.
Le périmètre des données exposées dans AGORHA suit les contours des programmes de recherche mis en œuvre par l’INHA et ses partenaires. La vocation d’AGORHA n’est pas d’atteindre l’exhaustivité des connaissances en histoire de l’art et archéologie mais d’être une plateforme de données de référence conforme aux standards numériques d’ouverture et de partage de la science. +
L''''ORE AgrHyS''' est un '''Observatoires de Recherche en Environnement''' soutenu par INRAE. Il a pour objectif d’étudier les temps de réponse des flux hydrogéochimiques à l'évolution des agro-hydrosystèmes (les hydrosystèmes sous influence de l’activité agricole).
Les observations et mesures réalisées sur les sites de l’ORE sont hydrologiques, hydrochimiques, météorologiques, agronomiques et pédologiques. Les observations hydrologiques et hydrochimiques sont réalisées dans la rivière, dans la nappe, dans l’eau du sol et dans la pluie.
Les données de l’ORE AgrHyS concernent :
*l’hydrologie (pluie, EPP, débit, piézométrie…),
*la qualité de l’eau de rivière, du sol, de nappe et de pluie (paramètres physico-chimiques, concentrations chimiques),
*des données spatiales sur l’occupation du sol (parcellaire, pratiques culturales) et sur le milieu physique (sol, géologie, topographie).
Les données de l'ORE AgrHyS sont exploitées dans une base de données nommée '''BDDAgrhys'''. Elles peuvent être visualisées et téléchargées grâce au grapheur '''VIDAE'''.
Elles sont aussi intégrées à l'Infrastructure de Données Spatialisées GéoSAS ce qui permet d'y accéder également :
*par le [http://Les%20données%20de%20l’ORE%20AgrHyS%20concernent%20%20%20%20%20%20l’hydrologie%20(pluie,%20EPP,%20débit,%20piézométrie…),%20%20%20%20%20la%20qualité%20de%20l’eau%20de%20rivière,%20du%20sol,%20de%20nappe%20et%20de%20pluie%20(paramètres%20physico-chimiques,%20concentrations%20chimiques),%20%20%20%20%20des%20données%20spatiales%20sur%20l’occupation%20du%20sol%20(parcellaire,%20pratiques%20culturales)%20et%20sur%20le%20milieu%20physique%20(sol,%20géologie,%20topographie). catalogue de métadonnées]
*par le [https://www6.inrae.fr/ore_agrhys/Donnees/Le-portail-geographique-de-l-ORE portail géographique de l'ORE]
Observatoire de Recherche en Environnement (ORE) labélisé. +
Les recherches développées à l'UMR Agroécologie visent à progresser dans la connaissance des '''interactions biotiques''' (en particulier '''plantes-plantes''' et '''plantes-microorganismes''') '''au sein des agrosystèmes''' afin de '''concevoir des systèmes de culture innovants respectueux de l’environnement'''. Ainsi, les recherches développées répondent à deux enjeux majeurs qui sont de :
*Analyser, comprendre et agir sur les interactions et régulations au sein des communautés à différentes échelles spatiales et temporelles ;
*Proposer des systèmes de culture innovants permettant d’assurer une production agricole de qualité, en quantité suffisante, tout en respectant la qualité de l’environnement.
*Ces recherches sont conduites à différents niveaux d’intégration (de la molécule à la communauté) et d’échelles spatio-temporelles (microcosme, parcelle, paysage, cycle de culture, rotation,…). Elles mettent en œuvre des expertises complémentaires dans les domaines de l’agronomie, de l’écologie, de biologie, la physiologie et l’écophysiologie, la génétique, la microbiologie, la modélisation.
Plateformes internes de l'UMR :
*GenoSol (conservation et caractérisation génétique de la biodiversité des sols),
*Plateforme de Phénotypage Plantes haut débit (4PMI),
*Centre de microscopie, intégré à la plate-forme fédérative DImaCell,
*Ensemble de ressources biologiques ERB +
L’'''Atelier des Humanités Numériques (AHN)''' regroupe un réseau d’ingénieurs et de chercheurs issus de ces laboratoires et travaillant sur différents projets de corpus numériques.
L’AHN propose également des '''conférences, des formations aux technologies intervenant dans l’édition numérique de corpus ainsi que des ateliers d’entraide sous la forme de séances pratiques informelles'''. Ces formations et ateliers d’entraide sont destinés aux membres des différents laboratoires de l’ENS de Lyon travaillant dans le domaine des SHS et les conférences ou formations élargies sont ouvertes plus globalement au public de l’enseignement supérieur et de la recherche. +
Organisme mondial de « L’atome pour la paix et le développement » au sein de la famille des Nations Unies, l’'''Agence internationale de l'énergie atomique''' ou '''AIEA''', est le '''centre international de la coopération dans le domaine du nucléaire'''. En collaboration avec ses États Membres et ses nombreux partenaires dans le monde, elle œuvre à la promotion de l’utilisation sûre, sécurisée et pacifique des technologies nucléaires. +
L’AIEA fournit des données nucléaires fondamentales destinées aux applications énergétiques et non énergétiques, ainsi que des données atomiques en vue de la recherche sur l’énergie de fusion.
Les données relatives à la structure et à la décroissance nucléaires décrivent les cycles de vie et les modes de désintégration des isotopes instables, ainsi que le spectre des rayonnements émis. Les données ayant trait aux réactions nucléaires décrivent les sections efficaces des processus de collision fondamentaux, par exemple entre un neutron et un noyau, ou entre deux neutrons. Les données atomiques comprennent les sections efficaces de collisions entre électrons, atomes et molécules. L’Agence dispose aussi de données ayant trait aux interactions plasma-matériaux.
l'AIEA a créé des réseaux internationaux de centres de données atomiques et nucléaires pour permettre un degré élevé d’harmonisation des activités des grands centres de données à travers le monde. +
L’unité mixte de recherche '''AIM''' ('''Astrophysique, Interprétation, Modélisation''' UMR CEA-CNRS-Université Paris Cité) réalise et exploite des instruments installés sur les grands télescopes ou bien embarqués sur satellites dans l’espace dans le cadre des missions spatiales ou bilatérales. AIM a accès aux plus grands ordinateurs d’Europe pour ses simulations numériques basées sur l'analyse « multi-échelle » (de l'échelle des planètes aux amas de galaxies) qui permettent de retracer la structuration de l’univers au fil du temps. Le laboratoire s’appuie sur une expertise technique pointue dans le domaine de l’architecture système, de la qualité, de l’électronique et des spectro-imageurs spatiaux. +
'''ALICE''' - '''A Large Ion Collider Experiment''' - est un '''détecteur spécialisé dans la physique des ions lourds installé sur l’anneau du Grand collisionneur de hadrons (LHC)'''. Il a été conçu pour étudier les propriétés physiques de la matière soumise à l’interaction forte, à des densités d’énergie extrêmes auxquelles une phase de la matière appelée plasma quarks-gluons se forme.
La collaboration ALICE étudie le plasma quarks-gluons pendant qu’il se dilate et se refroidit, observant comment il donne progressivement naissance aux particules qui constituent la matière de notre univers.
Pour étudier le plasma quarks-gluons, la collaboration ALICE utilise le détecteur ALICE, qui pèse 10 000 tonnes et mesure 26 mètres de long, 16 mètres de haut et 16 mètres de large. Celui-ci est installé dans une vaste caverne située à 56 mètres sous terre, à proximité du village de Saint-Genis-Pouilly (France), où il reçoit les faisceaux du LHC. +
L'équipe-projet ALMAnaCH (Automatic Language Modelling and Analysis & Computational Humanities) de l’Inria est une équipe pluridisciplinaire en intelligence artificielle (IA) dédiée aux domaines du Traitement Automatique des Langues (TAL) et des Humanités Numériques (HN), se situant à la croisée de l'informatique théorique, de l'apprentissage automatique et de la linguistique. +
Démarré en 2002, le projet '''AMMA''', '''Analyses Multidisciplinaires de la Mousson Africaine''', est '''un programme de recherche international et interdisciplinaire''' qui étudie la variabilité de la Mousson de l’Afrique de l’Ouest et ses impacts sur les populations. Des chercheurs d’Afrique, d’Europe et des États-Unis se sont regroupés pour étudier les questions primordiales posées par ces enjeux.
En 2010, il a été poursuivi sous forme d’une seconde phase AMMA-2 d’une durée de 10 ans, mettant l’accent sur la prévision, les applications et la formation. +
AMMA-CATCH-DB est le '''portail d'accès aux données et l'entrepôt de données de l'Observatoire éco-hydro-météo en Afrique de l'Ouest'''.
'''AMMA-CATCH, Observatoire hydrologique, écologique et météorologique de long terme en Afrique de l’Ouest''', est un Service National d’Observation (SNO) qui fait partie de l’Infrastructure de Recherche [[OZCAR]]. AMMA-CATCH vise à documenter sur le long terme les évolutions climatiques, hydrologiques et écologiques en Afrique de l’Ouest. Il s’appuie sur trois sites densément instrumentés, certains fonctionnant depuis le milieu des années 1980 sur la partie sahélienne de l’observatoire. La superficie de ces trois sites est comprise entre 10000 et 25000 km² ; ils sont étagés en latitude de manière à échantillonner les gradients éco-climatiques caractéristiques de la région.
La base de données AMMA-CATCH-DB inventorie et diffuse les données et les produits de l’observatoire afin d’en faciliter l’accès à la communauté scientifique.
Elle comprend :
*les données directement collectées sur les sites de l’observatoire et celles qui en dérivent
*les produits spatialisés à valeur ajoutée élaborés par les équipes AMMA-CATCH à partir de données ponctuelles ou provenant d’autres sources. +
L’Unité Mixte de Recherche AMURE ('''Aménagement des Usages des Ressources et des Espaces marins et littoraux''') est un centre de recherche et de formation pluridisciplinaire en sciences sociales et humaines appliquées à la mer, notamment en économie, droit public, droit privé, histoire du droit, sociologie, anthropologie et psychologie.
L’activité de recherche au sein de l’UMR AMURE couvre l’analyse et l’évaluation économique et juridique des politiques publiques et des institutions dans les domaines du développement des territoires et des activités maritimes, de l’exploitation des ressources et de la conservation des écosystèmes marins et côtiers. L’activité scientifique est organisée en 4 axes :
* Axe A : Développement et durabilité des activités maritimes ;
* Axe B : Appropriation et responsabilité ;
* Axe C : Socio-écosystèmes, territoires & stratégies d’aménagement ;
* Axe transverse : Pôle observation et données maritimes.
L’UMR AMURE est partenaire du [https://www.gis-hommer.org/fr GIS HomMer], du [http://www.histoire-sciences-mer.org/ GIS Histoire et Sciences de la mer], du [https://www.marsouin.org/ GIS Marsouin] et du [https://gdr-emr.cnrs.fr/ GdR Énergies Marines Renouvelables] (EMR). +
La '''base de données internationale ANISEED, Ascidian Network for In Situ Expression and Embrylogical Data''', permet une représentation du développement embryonnaire de l'ascidie au niveau du génome (séquences cis-regulatrices, expressions géniques, annotations de protéines), de la cellule (morphologie, destin, induction, lignée) ou de l’embryon complet (anatomie, morphogenèse).
Le contenu de la base de données peut être exploré par l'intermédiaire d'un navigateur web classique. La plateforme Web associée https://aniseed.fr/ permet d'afficher les données dans leur contexte génomique, un module permet de manipuler des représentations tridimensionnelles de l’embryon et de décrire quantitativement les formes et l’organisation des cellules. Ce module permet aussi de combiner les informations moléculaires et embryologiques contenues dans la base à l’embryon virtuel. +
Service à compétence nationale, les '''archives nationales d’outre-mer''' ('''ANOM''') à Aix-en-Provence ont pour mission la '''conservation des archives relatives à la présence coloniale française outre-mer'''.
Héritières de plus de trois siècles d'histoire, elles conservent deux grands ensembles au passé administratif et archivistique différent :
* les archives des secrétariats d'Etat et ministères chargés, du XVIIe siècle au XXe siècle, des colonies françaises ;
* les archives transférées des anciennes colonies et de l'Algérie au moment des indépendances, entre 1954 et 1962, à l'exclusion des archives de gestion restées dans les pays concernés.
S'y ajoutent des archives privées et d'entreprises relatives à l'outre-mer, ainsi qu'une bibliothèque, une cartothèque et une iconothèque spécialisées. +
Le Centre de recherche sur '''la langue et les textes basques''' (IKER) a créé '''un entrepôt de données''' ANPERSANA pour la valorisation '''des sources primaires''' de la recherche des études basques vers '''le libre accès'''. ANPERSANA permet de recevoir, '''documenter''', '''préserver''', diffuser, rechercher, localiser et demander des données de la recherche en langue et culture d’expression basques créées par les chercheurs, les enseignants-chercheurs et les doctorants du laboratoire IKER. Les types de données de recherche sont '''des manuscrits''', '''des carnets de recherche''', '''des images''', '''des enregistrements sonores''', '''des enregistrements musicaux''', '''des enquêtes de terrain'''. +