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P
Le Pôle de Modélisation et Calcul en Science de l'Ingénieur et de l'Information (PMCS2I) de l'École Centrale de Lyon répond aux besoins de '''calcul scientifique''' des chercheurs des laboratoires suivants :
*[http://lmfa.ec-lyon.fr/ Laboratoire de Mécanique des Fluides et Acoustique] (LMFA, UMR 5509);
*[http://ltds.ec-lyon.fr/spip/ Laboratoire de Tribologie et Dynamique des Systèmes] (LTDS, UMR 5513);
*[http://www.ampere-lab.fr/ Laboratoire Ampère] (UMR 5005, Automatique, Génie Électrique et Bioingénierie);
*[https://liris.cnrs.fr/ Laboratoire d'Informatique en Image et Systèmes d'Information] (LIRIS, UMR 5205);
*[https://inl.cnrs.fr/ Institut des Nanotechnologies de Lyon] (INL, UMR 5270);
*[http://math.univ-lyon1.fr/ Institut Camille Jordan] (laboratoire de recherche en mathématiques, UMR 5208).
Le PMCS2I mutualise les ressources informatiques (clusters), assure des formations (calcul scientifique, cours d'initiation à l'utilisation de supercalculateurs du pôle) et organise des séminaires. Il propose un serveur dédié à '''l'analyse''' et '''la visualisation des données de simulation numérique'''. Il possède '''une expertise''' au niveau '''des codes industriels commerciaux''' pour '''la mécanique des fluides numérique''' et '''la mécanique'''.
Le PMCS2I fait partie du mésocentre de calcul de la Fédération Lyonnaise de Modélisation et Sciences Numériques (FLMSN). +
R
Le Réseau des Zones Ateliers – Infrastructure des Socio-écosystèmes, eLTER-France RZA, dispose d’un portail et d’un géocatalogue (Geonetwork) élaborés avec l’UAR 3468 [[BBEES]] (CNRS, MNHN) et hébergé par le centre de calcul de [[CNRS Nucléaire & Particules|CNRS Nucléaire & Particules]] à Lyon.
Collection du catalogue Cat.InDoRES, le catalogue regroupe les données des 15 Zones Ateliers et est moissonné par les principaux catalogues nationaux et internationaux d'intérêt : DEIMS, INRAe, ...
Le thesaurus utilisé et recommandé est actuellement [http://vocabs.lter-europe.net/edg/tbl/EnvThes.editor EnvThes].
La [https://www.inee.cnrs.fr/fr/politique-des-donnees-des-dispositifs-et-infrastructures-de-linee politique des données des dispositifs et infrastructures de CNRS Écologie & Environnement] s’applique aux données produites dans le cadre des Zones Areliers et leur réseau. +
S
Le SEDOO est un '''service de données de l’Observatoire Midi-Pyrénées''' (OMP) et l’un des 4 centres de données de l’infrastructure nationale de données et de services pour l’atmosphère '''[[Aeris]]'''. Il a pour mission de '''développer des applications de stockage, gestion, traitement et diffusion de données scientifiques environnementales'''.
Les principales activités menées par le SEDOO sont à la fois techniques et thématiques :
*La conception et développement de bases de données ;
*Le développement d’applications web d’accès aux données comprenant des catalogues, des interfaces utilisateurs, des fonctionnalités avancées (calcul, graphique…) et des outils d’administration (gestion des utilisateurs et suivi des accès aux données) ;
*La standardisation des données et métadonnées en respectant les standards en vigueur (formats, thesaurus, normes…) ;
*La mise en place de protocoles d’interopérabilité (OpenDAP, WxS…) ;
*L’attribution de DOI (Digital Object Identifier) ;
*L’aide à la rédaction des règles d’échange de données ;
*La mise en place de sites de campagnes pour aider à la planification des opérations (vols…).
Le SEDOO conduit ses activités au niveau régional à travers les demandes de gestion de données émanant des laboratoires de l’OMP ou de Météo-France en réponse à un appel d’offres annuel ; au niveau national grâce aux services d’observations nationaux visant à suivre l’évolution de paramètres environnementaux sur le long terme et à des projets des pôles nationaux de données (Atmosphère, Océan) ; et international avec sa participation à des programmes internationaux incluant de grandes campagnes de mesures multidisciplinaires (océan, atmosphère, surfaces continentales…). +
Le SINP est un dispositif partenarial entre le ministère chargé de l'environnement, l'Office français de la biodiversité, le Muséum national d'Histoire naturelle, les associations, les collectivités territoriales, les établissements publics ou privés, les services déconcentrés de l'État. Il vise à favoriser une synergie entre les acteurs pour la production, la gestion, le traitement, la standardisation, la valorisation et la diffusion des données géolocalisées relatives à l'inventaire du patrimoine naturel (biodiversité et géodiversité).
Le SINP offre un cadre méthodologique de référence et facilite ainsi la mise en relation d’informations (protocoles, standards de métadonnées et de données, référentiels, architecture et outils communs). C’est également une plateforme de promotion des productions des producteurs de données qui y adhèrent.
Le SINP a ainsi pour objet de structurer les connaissances sur la biodiversité : espèces (faune, flore, fonge) d'une part, habitats naturels ou semi-naturels d'autre part, et la géodiversité afin de mettre à disposition ces connaissances au plus grand nombre (et selon les réglementations en vigueur). Il couvre l'ensemble du territoire national (métropole et outre-mer) et porte sur le domaine terrestre comme marin.
Les outils et les documents correspondant à la vie du SINP sont accessibles sur le portail [http://www.naturefrance.fr/ NatureFrance], site d'information sur les données pour la biodiversité. +
C
Le SOERE '''CRYOBS-CLIM, La CRYosphère, un Observatoire du CLIMat''', Service National d'Observation (SNO) labélisé, est structuré autour du suivi des composantes majeures de la cryosphère : les glaciers de montagne/calottes polaires, la neige et le permafrost de montagne. CRYOBS-CLIM est un SOERE regroupant 7 laboratoires français et des partenaires étrangers, soit 53 acteurs au total. Ce nouveau SOERE fédère ainsi 3 communautés de la cryosphère aux enjeux communs :
*L’étude des glaciers et calottes polaires, brique élémentaire du SOERE bénéficiant du double label SNO CNRS Terre & Univers sous le nom de GLACIOCLIM (les GLACiers, un Observatoire du CLIMat) et du label SOERE GLACIOCLIM également sur la période 2011-2015. Au SOERE GLACIOCLIM s’est rajoutée dans CRYOBS-CLIM, la composante « glacier du Svalbard ».
*L’étude du manteau neigeux dont les acteurs sont regroupésdans un atelier (CENACLAM, Climatologie des Echanges Neige-Atmosphère, de la Couche Limite Atmosphérique et du Manteau neigeux).
*L’étude du permafrost de montagne, dont les acteurs sont regroupés également dans un atelier de l’OSUG (PermaFRANCE).
Lien vers la [http://data.cryobsclim.fr/main.jsf Base de Données CRYOBS-CLIM]. +
S
Le SYRTE, '''Systèmes de Référence Temps-Espace''', est une unité mixte de recherche située à l’Observatoire de Paris. Cette unité regroupe 8 équipes scientifiques : Rotation de la Terre et géodésie spatiale, Systèmes de référence célestes, Théorie et métrologie, Métrologie des fréquences optiques, Métrologie des fréquences micro-ondes, Métrologie du temps, Interférométrie Atomique et Capteurs Inertiels, Histoire de l’astronomie. Le SYRTE assure des services nationaux et internationaux en tant que : Centre de conventions de l’IERS (International Earth Rotation and Reference Systems Service), Centre de produits du système céleste, Service de la rotation de la Terre, Références Nationales de Temps, Centre d’analyse Terre-Lune, Centre d’analyse VLBI (Very Long Baseline Interferometry), GBOT - Suivi optique de la sonde Gaia. +
U
Le Service Commun de Documentation (SCD) de l’Université Paris-Est Créteil (UPEC) propose un service dédié aux chercheurs le '''SAVAN''' '''(Service d’Appui et de Valorisation de la recherche par l’Accès ouvert et le Numérique'''). Parmi ses services liés à l’IST (Information scientifique et technique), le SAVAN propose des informations et des ressources liées aux enjeux de la '''Science Ouverte''' réparties sur 5 thématiques :
* La science ouverte en bref
* Repères sur la science ouverte
* Le baromètre science ouverte de l'UPEC
* Données de la recherche
* Plan de gestion de données. +
O
Le Service Information Scientifique et Technique de l’Observatoire des Sciences de l’Univers en région Centre – Val de Loire (OSUC) propose un accompagnement à '''la rédaction de plan de gestion des données''' (PGD) aux chercheurs. +
E
Le Service National d'Observation (SNO) '''Climate relevant Aerosol Properties, CLAP''', réalise des observations des propriétés des aérosols.
L’objectif de CLAP est de contribuer au '''suivi des aérosols atmosphériques''' à partir de mesures régulières. Les observations de ce service doivent servir à évaluer dans un contexte de changement climatique
*l’évolution sur le long terme de certaines sources importantes de l’aérosol,
*l’évolution long terme de la charge en aérosol pour différentes classes de taille et pour différentes espèces chimiques,
*les rétroactions éventuelles de l’aérosol vers le climat à travers ses propriétés optiques et de noyau de condensation nuageuse
Ce service complète le paysage national des SNO pour le suivi de la composition atmosphérique et s’intègre dans la structuration proposée de l’IR [[ACTRIS-France]].
CLAP fait partie de la contribution française à l’Infrastructure de Recherche Européenne ACTRIS-ERI, soumise pour intégration à la feuille de route ESFRI.
Paramètres mesurés:
Aérosols : granulométrie, nombre par classe granulométrique, composition chimique sur filtre (EC-OC Inorganiques solubles, propriétés optiques, propriétés hygroscopiques.
Les données sont accessibles dans la base de données et de services '''[http://ebas.nilu.no EBAS]''' +
M
Le Service National d'Observation (SNO) '''Multiscale TROPIcal CatchmentS, M-TROPICS''', collecte et met à la disposition de la communauté scientifique des '''bases de données temporelles uniques composées de variables climatiques, hydrologiques, géochimiques et écologiques dans différents environnements tropicaux'''.
Le SNO M-TROPICS vise à : (1) déterminer les flux d’eau, de matières organiques et inorganiques présentes en solution (anions et cations majeurs, carbone) et en suspension (carbone organique particulaire) ; (2) établir des bilans de masse d’érosion physique et d’altération chimique ; (3) évaluer l’impact du changement global (usage des terres, climat) sur l’ensemble des paramètres listés ci-dessus.
Le portail M-TROPICS met à disposition des bases de données et de service :
*Portail base de données BVET (Inde Sud, Cameroun) et
*MSEC (Laos, Vietnam, Thailande).
Données multi-sites, multi-capteurs, multi-type, multi-échelles: flux (eau, matière organique et inorganique en solution, bilans de masse d’érosion physique et altération chimique, changement global. Données de télédétection. Multidisciplinaire : Hydrologie, biogéochimie, pédologie, agronomie, écologie. +
S
Le Service de '''Calcul Parallèle''' et de Traitement de '''Données en sciences de la Terre''' (S-CAPAD) de l’Institut de Physique du Globe Paris (IPGP) fournit :
*des ressources de '''calcul parallèle haute performance''' adaptées aux besoins de la '''simulation numérique''', du traitement des données (observations et synthétiques),
*des ressources associées aux nouvelles technologies '''Grille de données et de calcul''' et intégrées aux infrastructures européennes (EGI) et nationales,
*des ressources de '''stockage''' importantes.
Ces ressources permettent de répondre aux besoins de l’IPGP de développer :
*des outils de '''traitement''' et d''''analyse''' de gros volumes de '''données d'observations physiques et environnementales''' sur de longues échelles de temps issues des technologies de mesures au sol et spatiales
*des modèles numériques permettant la simulation quantitative et prédictive de la dynamique des systèmes géologiques sur les échelles de temps et d'espace impliquées,
*des méthodes d'inversion et d'assimilation de données performantes permettant de contrôler ces modèles dynamiques et d'imager l'intérieur de la Terre.
S-CAPAD assure des formations de présentation et d'utilisation de la plateforme. +
L
Le Service d’information scientifique et technique du Laboratoire de Fougères propose un service d’accompagnement à '''la rédaction de plan de gestion''' (PGD) aux chercheurs de l’Anses, Agence nationale de sécurité sanitaire de l’alimentation, de l’environnement et du travail du site de Fougères (Laboratoire de Fougères et ANMV). +
I
Le Service régional de traitement d’image et de télédétection, SERTIT, est la plateforme technologique et de services du laboratoire ICube. Le Sertit produit de l’information géographique à partir des images satellites. Opérateur régional, national et européen, il répond à des besoins sociétaux en offrant des solutions aux problématiques de la gestion des risques, de l’aménagement des territoires, de la gestion des ressources naturelles, de l’environnement, du développement durable. Il fournit ainsi des supports d’aide à la décision immédiatement exploitables par ses partenaires (CNES, ESA, Direction de la sécurité civile, Commission européenne, Région Grand-Est, Eurométropole, SNCF, EDF...).
Cette plateforme d'ICube met à disposition de ses clients et partenaires, une équipe multidisciplinaire et expérimentée d’une vingtaine de spécialistes (informaticiens, géologues, physiciens, géographes, topographes...) compétente en traitement d'images satellites, télédétection, systèmes d'information géographique et photogrammétrie.
Le service de cartographie rapide d'ICube-SERTIT, fournit en temps restreint de la géoinformation dérivée de l’imagerie spatiale aux acteurs de la gestion des risques, des crises et de la reconstruction lors de catastrophes.
Applications thématiques : ICube-SERTIT répond aux besoins sociétaux en offrant des solutions aux problématiques du développement durable comme pour l’aménagement des territoires, la gestion des ressources naturelles, de l’environnement et des risques.
L'intégration du Sertit au sein d'ICube permet une optimisation du transfert des résultats de la recherche du laboratoire vers les applications, dans les domaines du traitement d'images, de la fouille de données et de la télédétection. Cette intégration vise à renforcer les synergies inter-équipes dans le cadre des programmes de recherche transversaux du laboratoire sur l’imagerie physique, le traitement des données massives, le développement et le développement durable. ICube-SERTIT joue également un rôle de conseil pour les applications relatives au domaine du spatial par son implication dans le Booster Rhinespace et dans le réseau Copernicus Relays.
P
Le TAAM est une unité d’appui et de recherche qui offre un large panel de prestations autour des modèles rat et souris pour la recherche fondamentale, biomédicale et pharmaceutique.
Depuis près de 70 ans, 50 ingénieurs et techniciens mettent quotidiennement leurs compétences et leur expertise au service de la communauté scientifique pour :
- Offrir un ensemble de prestations de haut niveau technique autour de 7 pôles d’expertise : exploration par imagerie multimodale in vivo, gestion de colonies à façon, expérimentation (conception et suivi), gestion de colonies axéniques et gnotoxéniques, cryoconservation et reproduction assistée, analyse microbiologique et génétique, et distribution de modèles sur le territoire ou à l’internationale.
- Répondre aux attentes des chercheurs par l’innovation,
- Contribuer au transfert de connaissances par la formation d’étudiants ainsi que par la participation à des programmes de formations scientifiques et techniques destinés à des ingénieurs et techniciens des laboratoires de recherche.
Répartie sur une surface de 8500 m², l’unité TAAM est dotée d’une infrastructure et d’équipements performants de haute technologie fonctionnant 24h/24H et 7j/7j.Le TAAM maintient un haut niveau d’exigence sanitaire, réglementaire et éthique au sein de ces installations.
Dans le cadre des investissements d’avenir et depuis 2011, le TAAM est l’un des trois partenaires nationaux de l’infrastructure de recherche PHENOMIN (conjointement à PHENOMIN-ICS et à PHENOMIN-CIPHE), de l’infrastructure nationale CELPHEDIA, de l’infrastructure paneuropéenne INFRAFRONTIER et de l'IMPC Consortium International de Phénotypage de la souris.
Certifié ISO 9001 depuis janvier 2008 et NFX50-900 depuis 2014, le TAAM est engagé au quotidien pour apporter à ses clients un service de qualité dans le respect des règles d’éthiques et de bien-être animal auxquelles nous sommes tous attachés. +
S
Le [http://science-ouverte.inrae.fr/ Portail Science ouverte] est une plateforme d'information proposée par l'INRAE servant de '''porte d’entrée vers les outils et les structures d’accompagnement à l’ouverture de la science''', proposés aussi bien par la direction pour la Science ouverte (DipSO) que par toute autre direction INRAE. Elle recense notamment les '''services, outils et bonnes pratiques pour la gestion et l'ouverture des données de la recherche''' recommandés par l’institut, sous les rubriques suivantes :
* Le plan "[http://science-ouverte.inrae.fr/sites/default/files/2023-02/Plan%20donnees%20pour%20la%20science.pdf Données pour la science]"
* La gouvernance des données, algorithmes et codes
* Produire des données FAIR
* Gérer des données et des codes
* Partager, publier des données et des codes
* Les réseaux métiers
* Accès aux données administratives
* Questions fréquentes sur les données scientifiques
* L'offre de services autour des données et du numérique scientifique
=== Services proposés : ===
* Attribuer un DOI à un jeu de données ou à une structure INRAE
* Bénéficier d'un accompagnement au calcul scientifique
* Déposer et partager un jeu de données grâce à [[Data INRAE]]
* Disposer d'un portail "cloud"
* Enrichir ses données par un vocabulaire contrôlé grâce au [[Thésaurus INRAE]]
* Faire relire son plan de gestion de données
* Se former et connaître tous les aspects de l'ouverture de la science avec la formation [[OSCAR]]
Il est aussi possible pour l'utilisateur d'interroger directement les outils d’accès aux résultats de recherches tels que le moteur de recherche Aureli et les entrepôts HAL INRAE et Data INRAE. +
A
Le bassin versant agricole du Montoussé à Auradé, BV Auradé est un site expérimental du Soere Réseau des bassins versants (RBV). Service National d'Observation (SNO) labélisé CNRS Terre & Univers, le BV expérimental d’Auradé est dédié aux observations à long terme des impacts des activités agricoles et des changements climatiques sur la qualité des eaux, des sols, des sédiments et des écosystèmes aquatiques, de l’altération chimique des roches, de l’érosion physique des sols, des flux d’eau et de carbone et des transferts de contaminants. +
D
Le besoin d’échanger sur les différents usages qui sont faits des '''humanités numériques''' et de structurer ces nouvelles pratiques est à l'origine de l'initiative '''Digit_Hum'''.
Son site constitue une '''archive des humanités numériques''' en train de se faire et s'adresse aux chercheurs, ingénieurs, bibliothécaires, étudiants ou toute personne intéressée par ce domaine en évolution constante.
Il présente ses activités selon quatre grands volets :
* Des '''ateliers annuels''' organisés depuis 2015, dont l’ensemble des communications filmées sont accessibles en ligne;
* Des '''enquêtes sur des thématiques d’actualité''' en collaboration avec des experts du domaine;
* Des '''portraits d’acteurs en humanités numériques''';
* Des '''ressources bibliographiques et des informations''' sur les centres de recherche, les manifestations et les formations en humanités numériques, ainsi qu’un glossaire.
Une rubrique "portfolio" est également présente pour montrer les collaborations de Digit_Hum avec des artistes, amateurs ou professionnels, pour illustrer les ateliers, les portraits et des ouvrages en humanités numériques. +
Le but du projet de l'équipe '''Dyliss, Dynamics, Logics and Inference for biological Systems and Sequences''', est de modéliser les acteurs clés de processus d'adaptation biologiques, en utilisant des systèmes formels pour structurer et combiner les informations issues de données génomiques et physiologiques.
Dyliss est une équipe de '''recherche en bioinformatique''' qui se concentre sur l''''analyse des séquences et la biologie des systèmes'''. L'équipe Dyliss utilise des systèmes formels qualitatifs pour caractériser les acteurs génétiques d'espèces non modèles, telles que les algues ou les bacilles miniers, qui contrôlent les réponses phénotypiques lorsqu'elles sont confrontées à leur environnement.
'''Méthodes''' : programmation logique par contraintes, dynamique symbolique, apprentissage machine, systèmes formels.
'''Expertise''' : caractérisation fonctionnelle, espèces non modèles, intégration multi-échelle.
'''Domaines d'application''' : biologie marine, biologie micro-environnementale... +
C
Le catalogue '''Calames''' – '''Catalogue des Archives et Manuscrits de l’Enseignement Supérieur''' – donne accès à toute la richesse des fonds d’archives et de manuscrits conservée au sein de la soixantaine d’établissements membres du réseau Calames. Il est développé par l'Agence bibliographique de l’enseignement supérieur (Abes). +
D
Le catalogue [https://data.ined.fr/index.php/home DataIned] permet un accès en ligne, direct et gratuit, aux enquêtes que l'Institut National d’Études Démographiques a réalisées depuis sa création en 1945 (soit un peu plus de 240 références). DataIned offre des métadonnées pour toutes les enquêtes de l’Ined, et pour certaines d’entre elles une documentation détaillée des données jusqu’au niveau variable (intitulé de la question, consignes aux enquêteurs, filtres, modalités de réponses et tris à plat). Il permet de réaliser en ligne des graphiques, des tris croisés et des régressions linéaires.DataIned facilite la visibilité et le partage des données de l’Ined, en conformité avec les principes FAIR.
Aucune inscription n'est nécessaire, et il est possible pour chaque enquête de :
*Consulter la documentation liée à l'enquête
*Parcourir les données documentées
*Voir les tris à plat
*Réaliser des tris croisés ou analyses simples
*Télécharger l'ensemble de la documentation
*Télécharger les matériaux de l'enquête (ex : questionnaire)
Il est possible de télécharger des jeux de données via le '''portail [[Quetelet PROGEDO Diffusion]]''' ou en cours de navigation sur le lien "Commander les données" (en haut à droite de chaque page). +