ICGex

  ICGex

Type de service	Plateforme de calcul
Statut	En production
URL	https://curie.fr/plateforme/curiecoretech-sequencage-haut-debit-icgex
Contact	ngs.lab@curie.fr
Localisation	Paris
Structure d'appartenance	CurieCoreTech, France Génomique
Tutelles	Institut Curie

Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :

Collecte

Analyse

Documentation

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La plateforme ICGex-NGS propose un large champ d’applications en génomique, transcriptomique et épigénétique. Cette offre technologique, qui répond en premier lieu aux besoins des équipes de l’Institut travaillant sur le cancer, est aussi accessible à la communauté scientifique externe.

La plateforme propose un service d’excellence autour de technologies de pointe en séquençage de nouvelle génération (NGS). Elle fournit un accompagnement scientifique et technique lors des étapes de design expérimental, comprenant la détermination des stratégies de séquençage les mieux adaptées. Elle met également au point des approches innovantes d’intérêt pour la communauté scientifique, impliquant le développement et l’implémentation de nouvelles technologies de génomique à haut débit.

Domaines scientifiques :Vie & Santé

LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes Thématique et/ou mots clés :

• Plateforme de bioinformatique
• Transcriptomique
• Génomique
• Epigénétique
• Cancérologie
• Exome humain
• Low input
• NovaSeq
• Séquençage de génomes entiers
• Single cell
• 10x Genomics
• Spatial transcriptomic
• Multiome
• Long read
• PacBio
• Iso-Seq

Type de données :Données génomiques, Données de séquençage

Communauté d'utilisateurs : Communauté scientifique en séquençage de nouvelle génération Usagers et bénéficiaires :Chercheurs, Enseignant-Chercheurs, Doctorants

Conditions d'usage : Les demandes de NGS peuvent être envoyées par mail à l’adresse ngs.lab@curie.fr. Si le projet est déjà bien cadré, la plateforme transmettra un fichier Excel à remplir et à renvoyer par mail avec les informations relatives à la demande et les principaux contacts (responsable de projet, chef d’équipe, bioinformaticien et gestionnaire administratif). Si au contraire, les utilisateurs ont besoin de conseils, la plateforme peut transmettre un certain nombre de documents et de fiches informatives, ou organiser un rendez-vous pour discuter du projet. La prestation démarre après validation du devis, réception du bon de commande et des échantillons.

Conditions tarifaires : Après validation de la faisabilité du projet, la plateforme enverra un devis

Certification/Label :IBiSA (https://www.ibisa.net/trouver-plateforme/)

ISO 9001:2015 (https://qualite.ibisa.net/certificats/certificat ISO 667.pdf)

NFX 50-900:2016 (https://qualite.ibisa.net/certificats/certificat NFX 667.pdf)

Conditions générales d'utilisation :

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
CurieCoreTech	ICGex CUBIC
France Génomique	GeT LIGAN-PM GenomiqueENS TGML MGX GenomEast GENOMAX UCA Genomix PSI2BC Biomics ICGex

Le GIS Infrastructure en Biologie Santé et Agronomie a pour vocation de structurer et de financer les infrastructures de recherche en sciences de la vie, en mutualisant leurs moyens.

2015

Systèmes de management de la qualité

Système de management intégrant un système de management de la qualité ISO 9001:2015 concernant les exigences pour les plateformes technologiques de recherche en sciences du vivant