IGenSeq

  IGenSeq

Type de service	Plateforme de calcul
Statut	En production
URL	https://igenseq.institutducerveau-icm.org
Contact	yannick.marie@icm-institute.org
Localisation	Paris
Structure d'appartenance	ICM
Tutelles	CNRS, Inserm, Sorbonne Université

Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :

Collecte

Analyse

Documentation

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La plateforme iGenSeq est une plateforme technologique ayant pour objectif de fournir à ses utilisateurs des outils et services pour l’analyse des acides nucléiques.

Elle est spécialisée dans les prestations de séquençage à haut débit et a évolué pour répondre aux projets de pointe en génomique. La plateforme propose les prestations suivantes :

• Réalisation de génomes (toutes espèces) et d’exomes (humains et souris)
• Methyl-Seq, ChIP-Seq, ATAC-Seq, CLIP-Seq, Cut&Tag-Seq à partir d’acides nucléiques purifiés
• RNA-Seq (3’, low input, FFPE, mRNA, ribodepletion) et small RNA-Seq
• Analyse sur cellule unique (single cell)
• PCR en temps réel (qPCR) à haut débit et PCR digitale en gouttelettes
• Identitovigilance pour la sécurisation des données des patients
• Accompagnement sur le design de projets
• Mise à disposition des équipements

Domaines scientifiques :Vie & Santé

LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes Thématique et/ou mots clés :

• Plateforme de bioinformatique
• NGS
• Séquençage haut debit
• Single cell
• Illumina
• Préparation de librairies
• Ready to seq
• Ready to load
• Short reads
• ARN
• ADN
• NovaSeq 6000

Type de données :Données génomiques, Données de séquençage

Communauté d'utilisateurs : Laboratoires académiques, aux services hospitaliers et aux partenaires industriels Usagers et bénéficiaires :Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Médecins

Conditions d'usage : Pour soumettre un dossier ou un projet à iGenSeq, il est possible de passer par le site web de la plateforme.

Conditions tarifaires :

Certification/Label :ISO 9001:2015 (https://igenseq.institutducerveau-icm.org/la-plateforme-de-sequencage-igenseq-obtient-le-renouvellement-de-sa-labellisation-iso90012015/)

IBiSA (https://www.ibisa.net/trouver-plateforme/)

Conditions générales d'utilisation :

IGenSeq est en lien avec les services et structures

France Génomique

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
ICM	iCONICS DAC IGenSeq

Centre National de la Recherche Scientifique

2015

Systèmes de management de la qualité

Le GIS Infrastructure en Biologie Santé et Agronomie a pour vocation de structurer et de financer les infrastructures de recherche en sciences de la vie, en mutualisant leurs moyens.