TGML

TGML

Type de service	Plateforme de calcul
Statut	En production
Autres noms	Transcriptomique et génomique Marseille Luminy
URL	https://tagc.univ-amu.fr/en/resources/transcriptomic-genomic-platform-marseille-luminy
Contact	denis.puthier@univ-amu.fr, beatrice.loriod@inserm.fr
Localisation
Structure d'appartenance	TAGC, France Génomique
Tutelles	INSERM, Aix-Marseille Université

Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :

Analyse

Documentation

Stockage

La plateforme TGML propose son expertise pour l'analyse de différents types de projets liés au séquençage à haut débit. Elle offre une large palette d’outils expérimentaux et bioinformatiques pour l’étude du transcriptome et de la génomique fonctionnelle. Ses ingénieurs assurent le traitement et l’analyse de puces à ADN, la construction de librairies, le séquençage et les analyses de données (primaires et secondaires).

Les services proposés sont :

• Construction de librairies de séquençage ChIP-Seq
• Construction de librairies de séquençage RNA-Seq : sélection poly(A) et ribo-déplétion
• Construction de librairies de séquençage miRNA-Seq
• Construction de librairies avec le Chromium Controller : single cell et linked reads
• Séquençage,
• Réalisation et analyse de puces à ADN : ARN total et petits ARNs
• Réalisation d’analyses bioinformatiques.

Domaines scientifiques :Sciences & Technologies, Vie & Santé

PE6 Sciences informatiques et informatique LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes Thématique et/ou mots clés :

• Plateforme de bioinformatique
• Génomique
• Biostatistique
• Logiciel
• Séquençage
• Analyse à grande échelle

Type de données :

Communauté d'utilisateurs : Communautés de la recherche publique française et internationale, industrielle Usagers et bénéficiaires :

Conditions d'usage :

Conditions tarifaires :

Certification/Label :ISO 9001:2015 ([https://qualite.ibisa.net/certificats/tgml-iso-9001.pdf%0ANFX_50-900:2016 https://qualite.ibisa.net/certificats/tgml-iso-9001.pdf NFX 50-900:2016])

Conditions générales d'utilisation :

TGML est en lien avec les services et structures

IFB

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
France Génomique	GeT LIGAN-PM GenomiqueENS TGML
TAGC	TGML

Système de management intégrant un système de management de la qualité ISO 9001:2015 concernant les exigences pour les plateformes technologiques de recherche en sciences du vivant.