BiRD

  BiRD

Type de service	Plateforme de calcul
Statut	En production
Autres noms	Plateforme de Bioinformatique de Nantes
URL	https://pf-bird.univ-nantes.fr
Contact	pf-bird@univ-nantes.fr
Localisation	Nantes
Structure d'appartenance	Institut du thorax
Tutelles	Inserm, CNRS, Nantes Université

Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :

Analyse

Stockage

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BiRD conseille, propose et développe des services bioinformatiques : soutien à l'analyse des données de séquençage à haut débit, c'est-à-dire la détection des variants, l'étude du transcriptome et maintenant l'analyse des microbiotes. À cette fin, elle travaille conjointement avec le centre GenoA, qui gère la préparation des bibliothèques et les projets de séquençage.

Pour toutes ces applications, BiRD possède une expertise dans l'analyse de données à grande échelle et développe des pipelines d'analyse bioinformatique dédiés afin de standardiser l'analyse des données brutes jusqu'à l'interprétation biologique.

Ces services sont soutenus par une infrastructure de calcul et de stockage dédiée, accessible à distance par plusieurs services et ouverte à la communauté scientifique quelle que soit son institution.

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BiRD advises, proposes and develops bioinformatics services: support for high throughput sequencing data analysis, i.e. variant detection, transcriptome study and now microbiote analysis. To this end, BiRD works jointly with the GenoA core facility, which handles library preparation and sequencing projects.

For all these applications, BiRD has expertise in large-scale data analysis and develops dedicated bioinformatics analysis pipelines to standardize analysis from raw data to biological interpretation.

These services are supported by a dedicated computing and storage infrastructure, remotely accessible through several services and open to the scientific community regardless of its institution.

Domaines scientifiques :Vie & Santé

LS7 Prévention, diagnostic et traitement des maladies humaines Thématique et/ou mots clés :

• Plateforme de bioinformatique
• Analyse de données
• Calcul scientifique

Type de données :

Communauté d'utilisateurs : Communauté académique française Usagers et bénéficiaires :Chercheurs, Enseignants-chercheurs, Doctorants

Conditions d'usage :

Conditions tarifaires :

Certification/Label :

Conditions générales d'utilisation :

BiRD est en lien avec les services et structures

IBiSA, GenOuest, IFB, SFR Santé François Bonamy, GLiCID

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
Institut du thorax	BiRD

Centre National de la Recherche Scientifique