NSBD

  NSBD

Type de service	Plateforme de calcul
Statut	En production
Autres noms	Networks and Systems Biology for Diseases, Biologie des systèmes et des réseaux pour les maladies
URL	https://www.marseille-medical-genetics.org/a-baudot/
Contact	anais.baudot@univ-amu.fr
Localisation	Marseille
Structure d'appartenance	MMG
Tutelles	Aix-Marseille Université, Inserm

Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :

Analyse

Documentation

Stockage

Chargement de la carte...

{"format":"leaflet","minzoom":false,"maxzoom":false,"limit":50,"offset":0,"link":"all","sort":[""],"order":[],"headers":"show","mainlabel":"","intro":"","outro":"","searchlabel":"... autres r\u00e9sultats","default":"\u0026#32;","import-annotation":false,"width":"280px","height":"280px","centre":false,"title":"","label":"","icon":"","lines":[],"polygons":[],"circles":[],"rectangles":[],"copycoords":true,"static":false,"zoom":false,"defzoom":14,"layers":["OpenStreetMap"],"image layers":[],"overlays":[],"resizable":false,"fullscreen":false,"scrollwheelzoom":true,"cluster":true,"clustermaxzoom":20,"clusterzoomonclick":true,"clustermaxradius":20,"clusterspiderfy":true,"geojson":"","clicktarget":"","showtitle":true,"hidenamespace":true,"template":"","userparam":"","activeicon":"","pagelabel":false,"ajaxcoordproperty":"","ajaxquery":"","locations":[{"text":"\u003Cb\u003E\u003Ca href=\"/index.php/NSBD\" title=\"NSBD\"\u003ENSBD\u003C/a\u003E\u003C/b\u003E","title":"NSBD","link":"","lat":43.28805,"lon":5.4034,"icon":""}],"imageLayers":[]}

L'équipe Networks and Systems Biology for Diseases (NSBD) a pour objectif de développer des algorithmes, des outils d'analyse et d'intégration de données biologiques et de proposer des approches "système" pour l'étude des pathologies génétiques humaines.

Elle est organisée en deux axes de recherche :

• Développements méthodologiques : Biologie des systèmes et théorie des réseaux
• Applications pour démêler les troubles humains

Pour ce qui est des outils, l'équipe se focalise particulièrement sur des approches non-supervisées appliquées aux réseaux biologiques multi-couches et propose des outils de clustering, de marches aléatoires ou de network embedding. L'équipe travaille également sur l'intégration de données quantitatives (transcriptomique, protéomique) dans les réseaux pour identifier des modules perturbés dans différentes conditions. Enfin, l'équipe s'intéresse également à l'intégration de données multi-omiques par des approches de réduction de dimension via des factorisations de matrices.

Domaines scientifiques :Sciences & Technologies, Vie & Santé

PE6 Sciences informatiques et informatique LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes Thématique et/ou mots clés :

• Plateforme de bioinformatique
• Génomique
• Biostatistique
• Logiciel
• Séquençage

Type de données :

Communauté d'utilisateurs : Usagers et bénéficiaires :

Conditions d'usage :

Conditions tarifaires :

Certification/Label :

Conditions générales d'utilisation :

NSBD est en lien avec les services et structures

IFB

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
MMG	B&G NSBD