NSBD

De Cat OPIDoR
NSBD
Type de service Plateforme de calcul
Statut En production
Autres noms Networks and Systems Biology for Diseases, Biologie des systèmes et des réseaux pour les maladies
URL https://www.marseille-medical-genetics.org/a-baudot/
Contact anais.baudot@univ-amu.fr
Localisation Marseille
Structure d'appartenance MMG
Tutelles Aix-Marseille Université, Inserm


Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :


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L'équipe Networks and Systems Biology for Diseases (NSBD) a pour objectif de développer des algorithmes, des outils d'analyse et d'intégration de données biologiques et de proposer des approches "système" pour l'étude des pathologies génétiques humaines.

Elle est organisée en deux axes de recherche :

  • Développements méthodologiques : Biologie des systèmes et théorie des réseaux
  • Applications pour démêler les troubles humains


Pour ce qui est des outils, l'équipe se focalise particulièrement sur :

  • Des approches non-supervisées appliquées aux réseaux biologiques multi-couches et propose des outils de clustering, de marches aléatoires ou de network embedding.
  • L'intégration de données quantitatives (transcriptomique, protéomique) dans les réseaux pour identifier des modules perturbés dans différentes conditions.
  • L'intégration de données multi-omiques par des approches de réduction de dimension via des factorisations de matrices.


Domaines scientifiques :Sciences & Technologies, Vie & Santé


PE6 Sciences informatiques et informatique LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes Thématique et/ou mots clés :

  • Plateforme de bioinformatique
  • Génomique
  • Biostatistique
  • Logiciel
  • Séquençage

Type de données :

Communauté d'utilisateurs : Usagers et bénéficiaires :


Conditions d'usage :

Modèle économique :

Certification/Label :

Conditions générales d'utilisation :

NSBD est en lien avec les services et structures

IFB



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