« Ichthyop » : différence entre les versions

Ichthyop
Type de service	Outils de gestion des données
Statut	En production
Nom développé	Lagrangian tool for simulating ichthyoplankton dynamics
Autres noms
URL	https://ichthyop.org, https://documentation.ichthyop.org
Contact	https://github.com/ichthyop/ichthyop/issues
Localisation	Sète
Structure d'appartenance	MARBEC, OREME
Tutelles	CNRS, IRD, Ifremer, Université de Montpellier, INRAE

Dernière version du 20 juin 2025 à 10:13

Ichthyop est un logiciel de simulation de la dispersion d’organismes par les courants océaniques conçu pour étudier les effets des facteurs physiques et biologiques sur la dynamique de l'ichtyoplancton, appliqué également à d’autres problématiques environnementales comme l’étude de la dérive des plastiques dans l’océan.

Il intègre les processus les plus importants qui interviennent au début de la vie des poissons: mouvement, croissance, mortalité et recrutement. L'outil utilise comme entrée des séries temporelles des champs de vitesse, la température et la salinité archivés à partir des modèles océaniques ROMS, MARS, NEMO ou SYMPHONIE (fichiers ou OpenDAP).

Il aide à une meilleure compréhension de l’écologie d’espèces commerciales à forts enjeux économiques et à la mise en place de politiques de conservation de l’espace marin, via l’étude de la connectivité entre aires marines protégées, mais aussi à étudier la dérive d’entités non vivantes comme les polluants et les débris marins.

Domaines scientifiques :Vie & Santé

LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution; LS9 Biotechnologie et ingénierie des biosystèmes Thématique et/ou mots clés :

Écologie marine
Écosystèmes marins
Dispersion d'organismes

Type de données :Données de simulation

Communauté d'utilisateurs : Communauté scientifique en biodiversité matine Usagers et bénéficiaires :Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Doctorants, Ingénieurs

Conditions d'usage : L'outil offre deux modes de fonctionnement :

Le premier fournit une interface graphique conviviale pour configurer et exécuter la simulation et visualiser le transport d'œufs et de larves virtuels, en créant des GIF animés ou en exportant les trajectoires au format KMZ (Google Earth).
Le second est un mode batch qui donne la possibilité de faire des séries de simulation. Les deux modes produisent des fichiers de sortie NetCDF qui stockent des informations sur la dynamique simulée des individus.

Le code est open source et disponible sur Github : https://github.com/ichthyop/ichthyop/.

Conditions tarifaires : Gratuit

Certification/Label :

Conditions générales d'utilisation :

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
MARBEC	Ichthyop
OREME	BGI OREME Portail KARST POLLUX Puéchabon MGX Ichthyop

@@ Ligne 1 : / Ligne 1 : @@
 {{Infobox Service
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 |NomService=Ichthyop
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 {{Coordonnées GPS
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+|Description='''Ichthyop''' est un logiciel de '''simulation de la dispersion d’organismes par les courants océaniques''' conçu pour étudier les effets des facteurs physiques et biologiques sur la dynamique de l'ichtyoplancton, appliqué également à d’autres problématiques environnementales comme l’étude de la dérive des plastiques dans l’océan.
-l’étude de la dérive des plastiques dans l’océan.
+Il intègre les processus les plus importants qui interviennent au début de la vie des poissons: mouvement, croissance, mortalité et recrutement. L'outil utilise comme entrée '''des séries temporelles des champs de vitesse, la température et la salinité archivés à partir des modèles océaniques ROMS, MARS, NEMO ou SYMPHONIE  (fichiers ou OpenDAP)'''.
-Il aide à une '''meilleure compréhension de l’écologie d’espèces commerciales à forts enjeux économiques''' et à la mise en place de politiques de conservation de l’espace marin, via l’étude de la connectivité entre aires marines protégées, mais aussi à étudier la dérive d’entités non vivantes comme les polluants
+Il aide à une '''meilleure compréhension de l’écologie d’espèces commerciales à forts enjeux économiques''' et à la mise en place de politiques de conservation de l’espace marin, via l’étude de la connectivité entre aires marines protégées, mais aussi à étudier la dérive d’entités non vivantes comme les polluants et les débris marins.
-et les débris marins.
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+* Le premier fournit une interface graphique conviviale pour configurer et exécuter la simulation et visualiser le transport d'œufs et de larves virtuels, en créant des GIF animés ou en exportant les trajectoires au format KMZ (Google Earth).
+* Le second est un mode batch qui donne la possibilité de faire des séries de simulation. Les deux modes produisent des fichiers de sortie NetCDF qui stockent des informations sur la dynamique simulée des individus.
+Le code est open source et disponible sur Github : https://github.com/ichthyop/ichthyop/.
 |ModeleEconomique=Gratuit
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+[[Aide à la gestion:: logiciel| ]]