« BiRD » : différence entre les versions
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|Description='''BiRD''' conseille, propose et développe des services bioinformatiques : '''soutien à l'analyse des données de séquençage à haut débit, c'est-à-dire la détection des variants, l'étude du transcriptome et maintenant l'analyse des microbiotes'''. À cette fin, elle travaille conjointement avec le centre GenoA, qui gère la préparation des bibliothèques et les projets de séquençage. | |Description='''BiRD''' conseille, propose et développe des services bioinformatiques : '''soutien à l'analyse des données de séquençage à haut débit, c'est-à-dire la détection des variants, l'étude du transcriptome et maintenant l'analyse des microbiotes'''. À cette fin, elle travaille conjointement avec le centre GenoA, qui gère la préparation des bibliothèques et les projets de séquençage. | ||
Pour toutes ces applications, | Pour toutes ces applications, BiRD possède une '''expertise dans l'analyse de données à grande échelle et développe des pipelines d'analyse bioinformatique''' dédiés afin de standardiser l'analyse des données brutes jusqu'à l'interprétation biologique. | ||
Ces services sont soutenus par une infrastructure de calcul et de stockage dédiée, accessible à distance par plusieurs services et ouverte à la communauté scientifique quelle que soit son institution. | Ces services sont soutenus par une infrastructure de calcul et de stockage dédiée, accessible à distance par plusieurs services et ouverte à la communauté scientifique quelle que soit son institution. | ||
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|Discipline=Vie & Santé | |Discipline=Vie & Santé | ||
|SousDisciplineVie&Sante=LS7 Prévention, diagnostic et traitement des maladies humaines | |SousDisciplineVie&Sante=LS7 Prévention, diagnostic et traitement des maladies humaines | ||
|Thematique=Plateforme de bioinformatique | |Thematique=Plateforme de bioinformatique, Analyse de données, Calcul scientifique | ||
|Communaute=Communauté académique française | |||
|Beneficiaire=Chercheurs, Enseignants-chercheurs, Doctorants | |Beneficiaire=Chercheurs, Enseignants-chercheurs, Doctorants | ||
|Relation=IBiSA, GenOuest, IFB | |Relation=IBiSA, GenOuest, IFB, SFR Santé François Bonamy, GLiCID | ||
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Dernière version du 21 août 2024 à 15:09
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|---|---|
| Type de service | Plateforme de calcul |
| Statut | En production |
| Autres noms | Plateforme de Bioinformatique de Nantes |
| URL | https://pf-bird.univ-nantes.fr |
| Contact | pf-bird@univ-nantes.fr |
| Localisation | Nantes |
| Structure d'appartenance | Institut du thorax |
| Tutelles | Inserm, CNRS, Nantes Université |
Cycle de vie des données
Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :
Pour toutes ces applications, BiRD possède une expertise dans l'analyse de données à grande échelle et développe des pipelines d'analyse bioinformatique dédiés afin de standardiser l'analyse des données brutes jusqu'à l'interprétation biologique.
Ces services sont soutenus par une infrastructure de calcul et de stockage dédiée, accessible à distance par plusieurs services et ouverte à la communauté scientifique quelle que soit son institution.
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BiRD advises, proposes and develops bioinformatics services: support for high throughput sequencing data analysis, i.e. variant detection, transcriptome study and now microbiote analysis. To this end, BiRD works jointly with the GenoA core facility, which handles library preparation and sequencing projects.
For all these applications, BiRD has expertise in large-scale data analysis and develops dedicated bioinformatics analysis pipelines to standardize analysis from raw data to biological interpretation.
These services are supported by a dedicated computing and storage infrastructure, remotely accessible through several services and open to the scientific community regardless of its institution.
Domaines scientifiques :Vie & Santé
LS7 Prévention, diagnostic et traitement des maladies humaines Thématique et/ou mots clés :
- Plateforme de bioinformatique
- Analyse de données
- Calcul scientifique
Type de données :
Communauté d'utilisateurs : Communauté académique française Usagers et bénéficiaires :Chercheurs, Enseignants-chercheurs, Doctorants
Conditions d'usage :
Conditions tarifaires :
Certification/Label :
Conditions générales d'utilisation :
BiRD est en lien avec les services et structures
IBiSA, GenOuest, IFB, SFR Santé François Bonamy, GLiCID
| Structure | Services proposés |
|---|---|
| Institut du thorax | BiRD |