« BAliBASE » : différence entre les versions

BAliBASE
Type de service	Plateforme d'accès
Statut	En production
Nom développé	Benchmark Alignment dataBASE
URL	http://lbgi.fr/balibase/
Contact	thompson@unistra.fr
Localisation	Strasbourg
Structure d'appartenance	IGBMC
Tutelles	CNRS, Inserm, Université de Strasbourg
Identifiants
re3data	10.17616/R31NJMHE

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Dernière version du 9 mars 2026 à 16:53

BAliBASE est une base de données qui contient des alignements de séquences multiples de haute qualité, construits manuellement et accompagnés d'annotations détaillées. Les alignements sont tous basés sur des superpositions structurelles tridimensionnelles, à l'exception des séquences transmembranaires.

Les utilisateurs peuvent :

Consulter une liste de tous les alignements
Télécharger la base de données complète par ftp
Obtenir le programme "c" pour comparer un alignement test avec la référence BAliBASE,
Consulter les résultats d'une étude comparative de plusieurs programmes d'alignement multiple, en utilisant les ensembles de référence BAliBASE.

Domaines scientifiques :Vie & Santé

LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes; LS3 Biologie cellulaire, développement, cellules souches et régénération Thématique et/ou mots clés :

Alignement
Séquence transmembranaire
Bioinformatique
Permutation circulaire

Type de données :Base de données

Périmètre de communauté : ESR, international

Usagers et bénéficiaires :Chercheur, Enseignant-chercheur, Doctorant

Conditions d'usage : Accès libre. Le code source de BAliBASE est disponible gratuitement.

Conditions tarifaires : Accès gratuit

Certification/Label :

Conditions générales d'utilisation :

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
IGBMC	ICI BAliBASE GenomEast

@@ Ligne 3 : / Ligne 3 : @@
 |TypeService=Plateforme d'accès
 |StatutService=En production
-|NomAlternatif=Benchmark Alignment dataBASE
+|NomDéveloppé=Benchmark Alignment dataBASE
 |UrlService=http://lbgi.fr/balibase/
 |ContactMel=thompson@unistra.fr
 |Localisation=Strasbourg
 |StructureAppartenance=IGBMC
-|Tutelle=CNRS, INSERM, Université de Strasbourg, Centre Européen de Recherche en Biologie et en Médecine
+|Tutelle=CNRS, Inserm, Université de Strasbourg
 |IDre3data=10.17616/R31NJMHE
 |PhaseCycleVie=Documentation, Conservation, Réutilisation
+|International=Non
+|NomAlternatif=Benchmark Alignment dataBASE
 }}
 {{Coordonnées GPS
@@ Ligne 25 : / Ligne 27 : @@
 * Consulter les résultats d'une étude comparative de plusieurs programmes d'alignement multiple, en utilisant les ensembles de référence BAliBASE.
 |Discipline=Vie & Santé
-|SousDisciplineVie&Sante=LS3 Biologie cellulaire, du développement et régénérative
+|SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes; LS3 Biologie cellulaire, développement, cellules souches et régénération
 |Thematique=Alignement, Séquence transmembranaire, Bioinformatique, Permutation circulaire
 |TypeDonnee=Base de données
-|Communaute=Communauté scientifique, académique
+|PerimetreCommunaute=ESR, international
 |Beneficiaire=Chercheur, Enseignant-chercheur, Doctorant
 |ConditionUsage=Accès libre. Le code source de BAliBASE est disponible gratuitement.
 |ModeleEconomique=Accès gratuit
 }}