BAliBASE

De Cat OPIDoR
BAliBASE
Type de service Plateforme d'accès
Statut En production
Autres noms Benchmark Alignment dataBASE
URL http://lbgi.fr/balibase/
Contact thompson@unistra.fr
Localisation Strasbourg
Structure d'appartenance IGBMC
Tutelles CNRS, INSERM, Université de Strasbourg
Identifiants
re3data 10.17616/R31NJMHE


Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :


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BAliBASE est une base de données qui contient des alignements de séquences multiples de haute qualité, construits manuellement et accompagnés d'annotations détaillées. Les alignements sont tous basés sur des superpositions structurelles tridimensionnelles, à l'exception des séquences transmembranaires.


Les utilisateurs peuvent :

  • Consulter une liste de tous les alignements
  • Télécharger la base de données complète par ftp
  • Obtenir le programme "c" pour comparer un alignement test avec la référence BAliBASE,
  • Consulter les résultats d'une étude comparative de plusieurs programmes d'alignement multiple, en utilisant les ensembles de référence BAliBASE.


Domaines scientifiques :Vie & Santé


LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes; LS3 Biologie cellulaire, du développement et régénérative Thématique et/ou mots clés :

  • Alignement
  • Séquence transmembranaire
  • Bioinformatique
  • Permutation circulaire

Type de données :Base de données

Communauté d'utilisateurs : Communauté scientifique, académique Usagers et bénéficiaires :Chercheur, Enseignant-chercheur, Doctorant


Conditions d'usage : Accès libre. Le code source de BAliBASE est disponible gratuitement.

Modèle économique : Accès gratuit

Certification/Label :

Conditions générales d'utilisation :



Services proposés par la structure d'appartenance
StructureServices proposés
IGBMCBAliBASE