« BiRD » : différence entre les versions

De Cat OPIDoR
Aucun résumé des modifications
Aucun résumé des modifications
 
(9 versions intermédiaires par 2 utilisateurs non affichées)
Ligne 1 : Ligne 1 :
{{Infobox Service
{{Infobox Service
|Logo=Logo BIRD.png
|NomService=BiRD
|NomService=BiRD
|TypeService=Plateforme de calcul
|TypeService=Plateforme de calcul
Ligne 7 : Ligne 8 :
|ContactMel=pf-bird@univ-nantes.fr
|ContactMel=pf-bird@univ-nantes.fr
|Localisation=Nantes
|Localisation=Nantes
|StructureAppartenance=l'institut du thorax, INSERM UMR1087, CNRS UMR 6291, Nantes Université
|StructureAppartenance=Institut du thorax
|Tutelle=Inserm, CNRS, Nantes Université
|Tutelle=Inserm, CNRS, Nantes Université
|IDRNSR=201220396X
|PhaseCycleVie=Analyse, Stockage
|PhaseCycleVie=Analyse, Stockage
|International=Non
}}
{{Coordonnées GPS
|CoordonneeGeographique=47.20929, -1.55381
|CoordonneeGeographique=47.20929, -1.55381
}}
}}
{{Service
{{Service
|Description=BiRD advises, proposes and develops bioinformatics services: '''support for high throughput sequencing data analysis, i.e. variant detection, transcriptome study and now microbiote analysis.''' To this end, BiRD works jointly with the GenoA core facility, which handles library preparation and sequencing projects.
|Description='''BiRD''' conseille, propose et développe des services bioinformatiques : '''soutien à l'analyse des données de séquençage à haut débit, c'est-à-dire la détection des variants, l'étude du transcriptome et maintenant l'analyse des microbiotes'''. À cette fin, elle travaille conjointement avec le centre GenoA, qui gère la préparation des bibliothèques et les projets de séquençage.
 
Pour toutes ces applications, BiRD possède une '''expertise dans l'analyse de données à grande échelle et développe des pipelines d'analyse bioinformatique''' dédiés afin de standardiser l'analyse des données brutes jusqu'à l'interprétation biologique.
 
Ces services sont soutenus par une infrastructure de calcul et de stockage dédiée, accessible à distance par plusieurs services et ouverte à la communauté scientifique quelle que soit son institution.
 
 
____________________________________________
 
 
 
'''BiRD''' advises, proposes and develops bioinformatics services: '''support for high throughput sequencing data analysis, i.e. variant detection, transcriptome study and now microbiote analysis.''' To this end, BiRD works jointly with the GenoA core facility, which handles library preparation and sequencing projects.


For all these applications, BiRD has '''expertise in large-scale data analysis and develops dedicated bioinformatics analysis pipelines''' to standardize analysis from raw data to biological interpretation.
For all these applications, BiRD has '''expertise in large-scale data analysis and develops dedicated bioinformatics analysis pipelines''' to standardize analysis from raw data to biological interpretation.
Ligne 20 : Ligne 34 :
These services are supported by a dedicated computing and storage infrastructure, remotely accessible through several services and open to the scientific community regardless of its institution.
These services are supported by a dedicated computing and storage infrastructure, remotely accessible through several services and open to the scientific community regardless of its institution.
|Discipline=Vie & Santé
|Discipline=Vie & Santé
|Thematique=Plateforme de bioinformatique
|SousDisciplineVie&Sante=LS7 Prévention, diagnostic et traitement des maladies humaines
|Thematique=Plateforme de bioinformatique, Analyse de données, Calcul scientifique
|Communaute=Communauté académique française
|Beneficiaire=Chercheurs, Enseignants-chercheurs, Doctorants
|Relation=IBiSA, GenOuest, IFB, SFR Santé François Bonamy, GLiCID
}}
}}

Dernière version du 21 août 2024 à 15:09

  BiRD
Type de service Plateforme de calcul
Statut En production
Autres noms Plateforme de Bioinformatique de Nantes
URL https://pf-bird.univ-nantes.fr
Contact pf-bird@univ-nantes.fr
Localisation Nantes
Structure d'appartenance Institut du thorax
Tutelles Inserm, CNRS, Nantes Université


Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :


Chargement de la carte...




BiRD conseille, propose et développe des services bioinformatiques : soutien à l'analyse des données de séquençage à haut débit, c'est-à-dire la détection des variants, l'étude du transcriptome et maintenant l'analyse des microbiotes. À cette fin, elle travaille conjointement avec le centre GenoA, qui gère la préparation des bibliothèques et les projets de séquençage.

Pour toutes ces applications, BiRD possède une expertise dans l'analyse de données à grande échelle et développe des pipelines d'analyse bioinformatique dédiés afin de standardiser l'analyse des données brutes jusqu'à l'interprétation biologique.

Ces services sont soutenus par une infrastructure de calcul et de stockage dédiée, accessible à distance par plusieurs services et ouverte à la communauté scientifique quelle que soit son institution.


____________________________________________


BiRD advises, proposes and develops bioinformatics services: support for high throughput sequencing data analysis, i.e. variant detection, transcriptome study and now microbiote analysis. To this end, BiRD works jointly with the GenoA core facility, which handles library preparation and sequencing projects.

For all these applications, BiRD has expertise in large-scale data analysis and develops dedicated bioinformatics analysis pipelines to standardize analysis from raw data to biological interpretation.

These services are supported by a dedicated computing and storage infrastructure, remotely accessible through several services and open to the scientific community regardless of its institution.


Domaines scientifiques :Vie & Santé


LS7 Prévention, diagnostic et traitement des maladies humaines Thématique et/ou mots clés :

  • Plateforme de bioinformatique
  • Analyse de données
  • Calcul scientifique

Type de données :

Communauté d'utilisateurs : Communauté académique française Usagers et bénéficiaires :Chercheurs, Enseignants-chercheurs, Doctorants


Conditions d'usage :

Conditions tarifaires :

Certification/Label :

Conditions générales d'utilisation :

BiRD est en lien avec les services et structures

IBiSA, GenOuest, IFB, SFR Santé François Bonamy, GLiCID



Services proposés par la structure d'appartenance
StructureServices proposés
Institut du thoraxBiRD