BAliBASE

  BAliBASE

Type de service	Plateforme d'accès
Statut	En production
Nom développé	Benchmark Alignment dataBASE
URL	http://lbgi.fr/balibase/
Contact	thompson@unistra.fr
Localisation	Strasbourg
Structure d'appartenance	IGBMC
Tutelles	CNRS, Inserm, Université de Strasbourg
Identifiants
re3data	10.17616/R31NJMHE

Cycle de vie des donnéesL'affichage de cette propriété évolue. Pour plus d'informations vous pouvez consulter la page suivante : https://cat.opidor.fr/index.php/Description_d%27un_service

Documentation

Conservation

Réutilisation

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BAliBASE est une base de données qui contient des alignements de séquences multiples de haute qualité, construits manuellement et accompagnés d'annotations détaillées. Les alignements sont tous basés sur des superpositions structurelles tridimensionnelles, à l'exception des séquences transmembranaires.

Les utilisateurs peuvent :

• Consulter une liste de tous les alignements
• Télécharger la base de données complète par ftp
• Obtenir le programme "c" pour comparer un alignement test avec la référence BAliBASE,
• Consulter les résultats d'une étude comparative de plusieurs programmes d'alignement multiple, en utilisant les ensembles de référence BAliBASE.

Domaines scientifiques :Vie & Santé

LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes; LS3 Biologie cellulaire, développement, cellules souches et régénération Thématique et/ou mots clés :

• Alignement
• Séquence transmembranaire
• Bioinformatique
• Permutation circulaire

Type de données :Base de données

Périmètre de communauté : ESR, international

Usagers et bénéficiaires :chercheur, enseignant-chercheur, doctorant

Conditions d'usage : Accès libre. Le code source de BAliBASE est disponible gratuitement.

Conditions tarifaires : Accès gratuit

Certification/Label :

Conditions générales d'utilisation :

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
IGBMC	ICI BAliBASE GenomEast

Enseignement Supérieur et Recherche