Plateforme GENOMER

  Plateforme GENOMER

Type de service	Plateforme d'acquisition
Statut	En production
Nom développé	Genomer - Plateforme de génomique
Autres noms
URL	www.sb-roscoff.fr/genomer
Contact	pf-genomer@sb-roscoff.fr
Localisation	Roscoff
Structure d'appartenance	SBR, OSU STAMAR, EMBRC France
Tutelles	Sorbonne Université, CNRS

Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :

Planification

Collecte

Analyse

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Les missions de la Plateforme Genomer sont de :

• mettre à disposition des équipements performants, conseiller et assurer la formation des utilisateurs : Mise A Disposition d’équipements-MAD

• proposer un service d’accompagnement adapté pour la réalisation de projets de recherche : Conduite de Projet en Génomique-CPG.

Elle fait partie intégrante de l’axe Biogenouest Génomique. Ce réseau a pour but de mettre à disposition de la communauté scientifique, les outils nécessaires pour mener à bien des projets de séquençage et/ou de genotypage à petit, moyen, et haut débit, dans les domaines de la mer, de l’agronomie et de la santé.

La plateforme Genomer (composante de Biogenouest Génomique) est labellisée IBiSA depuis avril 2012.

La plateforme accueille des chercheurs dans le cadre de collaboration et de l’infrastructure nationale en Biologie et Santé : EMBRC FR.

Domaines scientifiques :Vie & Santé

LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions; LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes; LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution Thématique et/ou mots clés :

• Séquençage génomique
• Génomique environnementale
• Métagénomique
• Métabarcoding

Type de données :Données génomiques (FASTA, FASTQ)

Communauté d'utilisateurs : Laboratoires académiques Usagers et bénéficiaires :Communauté scientifique de Biogenouest

Conditions d'usage : Il est demandé de renseigner une « Fiche Contact » qui sera analysé par l’équipe de la plateforme Genomer pour examiner la faisabilité du projet. Quand le projet est suffisamment abouti et clairement défini, une fiche d'engagement Conduite de Projet en Génomique (CPG) et un devis sont édités. Le projet débute dès réception des documents (fiche d'engagement signée et bon de commande).

Conditions tarifaires : Payant

Certification/Label :IBiSA (https://www.ibisa.net/plateformes/biogenouest-genomique-293.html)

Conditions générales d'utilisation :

Plateforme GENOMER est en lien avec les services et structures

Biogenouest

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
EMBRC France	Plateforme GENOMER PBM
OSU STAMAR	EcoTaxa MICA Plateforme GENOMER ABiMS PBM
SBR	ABiMS SulfAtlas GitLab Station Biologique de Roscoff Plateforme GENOMER

Le GIS Infrastructure en Biologie Santé et Agronomie a pour vocation de structurer et de financer les infrastructures de recherche en sciences de la vie, en mutualisant leurs moyens.