« POPS (IPS2) » : différence entre les versions
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{{Infobox Service | {{Infobox Service | ||
|Logo=87 logoPF.png | |Logo=87 logoPF.png | ||
|NomService=IPS2 | |NomService=POPS (IPS2) | ||
|TypeService=Plateforme | |TypeService=Plateforme d'acquisition | ||
|StatutService=En production | |StatutService=En production | ||
|NomDéveloppé=Plateforme transcriptOmique de l’iPS2 | |||
|NomAlternatif=Plateforme transcriptOmique de l’iPS2 | |NomAlternatif=Plateforme transcriptOmique de l’iPS2 | ||
|UrlService=https://www.pluginlabs-universiteparissaclay.fr/fiche/ips2-plateforme-de-transcriptomique-pops/ | |UrlService=https://www.pluginlabs-universiteparissaclay.fr/fiche/ips2-plateforme-de-transcriptomique-pops/ | ||
|ContactMel= | |ContactMel=etienne.delannoy[at]ips2.universite-paris-saclay.fr | ||
|Localisation=Gif-sur-Yvette | |Localisation=Gif-sur-Yvette | ||
|StructureAppartenance=IPS2 | |StructureAppartenance=IPS2 | ||
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}} | }} | ||
{{Service | {{Service | ||
|Description='''POPS''' est la plateforme de transcriptomique des plantes de Paris-Saclay | |Description='''POPS''' est la plateforme de transcriptomique des plantes de Paris-Saclay. Elle offre une expertise pour le développement de l’'''analyse du transcriptome chez les végétaux par l’utilisation du séquençage à haut débit d’ARN (RNA-Seq)'''. Leur savoir-faire s’étend '''de la préparation des échantillons à l’analyse bioinformatique et statistiques des données.''' | ||
Elle propose : | Elle propose : | ||
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|Thematique=Plateforme de bioinformatique, Organismes végétaux, RNAseq, Transcriptomique, SingleCell, Microtranscriptomique, Séquençage ARN | |Thematique=Plateforme de bioinformatique, Organismes végétaux, RNAseq, Transcriptomique, SingleCell, Microtranscriptomique, Séquençage ARN | ||
|TypeDonnee=Données génomiques, Données de séquençage | |TypeDonnee=Données génomiques, Données de séquençage | ||
|Communaute=Communauté scientifique en génomique | |||
|Beneficiaire=Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Biologistes | |Beneficiaire=Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Biologistes | ||
|ConditionUsage=Pour soumettre un projet à la plateforme POPS, il est possible d'envoyer un mail à pops.ips2@universite-paris-saclay.fr en décrivant brièvement le projet. Après une première prise de contact permettant d’étudier la faisabilité du projet, une réunion téléphonique ou sur site sera proposée, afin de définir les objectifs et les questions biologiques, d’établir un plan d’expérience... Les collaborateurs et experts concernés de la plateforme seront présents à cette réunion. Le délai de réalisation des projets varie selon le type d’analyse, le nombre d’échantillons et le taux d’occupation de la plateforme. | |ConditionUsage=Pour soumettre un projet à la plateforme POPS, il est possible d'envoyer un mail à pops.ips2@universite-paris-saclay.fr en décrivant brièvement le projet. Après une première prise de contact permettant d’étudier la faisabilité du projet, une réunion téléphonique ou sur site sera proposée, afin de définir les objectifs et les questions biologiques, d’établir un plan d’expérience... Les collaborateurs et experts concernés de la plateforme seront présents à cette réunion. Le délai de réalisation des projets varie selon le type d’analyse, le nombre d’échantillons et le taux d’occupation de la plateforme. | ||
|Certification=ISO 9001:2015; https://www.france-genomique.org/plateformes-et-equipements/plateforme-sequencage-pops-paris-saclay/ | |Certification=ISO 9001:2015; https://www.france-genomique.org/plateformes-et-equipements/plateforme-sequencage-pops-paris-saclay/, | ||
IBiSA; https://www.ibisa.net/trouver-plateforme/ | IBiSA; https://www.ibisa.net/trouver-plateforme/ | ||
|Relation=France Génomique | |Relation=France Génomique | ||
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