« Go@l » : différence entre les versions

Go@l
Type de service	Plateforme d'acquisition
Statut	En production
Nom développé	GenOmique at Lille
Autres noms
URL	https://ums-plbs.univ-lille.fr/les-plateformes-constitutives/genomique
Contact	genomique-plbs@univ-lille.fr
Localisation	Lille
Structure d'appartenance	PLBS
Tutelles	Université de Lille, Inserm, CHU de Lille, CNRS, Institut Pasteur de Lille

Dernière version du 18 avril 2025 à 15:21

La plateforme Go@l offre son expertise en étude de faisabilité et en montage de projets d’analyse génomique pour des projets à moyen/haut débit.

Elle comprend deux plateaux spécialisés :

Le plateau Transcriptomics and Applied Genomics (TAG)
Le plateau de Génomique Fonctionnelle et Structurale (GFS)

La plateforme développe son expertise sur les approches suivantes :

Génomique « génomes entiers » : WGS, WES, amplicon-seq, Tn-seq, CGH-arrays.
Transcriptomique : RNA-seq, sRNA-seq, dRNA-seq, NGS-RACE, qRT-PCR, RNA-seq full-length, micro-arrays, DGE, single-cell.
Métagénomique : amplicon-seq ciblé 16S-ITS.

De la réalisation des expérimentations à l’accompagnement des équipes, la plateforme apporte son expertise sur le traitement des données générées :

Assemblage, caractérisation et annotation génomiques, détection et annotation des variants, étude de transmission mendélienne.
Analyse différentielle d’expression, analyse non supervisée.
Assignation taxonomique, évaluation diversité (α et β), mesure de dysbiose.

Domaines scientifiques :Vie & Santé

LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes Thématique et/ou mots clés :

Plateforme de génomique
Transcriptomique
Single cell
RNA-Seq
Small RNA-Seq
Biostatistique
DGE

Type de données :Données de séquençage, Données génomiques

Communauté d'utilisateurs : Communautés scientifiques académiques et médicales et laboratoires privés dans le domaine de la génomique. Usagers et bénéficiaires :Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Médecins

Conditions d'usage : La soumission des projets se fait par l’intermédiaire du portail internet de France Génomique

Conditions tarifaires :

Certification/Label :IBiSA (http://www.ibisa.net/plateformes/)

Conditions générales d'utilisation :

Go@l est en lien avec les services et structures

France Génomique, Transcriptomique et de Génomique Appliquée

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
PLBS	Transcriptomique et Génomique Appliquée Bilille Go@l

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 |TypeService=Plateforme d'acquisition
 |StatutService=En production
+|NomDéveloppé=GenOmique at Lille
 |NomAlternatif=GenOmique at Lille
 |UrlService=https://ums-plbs.univ-lille.fr/les-plateformes-constitutives/genomique
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 Elle comprend deux plateaux spécialisés :
-* Le '''plateau Transcriptomics and Applied Genomics (TAG)''', localisé à l’Institut Pasteur de Lille, est spécialisé dans les applications de microbiologie.
+* Le plateau Transcriptomics and Applied Genomics (TAG)
-* Le p'''lateau de Génomique Fonctionnelle et Structurale (GFS)''', intégré dans les locaux du Centre de Biologie Pathologie Génétique du CHU de Lille, développe son expertise notamment au service de la génomique humaine associée à des pathologies ciblées et l'étude de modèles animaux.
+* Le plateau de Génomique Fonctionnelle et Structurale (GFS)
 La plateforme développe son expertise sur les approches suivantes :
-* Génomique « génomes entiers » : WGS, WES, amplicon-seq, Tn-seq, CGH-arrays.
+* '''Génomique « génomes entiers »''' : WGS, WES, amplicon-seq, Tn-seq, CGH-arrays.
-* Transcriptomique : RNA-seq, sRNA-seq, dRNA-seq, NGS-RACE, qRT-PCR, RNA-seq full-length, micro-arrays, DGE, single-cell.
+* '''Transcriptomique''' : RNA-seq, sRNA-seq, dRNA-seq, NGS-RACE, qRT-PCR, RNA-seq full-length, micro-arrays, DGE, single-cell.
-* Métagénomique : amplicon-seq ciblé 16S-ITS.
+* '''Métagénomique''' : amplicon-seq ciblé 16S-ITS.
 De la réalisation des expérimentations à l’accompagnement des équipes, la plateforme apporte son expertise sur le traitement des données générées :
-* Assemblage, caractérisation et annotation génomiques, détection et annotation des variants, étude de transmission mendélienne.
+* '''Assemblage, caractérisation et annotation génomiques, détection et annotation des variants, étude de transmission mendélienne'''.
-* Analyse différentielle d’expression, analyse non supervisée.
+* '''Analyse différentielle d’expression''', analyse non supervisée.
-* Assignation taxonomique, évaluation diversité (α et β), mesure de dysbiose.
+* '''Assignation taxonomique, évaluation diversité (α et β), mesure de dysbiose'''.
 |Discipline=Vie & Santé
 |SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes
-|Thematique=Plateforme de génomique
+|Thematique=Plateforme de génomique, Transcriptomique, Single cell, RNA-Seq, Small RNA-Seq, Biostatistique, DGE
-|TypeDonnee=Données de séquençage
+|TypeDonnee=Données de séquençage, Données génomiques
 |Communaute=Communautés scientifiques académiques et médicales et laboratoires privés dans le domaine de la génomique.
 |Beneficiaire=Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Médecins
-|Certification=IBiSA; https://www.ibisa.net/plateformes/genomic-at-lille-go-l-625.html
+|ConditionUsage=La soumission des projets se fait par l’intermédiaire du portail internet de France Génomique
-|Relation=France Génomique
+|Certification=IBiSA; http://www.ibisa.net/plateformes/
-|StatutPage=Page en construction
+|Relation=France Génomique, Transcriptomique et de Génomique Appliquée
 }}