Norine

  Norine

Type de service	Entrepôt de données
	Caractéristiques de l'entrepôt Type d’entrepôt Disciplinaire Type de restriction Soumis à la création d'un compte Hébergement des données France Identifiant pérenne ✓ Identifiants fournis DOI Identifiants utilisés Formats de fichiers acceptés NCBI Taxonomy, SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry Specification Format) Schéma de métadonnées XML, JSON Licence des jeux de données CC BY-NC-SA 4.0 pour la BD Conditions d'accès aux données Ouvert Modération / Curation Processus de validation, tous les contributeurs sont curateurs Volumétrie maximale définie Politique de conservation des données Ouvert depuis 2006 Interopérabilité machine API REST Versioning
Statut	En production
Autres noms	Nonribosomal peptides
URL	https://bioinfo.cristal.univ-lille.fr/norine/
Contact	norine_at_univ-lille.fr
Localisation	Villeneuve d'Ascq
Structure d'appartenance	CRIStAL, Bilille
Tutelles	CNRS, Université de Lille

Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :

Analyse

Documentation

Conservation

Exposition

Réutilisation

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NORINE est une plateforme qui comprend une base de données de peptides nonribosomaux ainsi que des outils pour leur analyse. Norine propose des outils dédiés : visualiseur et éditeur de graphes 2D, comparaison de PNR, MyNorine, un outil permettant de soumettre facilement de nouveaux peptides nonribosomiques, Smiles2monomers (s2m), un outil qui déchiffre la structure monomérique des polymères à partir de leur structure chimique.

Pour chaque peptide, la base de données stocke sa structure ainsi que diverses annotations telles que l'activité biologique, les organismes producteurs, les références bibliographiques, etc. La base de données peut être interrogée afin de rechercher des peptides à partir de leurs annotations ou de leurs structures monomères. Dans ce dernier cas, l'utilisateur peut spécifier soit la composition, la structure complète ou un modèle structurel (incluant éventuellement des "monomères non définis") du peptide recherché.

Ce projet résulte d’une étroite collaboration entre le groupe de recherche en bioinformatique Bonsai du CRIStAL (Centre de Recherche en Informatique, Signal et Automatique de Lille, et l’équipe NRPS du laboratoire ProBioGem (Laboratoire des Procédés Biologiques Génie Enzymatique et Microbien).

Domaines scientifiques :Vie & Santé

LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions; LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes Thématique et/ou mots clés :

• Bioinformatique structurale

Type de données :Peptides non-ribosomiques (NRP)

Communauté d'utilisateurs : Communautés de recherche en biologie, biochimie, phytochimie, pharmacologie, biologie marine, etc. Usagers et bénéficiaires :

Conditions d'usage : Accès libre et gratuit depuis le site web de la resource, licence CC-BY-NC-SA-4.0

Conditions tarifaires : Accès gratuit

Certification/Label :ELIXIR Data Resources (https://elixir-europe.org/services/tag/data-resources?page=2)

Conditions générales d'utilisation : https://bioinfo.cristal.univ-lille.fr/norine/terms.jsp

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
Bilille	Norine
CRIStAL	Norine

code unique assigné à un objet de façon permanente (DOI, Handle…).

Digital Object Identifier

Ensemble structuré d’informations décrivant, expliquant et localisant une ressource physique ou numérique

autorisation par laquelle l'auteur d’une œuvre de l’esprit concède certains des droits que lui offre le droit d'auteur quant à l'utilisation, à la modification, à la rediffusion et à la réutilisation de l'œuvre.

la curation de données consiste à trier, organiser et mettre en forme un ensemble de données, de manière à le rendre exploitable.

capable de communiquer et d’opérer avec d’autres systèmes d’information.

Centre National de la Recherche Scientifique