Norine

De Cat OPIDoR
Norine
Type de service Entrepôt de données
Statut En production
Autres noms Nonribosomal peptides
URL https://bioinfo.cristal.univ-lille.fr/norine/
Contact norine_at_univ-lille.fr
Localisation Villeneuve d'Ascq
Structure d'appartenance CRIStAL, Bilille
Tutelles CNRS, Université de Lille


Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :


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NORINE est une plateforme qui comprend une base de données de peptides nonribosomaux ainsi que des outils pour leur analyse. Norine propose des outils dédiés : visualiseur et éditeur de graphes 2D, comparaison de PNR, MyNorine, un outil permettant de soumettre facilement de nouveaux peptides nonribosomiques, Smiles2monomers (s2m), un outil qui déchiffre la structure monomérique des polymères à partir de leur structure chimique.

Pour chaque peptide, la base de données stocke sa structure ainsi que diverses annotations telles que l'activité biologique, les organismes producteurs, les références bibliographiques, etc. La base de données peut être interrogée afin de rechercher des peptides à partir de leurs annotations ou de leurs structures monomères. Dans ce dernier cas, l'utilisateur peut spécifier soit la composition, la structure complète ou un modèle structurel (incluant éventuellement des "monomères non définis") du peptide recherché.

Ce projet résulte d’une étroite collaboration entre le groupe de recherche en bioinformatique Bonsai du CRIStAL (Centre de Recherche en Informatique, Signal et Automatique de Lille, et l’équipe NRPS du laboratoire ProBioGem (Laboratoire des Procédés Biologiques Génie Enzymatique et Microbien).


Domaines scientifiques :Vie & Santé


LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions; LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes Thématique et/ou mots clés :

  • Bioinformatique structurale

Type de données :

Communauté d'utilisateurs : Usagers et bénéficiaires :


Conditions d'usage : Accès libre et gratuit depuis le site web de la resource, licence CC-BY-NC-SA-4.0

Modèle économique : Accès gratuit

Certification/Label :ELIXIR Data Resources (https://elixir-europe.org/services/tag/data-resources?page=2)

Conditions générales d'utilisation : https://bioinfo.cristal.univ-lille.fr/norine/terms.jsp



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