PNDB

PNDB

Autres noms	Pôle national de données de biodiversité, Pôle de données d’observation pour la recherche sur la biodiversité, ex ECOSCOPE
URL	https://www.pndb.fr
Tutelles	MNHN, BRGM, Cirad, CNRS, Ifremer, INRAE, OFB, FRB, AgroParisTech, Université des Antilles, Université de Bretagne Occidentale, Université Grenoble Alpes, Université de Lille, Université de Montpellier, Université Paris-Saclay, Université Perpignan Via Domitia, Université de Poitiers, Université de Rennes, Sorbonne Université
Infrastructure nationale	IR
Type d'infrastructure	Monosite
Localisation	Paris

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Le Pôle national de données de biodiversité, PNDB est un pôle de données au service des scientifiques produisant, gérant et analysant des données de biodiversité. Il a pour objet l’accès aux données d’observation, de collection et d’expérimentation, en lien avec le réseau européen EU-BON (Biodiversity Observator y Network) et l’Organisation Internationale GBIF (Global Biodiversity Information Facility). Il permet aussi la mise en réseau des observatoires de recherche de la biodiversité. Le PNDB est une e-infrastructure de recherche inscrite à la feuille de route nationale des infrastructures de recherche du MESR depuis mars 2018.

Les missions du PNDB sont :

1. fournir un accès aux données, à des services associés et à des produits dérivés des analyses ;
2. promouvoir l’animation scientifique pour identifier les lacunes et favoriser l’émergence de dispositifs portés par des communautés d’utilisateurs et producteurs ;
3. faciliter le partage des pratiques avec les autres communautés de recherche, favoriser le partage des données et leur réutilisation, s’insérer dans la réflexion de la future infrastructure Système Terre ;
4. favoriser la cohérence nationale et internationale relatives à l’accès et à l’exploitation des données de recherche sur la biodiversité, à la promotion de produits et services.

Une partie des publications issues de projets utilisant l’infrastructure est en accès ouvert. Les codes sources produits par l’infrastructure sont ouverts sur une forge logicielle https://github.com/earnaud/MetaShARK-v2. Infrastructure dotée d’une politique de données FAIR en application.

Domaines scientifiques :

Sciences & Technologies, Vie & Santé

PE10 Sciences du Système Terre LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution

Thématique et/ou mots clés :

• Biodiversité
• Terre solide et environnement
• Système Terre et environnement

Certification/Label :

Centre de référence thématique (https://recherche.data.gouv.fr/fr/page/centres-de-reference-thematiques-expertises-par-domaine-scientifique)

Offre de services de PNDB

• MetaShARK (Outils de gestion des données)
• PNDB : Portail de données métadonnées (Plateforme d'accès)
• Galaxy-E (Plateforme de calcul)

PNDB est en lien avec les services et structures

AllEnvi, GBIF France, INPN, Phenome-Emphasis France, eLTER-France RZA, SINP, PatriNat, DATA TERRA, SIE, SIMM, SIB, e-RECOLNAT, FRB, AnaEE-France

Portée internationale de PNDB

GEO BON (https://geobon.org)

iBOL (https://ibol.org)

LifeWatch ERIC (https://www.lifewatch.eu)

Knowledge Network for Biocomplexity (https://knb.ecoinformatics.org)

OCEANOMICS (http://www.oceanomics.eu/)

Consortium IndexMed (http://www.indexmed.eu/)

GBIF (https://www.gbif.org)

GO FAIR (https://www.go-fair.org)

RDA (https://www.rd-alliance.org)

DataOne (https://www.dataone.org)

Centre National de la Recherche Scientifique

Ministère de l’Enseignement supérieur et de la Recherche

Findable, Accessible, Interoperable, Reusable : principes appliqués aux données pour les rendre faciles à trouver, accessibles, interopérables et réutilisables.