« ProFI » : différence entre les versions

ProFI
Autres noms	Infrastructure Française de protéomique. Proteomics French Infrastructure, Fédération de Recherche nationale ProFI, FR 2048
URL	http://www.profiproteomics.fr/
Tutelles	CNRS, CEA, INSERM
Identifiants
RNSR	202123709J
Infrastructure nationale	IR
Type d'infrastructure	Distribuée
Localisation	Grenoble

Dernière version du 10 novembre 2023 à 11:37

ProFI - Proteomics French Infrastructure, est l’infrastructure nationale de protéomique, qui s’appuie les trois principales plateformes protéomiques françaises (Grenoble, Strasbourg et Toulouse). Ses missions s’articulent autour de 3 axes :

La structuration et l’analyse des données de spectrométrie de masse par une infrastructure logicielle commune
La structuration et l’analyse des données de spectrométrie de masse par une infrastructure logicielle commune
L’analyse protéomique quantitative d’échantillons biologiques
L’analyse ciblée de biomarqueurs protéiques dans les fluides et tissus biologiques.

ProFi mène également une action de formation destinée à irriguer l'ensemble de la communauté protéomique française ; par exemple pour permettre aux opérateurs des plateformes protéomiques de prendre en mains l'environnement logiciel qui a été développé par l'infrastructure.

ProFI développe les approches de détection et quantification des protéines et de leurs modifications post-traductionnelles. ProFI offre ses services aux laboratoires académiques et aux industriels, en particulier dans les secteurs pharmaceutique, agroalimentaire et de la bio production.

Une partie des publications issues de projets utilisant l’infrastructure est en accès ouvert. Les codes sources produits par l’infrastructure sont ouverts sur une forge logicielle https://github.com/profiproteomics. Les données validées et décrites sont publiées sur un entrepôt de données www.proteomexchange.org

Domaines scientifiques :

Vie & Santé

LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes

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 * La structuration et l’analyse des données de spectrométrie de masse par une infrastructure logicielle commune
 * La structuration et l’analyse des données de spectrométrie de masse par une infrastructure logicielle commune
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 ProFi mène également une action de formation destinée à irriguer l'ensemble de la communauté protéomique française ; par exemple pour permettre aux opérateurs des plateformes protéomiques de prendre en mains l'environnement logiciel qui a été développé par l'infrastructure.
-ProFi développe les approches de détection et quantification des protéines et de leurs modifications post-traductionnelles. ProFi offre ses services aux laboratoires académiques et aux industriels, en particulier dans les secteurs pharmaceutique, agroalimentaire et de la bio production.
+ProFI développe les approches de détection et quantification des protéines et de leurs modifications post-traductionnelles. ProFI offre ses services aux laboratoires académiques et aux industriels, en particulier dans les secteurs pharmaceutique, agroalimentaire et de la bio production.
-L'accès aux données produites par l'infrastructure est restreint : dans l’attente de la publication des résultats, les données sont uniquement accessibles aux producteurs de données et au(x) partenaire(s) ayant soumis les échantillons (sur demande).
+Une partie des publications issues de projets utilisant l’infrastructure est en accès ouvert. Les codes sources produits par l’infrastructure sont ouverts sur une forge logicielle https://github.com/profiproteomics. Les données validées et décrites sont publiées sur un entrepôt de données [http://www.proteomexchange.org www.proteomexchange.org]
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 [[Catégorie:Feuille de route nationale des Infrastructures de recherche]] [[Catégorie:IR]]
+[[Catégorie:Catalogue CNRS Biologie]]