« TEFOR Paris Saclay » : différence entre les versions

De Cat OPIDoR
m (Remplacement de texte — « Physiologie, physiopathologie et endocrinologie » par « LS4 Physiologie de la santé, de la maladie et du vieillissement »)
m (Remplacement de texte — « Génétique, "omiques", bioinformatique et biologie des systèmes » par « LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes »)
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|Description=En collaboration avec ses partenaires au sein de l'infrastructure TEFOR, '''Tefor Paris Saclay (TPS)''' '''développe des méthodes de phénotypage en 3D d’échantillons transparisés et marqués'''. Avec d’autres partenaires dans TEFOR et des collaborateurs internationaux, le TPS développe des stratégies d’archivage des volumes imagés dans des bases de données, notamment sous forme d’atlas digitaux. Ces stratégies sont développées en parallèle chez le poisson-zèbre et la drosophile et coordonnées par le TPS.  Il s’attache également à développer ou adapter des solutions de visualisation des données 3D de grandes tailles gratuites et faciles d’utilisation. Le TPS propose des services standards de phénotypage intégral de larves de poissons-zèbre ou de cerveaux adultes entiers à l’échelle sub-cellulaire ainsi que le service adapté de traitement des données. Il développe des stratégies automatiques d’analyse volumétrique de différents organes par segmentation des volumes d’intérêt pour des projets de criblage à haut contenu.
|Description=En collaboration avec ses partenaires au sein de l'infrastructure TEFOR, '''Tefor Paris Saclay (TPS)''' '''développe des méthodes de phénotypage en 3D d’échantillons transparisés et marqués'''. Avec d’autres partenaires dans TEFOR et des collaborateurs internationaux, le TPS développe des stratégies d’archivage des volumes imagés dans des bases de données, notamment sous forme d’atlas digitaux. Ces stratégies sont développées en parallèle chez le poisson-zèbre et la drosophile et coordonnées par le TPS.  Il s’attache également à développer ou adapter des solutions de visualisation des données 3D de grandes tailles gratuites et faciles d’utilisation. Le TPS propose des services standards de phénotypage intégral de larves de poissons-zèbre ou de cerveaux adultes entiers à l’échelle sub-cellulaire ainsi que le service adapté de traitement des données. Il développe des stratégies automatiques d’analyse volumétrique de différents organes par segmentation des volumes d’intérêt pour des projets de criblage à haut contenu.
|Discipline=Vie & Santé
|Discipline=Vie & Santé
|SousDisciplineVie&Sante=Génétique, "omiques", bioinformatique et biologie des systèmes; LS4 Physiologie de la santé, de la maladie et du vieillissement; Sciences de la vie appliquées, biotechnologie, et ingénierie moléculaire et des biosystèmes
|SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes; LS4 Physiologie de la santé, de la maladie et du vieillissement; Sciences de la vie appliquées, biotechnologie, et ingénierie moléculaire et des biosystèmes
|Thematique=poisson-zèbre
|Thematique=poisson-zèbre
|Certification=IBiSA;https://www.ibisa.net/trouver-plateforme/
|Certification=IBiSA;https://www.ibisa.net/trouver-plateforme/
}}
}}

Version du 11 mars 2022 à 14:44

TEFOR Paris Saclay
Type de service Plateforme d'acquisition
Statut En production
Autres noms Trangénèse pour les Etudes Fonctionnelles chez les ORganismes modèles Paris-Saclay, TPS,
URL https://tps.tefor.net/
Contact https://tps.tefor.net/#contact
Localisation Gif-sur-Yvette
Structure d'appartenance TEFOR, Celphedia
Tutelles CNRS, Université Paris-Saclay, INRAE
Identifiants
RNSR 201922946N


Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :


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En collaboration avec ses partenaires au sein de l'infrastructure TEFOR, Tefor Paris Saclay (TPS) développe des méthodes de phénotypage en 3D d’échantillons transparisés et marqués. Avec d’autres partenaires dans TEFOR et des collaborateurs internationaux, le TPS développe des stratégies d’archivage des volumes imagés dans des bases de données, notamment sous forme d’atlas digitaux. Ces stratégies sont développées en parallèle chez le poisson-zèbre et la drosophile et coordonnées par le TPS. Il s’attache également à développer ou adapter des solutions de visualisation des données 3D de grandes tailles gratuites et faciles d’utilisation. Le TPS propose des services standards de phénotypage intégral de larves de poissons-zèbre ou de cerveaux adultes entiers à l’échelle sub-cellulaire ainsi que le service adapté de traitement des données. Il développe des stratégies automatiques d’analyse volumétrique de différents organes par segmentation des volumes d’intérêt pour des projets de criblage à haut contenu.


Domaines scientifiques :Vie & Santé


LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes; LS4 Physiologie de la santé, de la maladie et du vieillissement; Sciences de la vie appliquées, biotechnologie, et ingénierie moléculaire et des biosystèmes« Sciences de la vie appliquées, biotechnologie, et ingénierie moléculaire et des biosystèmes » n’est pas dans la liste (LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes, LS3 Biologie cellulaire, du développement et régénérative, LS4 Physiologie de la santé, de la maladie et du vieillissement, LS5 Neurosciences et troubles du système nerveux, LS6 Immunité, infection et immunothérapie, LS7 Prévention, diagnostic et traitement des maladies humaines, LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution, LS9 Biotechnologie et ingénierie des biosystèmes, LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions) des valeurs autorisées pour la propriété « Est sous discipline de Vie & Santé ». Thématique et/ou mots clés :

  • poisson-zèbre

Type de données :

Communauté d'utilisateurs : Usagers et bénéficiaires :


Conditions d'usage :

Conditions tarifaires :

Certification/Label :IBiSA (https://www.ibisa.net/trouver-plateforme/)

Conditions générales d'utilisation :



Services proposés par la structure d'appartenance
StructureServices proposés
CelphediaPHENOMIN-ICS
PHENOMIN-TAAM
PHENOMIN-CIPHE
TEFOR Paris Saclay
TEFOR Fly Facility
TEFOR-TACGENE
AniRA
Chronobiotron
TRIP
SdP
SILABE
MPRC
Anexplo
TEFORTEFOR Paris Saclay
TEFOR Fly Facility
TEFOR-TACGENE