MICA

MICA

Type de service	Plateforme d'acquisition
Statut	En production
Autres noms	Microscopie Imagerie Cytométrie Azur
URL	http://mica.unice.fr
Contact	mica@unice.fr
Localisation	Villefranche sur Mer, Nice, Biot, Valbonne
Structure d'appartenance
Tutelles	Université Côte d'Azur, Sorbonne Université, CNRS, Inserm, Inrae, Inria

Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :

Collecte

Analyse

Stockage

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Microscopie Imagerie Cytométrie Azur (MICA) est une plateforme multi-sites et multi-tutelles, labellisée par le GIS IBISA depuis 2010. Elle est ouverte à l'ensemble des structures publiques et privées sans aucune condition thématique, institutionnelle ou géographique.

MICA mutualise les plateaux techniques en imagerie et microscopie de 8 partenaires en recherche académique sur la Côte d'Azur :

• Institut de Pharmacologie Moléculaire et Cellulaire (IPMC, UMR7275 CNRS / UniCA) - Sophia-Antipolis
• Institut de Biologie de Valrose (iBV, UMR7277 CNRS - Inserm U1091- UniCA) - Nice
• Centre Méditerranéen de Médecine Moléculaire (C3M, UMR 1065 Inserm / UniCA) - Nice
• Institut de la Mer de Villefranche (IMEV, CNRS/ Sorbonne Université) - Villefranche sur Mer
• Centre Commun de Microscopie Appliquée (CCMA, UniCA) - Nice
• Institut de Recherche sur le Cancer et le Vieillissement (IRCAN,UMR CNRS 7284- Inserm U1081-UniCA) - Nice
• Institut Sophia Agrobiotech PACA INRAE (UMR ISA INRAE1355-UniCA-CNRS7254 Sophia-Antipolis)
• L'équipe projet Morpheme (INRIA/I3S/iBV).

MICA c'est : 48 équipements spécialisés en microscopie (électronique, photonique, force atomique, micro-dissection laser) 11 équipements de cytométrie en flux (analyseur et trieur de cellules) 26 techniciens, ingénieurs et chercheurs porteurs de l'expertise scientifique et technique de la plateforme Au service de la communauté scientifique académique et privée

MICA assiste et forme les équipes de recherche sur différentes techniques et méthodologies d’imagerie : analyse ultra-structurale par microscopie électronique, imagerie photonique super-résolue ou à force atomique, imagerie macroscopique à feuille de lumière, analyse statistique, tri de populations cellulaires et d’organismes planctoniques... L’originalité de la plateforme réside dans sa capacité à accueillir sur les équipements, aussi bien des échantillons provenant d’insectes et de végétaux (hyménoptères, racine, feuilles, organes symbiotiques ou pathologiques) ou d’organismes marins (ascidie, plancton, méduse), que des échantillons cliniques (pièces anatomiques, tissus…).

La plateforme MICA adapte et développe à façon des approches techniques ou méthodologiques, depuis l’observation jusqu’à l’analyse d’images. Elle propose également un accès à la base de données de taxonomie Ecotaxa et à la base Omero de gestion de projets et d’édition d’images commune avec EMBRC France.

Cette Base de Données permet une gestion FAIR des images issues de la microscopie.

Domaines scientifiques :Sciences & Technologies, Vie & Santé

PE6 Sciences informatiques et informatique LS9 Biotechnologie et ingénierie des biosystèmes Thématique et/ou mots clés :

• Microscopie électronique
• Microscopie à force atomique
• Microscopie de fluorescence
• Microscopie confocale
• Super-résolution
• PALM
• STED
• TIRF
• FLIM
• Microscopie à feuille de lumière
• Cytométrie en flux
• Cytométrie spectrale
• Tri cellulaire
• Imagerie du plancton
• Taxonomie du plancton
• Analyse d’images quantitative

Type de données :Images de microscopies, données de la cytométrie en flux

Communauté d'utilisateurs : Tous les acteurs publics et privés suivant la charte IBiSA Usagers et bénéficiaires :Monde académique ou industriel

Politiques : Politique de données

Conditions d'usage : Contact des coordinateurs scientifiques via le courriel mica@unice.fr ou contact direct du site d'intérêt : https://univ-cotedazur.fr/mica/contacts

Conditions tarifaires : Prestations payantes, tarifs dépendant du périmètre de la demande et proportionnels à la durée de la tâche

Certification/Label :IBiSA (https://www.ibisa.net/plateformes/microscopie-imagerie-cote-azur-mica-254.html)

Conditions générales d'utilisation :

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
C3M	MICA
CCMA	MICA
IBV	MICA
IMEV	EcoTaxa MICA
IPMC	MICA
IRCAN	MICA
ISA	MICA

Centre National de la Recherche Scientifique

Groupement d'intérêt scientifique

Unité Mixte de Recherche

Findable, Accessible, Interoperable, Reusable : principes appliqués aux données pour les rendre faciles à trouver, accessibles, interopérables et réutilisables.