GenomeHubs

GenomeHubs

Type de service	Plateforme d'accès
Statut	En production
Autres noms	South Green Genome Hub Genome Hub
URL	https://www.southgreen.fr/genomehubs
Contact	gaetan.droc at cirad.fr
Localisation	Montpellier
Structure d'appartenance	South Green
Tutelles	Cirad, IRD, Inrae, SupAgro, Alliance Biodiversity international-CIAT

Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :

Analyse

Documentation

Exposition

Réutilisation

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Le South Green Genome Hub est un ensemble de portails communautaires spécifiques aux cultures qui permettent de gérer les ensembles de données génomiques en mettant l'accent sur les plantes tropicales et méditerranéennes. Actuellement développés sur la banane, le manioc, le cacao, le café, l'herbe, le riz et la canne à sucre, les hubs génomiques donnent accès à de multiples ensembles de données (par exemple, des assemblages, des informations sur les produits géniques, les voies métaboliques, les familles de gènes, la transcriptomique et les marqueurs génétiques).

Domaines scientifiques :Vie & Santé

Génétique, "omiques", bioinformatique et biologie des systèmes« Génétique, "omiques", bioinformatique et biologie des systèmes » n’est pas dans la liste (LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes, LS3 Biologie cellulaire, du développement et régénérative, LS4 Physiologie de la santé, de la maladie et du vieillissement, LS5 Neurosciences et troubles du système nerveux, LS6 Immunité, infection et immunothérapie, LS7 Prévention, diagnostic et traitement des maladies humaines, LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution, LS9 Biotechnologie et ingénierie des biosystèmes, LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions) des valeurs autorisées pour la propriété « Est sous discipline de Vie & Santé ». Thématique et/ou mots clés :

Type de données :

Communauté d'utilisateurs : Usagers et bénéficiaires :

Conditions d'usage :

Conditions tarifaires : Accès gratuit

Certification/Label :ELIXIR Data Resources (https://elixir-europe.org/services/tag/data-resources)

Conditions générales d'utilisation : https://banana-genome-hub.southgreen.fr/content/term-service

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
South Green	GenomeHubs