Galaxy-E

Galaxy-E

Type de service	Plateforme de calcul
Statut	En production
Autres noms	Plateforme collaborative d’accès et analyse de données en écologie
URL	https://ecology.usegalaxy.eu/
Contact	Coline Royaux, contact.pndb at mnhn.fr
Localisation	Concarneau
Structure d'appartenance	PNDB
Tutelles	MNHN UMS PatriNat (porteur), BRGM, CIRAD, CNRS, Ifremer, INRAE, OFB, FRB, AgroParisTech, Université des Antilles, UBO, UGA, Université de Lille, Université de Montpellier, Université Paris-Saclay, Université Perpignan Via Domitia, Université de Poitiers, Université de Rennes 1, Sorbonne université

Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :

Analyse

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Galaxy-E est une instance de Galaxy dédiée à l’analyse de données en Ecologie. Galaxy est une plateforme web pour le partage et le traitement des données de recherche. Elle permet un accès facilité à l’analyse cloud et au Calcul Haute Performance par l’interfaçage de n’importe quel langage informatique. Quatre principes clés dans la communauté Galaxy : accessibilité, reproductibilité, transparence et peer review. Galaxy-E est une plateforme d’analyse / couplage de données du PNDB.

Domaines scientifiques :Vie & Santé

Ecologie, évolution et biologie environnementale« Ecologie, évolution et biologie environnementale » n’est pas dans la liste (LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes, LS3 Biologie cellulaire, du développement et régénérative, LS4 Physiologie de la santé, de la maladie et du vieillissement, LS5 Neurosciences et troubles du système nerveux, LS6 Immunité, infection et immunothérapie, LS7 Prévention, diagnostic et traitement des maladies humaines, LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution, LS9 Biotechnologie et ingénierie des biosystèmes, LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions) des valeurs autorisées pour la propriété « Est sous discipline de Vie & Santé ». Thématique et/ou mots clés :

• Biodiversité
• Analyse
• Galaxy

Type de données :

Communauté d'utilisateurs : Usagers et bénéficiaires :

Conditions d'usage :

Conditions tarifaires :

Certification/Label :

Conditions générales d'utilisation :

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
PNDB	PNDB : Portail de données métadonnées MetaShARK Galaxy-E
PatriNat	INPN OpenObs MetaShARK Galaxy-E Depobio

Centre National de la Recherche Scientifique