BAliBASE

BAliBASE

Type de service	Plateforme d'accès
Statut	En production
Autres noms	Benchmark Alignment dataBASE
URL	http://lbgi.fr/balibase/
Contact	thompson@unistra.fr
Localisation	Strasbourg
Structure d'appartenance	IGBMC
Tutelles	CNRS, INSERM, Université de Strasbourg, Centre Européen de Recherche en Biologie et en Médecine
Identifiants
re3data	10.17616/R31NJMHE

Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :

Documentation

Conservation

Réutilisation

Chargement de la carte...

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Page en construction

BAliBASE est une base de données qui contient des alignements de séquences multiples de haute qualité, construits manuellement et accompagnés d'annotations détaillées. Les alignements sont tous basés sur des superpositions structurelles tridimensionnelles, à l'exception des séquences transmembranaires.

Les utilisateurs peuvent consulter une liste de tous les alignements, télécharger la base de données complète par ftp, obtenir le programme "c" pour comparer un alignement test avec la référence BAliBASE (le code source du programme est disponible gratuitement), ou consulter les résultats d'une étude comparative de plusieurs programmes d'alignement multiple, en utilisant les ensembles de référence BAliBASE.

Domaines scientifiques :Vie & Santé

LS3 Biologie cellulaire, du développement et régénérative Thématique et/ou mots clés :

• Alignement
• Séquence transmembranaire
• Bioinformatique
• Permutation circulaire

Type de données :Base de données

Communauté d'utilisateurs : Communauté scientifique, académique Usagers et bénéficiaires :Chercheur, Enseignant-chercheur, Doctorant

Conditions d'usage : Accès libre

Conditions tarifaires : Accès gratuit

Certification/Label :

Conditions générales d'utilisation :

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
IGBMC	BAliBASE

Centre National de la Recherche Scientifique