PBM

  PBM

Type de service	Plateforme d'acquisition
Statut	En production
Nom développé	Plateforme de Biologie Moléculaire de Villefranche (PBM)
Autres noms	PBM
URL	https://www.imev-mer.fr/web/plateforme-de-biologie-moleculaire-de-villefranche-pbm/
Contact	alessandra.contento@imev-mer.fr
Localisation	Villefranche-sur-Mer
Structure d'appartenance	IMEV, OSU STAMAR, EMBRC France
Tutelles	Sorbonne Université, CNRS

Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :

Planification

Collecte

Analyse

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La Plateforme de Biologie Moléculaire de Villefranche sur Mer existe depuis 2018.

Elle est labellisée au sein de l’IR EMBRC-France. PBM propose des services de génotypage, de clonage de cDNA et de soutien technique à différents appareils.

Services offerts :Texte en italique

Maitrise des techniques

• Génotypage par PCR,
• Clonage dans différents vecteurs plasmidiques (pGEM-Teasy, système Gateway,
• vecteur d’expression pCS2+),
• Mise à disposition d’équipements (Nanodrop, qPCR, Bioanalyseur).

Maitrise de logiciels d’analyse de séquence ADN

• Choix des amorces
• Analyse des séquences brutes après séquençage

- Recherche dans des banques de données - Alignement de séquences, arbres phylogénétiques

La plateforme garantit la confidentialité des données et des résultats

Domaines scientifiques :Vie & Santé

LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions; LS3 Biologie cellulaire, développement, cellules souches et régénération; LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution Thématique et/ou mots clés :

• Séquençage génomique
• Génomique environnementale
• Métagénomique
• Métabarcoding

Type de données :Données génomiques (FASTA, FASTQ)

Communauté d'utilisateurs : Usagers et bénéficiaires :

Conditions d'usage :

Conditions tarifaires :

Certification/Label :

Conditions générales d'utilisation :

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
EMBRC France	Plateforme GENOMER PBM
IMEV	EcoTaxa MICA PBM
OSU STAMAR	EcoTaxa MICA Plateforme GENOMER ABiMS PBM