EGA

EGA
Type de service	Entrepôt de données
Caractéristiques de l'entrepôt
Type d’entrepôt	Disciplinaire
Type de restriction	Soumis à la création d'un compte
Hébergement des données	UE
Identifiant pérenne	✓
Identifiants fournis	DOI
Identifiants utilisés
Formats de fichiers acceptés
Schéma de métadonnées	Basé sur XML, JSON et celui de l'entrepôt ENA : https://ega-archive.org/submission/metadata/ega-schema/
Licence des jeux de données
Conditions d'accès aux données	Embargo
Modération / Curation	Automatique et humaine. Tout dépôt donne lieu à un contrôle qualité documenté (File Quality Control Report). Délai moyen constaté entre la soumission et la publication : 1 mois
Volumétrie maximale définie	La soumission des données se fait via une "submission box" qui ne peut excéder 8To
Politique de conservation des données
Interopérabilité machine
Versioning	✓
Statut	En production
Nom développé	European Genome-phenome Archive
URL	https://ega-archive.org/
Contact	helpdesk@ega-archive.org, https://ega-archive.org/need-help/
Localisation	Hinxton (Royaume-Uni), Barcelone (Espagne)
Structure d'appartenance	EMBL-EBI, CRG
Identifiants
re3data	10.17616/R3W619

EGA est un entrepôt de données en biologie qui sont en lien avec la génomique.

Plusieurs types de données sont acceptés :

L'entrepôt recommande l'usage de vocabulaire contrôlé (Experimental Factor Ontology Database) pour décrire les données de phénotypes.

Domaines scientifiques :Vie & Santé

Type de données :Métadonnées, Données biologiques, Données génomiques

Communauté d'utilisateurs : Communauté de chercheurs en biologie

Usagers et bénéficiaires :Chercheur, Enseignant-chercheur, Doctorant

Conditions d'usage : Pour déposer et consulter des données il faut créer un compte.

Conditions tarifaires :

Conditions générales d'utilisation :

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
CRG	EGA
EMBL-EBI	ENA PRIDe ArrayExpress EGA EMPIAR PDBe