Systems Biomedicine

NSBD
Type de service	Plateforme de calcul
Statut	En production
URL	https://www.marseille-medical-genetics.org/a-baudot/
Contact	anais.baudot@univ-amu.fr
Localisation	Marseille
Structure d'appartenance	MMG
Tutelles	Aix-Marseille Université, Inserm

L'équipe Networks and Systems Biology for Diseases (NSBD) a pour objectif de développer des algorithmes, des outils d'analyse et d'intégration de données biologiques et de proposer des approches "système" pour l'étude des pathologies génétiques humaines.

Elle est organisée en deux axes de recherche :

Développements méthodologiques : Biologie des systèmes et théorie des réseaux
Applications pour démêler les troubles humains

Sur le versant des outils, l'équipe focalise particulièrement sur des approches non-supervisées appliquées aux réseaux biologiques multi-couches et propose des outils de clustering, de marches aléatoires ou de network embedding. L'équipe travaille également sur l'intégration de données quantitatives (transcriptomique, protéomique) dans les réseaux pour identifier des modules perturbés dans différentes conditions. Enfin, l'équipe s'intéresse également à l'intégration de données multi-omiques par des approches de réduction de dimension via des factorisations de matrices.

Domaines scientifiques :Sciences & Technologies, Vie & Santé

PE6 Sciences informatiques et informatique LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes Thématique et/ou mots clés :