ICGex

ICGex
Type de service	Plateforme de calcul
Statut	En production
URL	https://curie.fr/plateforme/curiecoretech-sequencage-haut-debit-icgex
Contact	ngs.lab@curie.fr
Localisation	Paris
Structure d'appartenance
Tutelles	Institut Curie

Page en construction

La plateforme ICGex-NGS propose un large champ d’applications en génomique, transcriptomique et épigénétique. Cette offre technologique, qui répond en premier lieu aux besoins des équipes de l’Institut travaillant sur le cancer, est aussi accessible à la communauté scientifique externe. La plateforme propose un service d’excellence autour de technologies de pointe en séquençage de nouvelle génération (NGS). Elle fournit un accompagnement scientifique et technique lors des étapes de design expérimental, comprenant la détermination des stratégies de séquençage les mieux adaptées. Elle met également au point des approches innovantes d’intérêt pour la communauté́ scientifique, impliquant le développement et l’implémentation de nouvelles technologies de génomique à haut débit. La plateforme envisage notamment d’acquérir un séquenceur long read Oxford Nanopore Technologies.

Domaines scientifiques :Vie & Santé

LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes Thématique et/ou mots clés :

Plateforme de bioinformatique
Transcriptomique
Génomique
Epigénétique
Cancérologie
Exome humain
Low input
NovaSeq
Séquençage de génomes entiers
Single cell
10x Genomics
Spatial transcriptomic
Multiome
Long read
PacBio
Iso-Seq

Type de données :Données génomiques, Données de séquençage

Communauté d'utilisateurs : Communauté scientifique Usagers et bénéficiaires :

Conditions d'usage : Les demandes de NGS peuvent être envoyées par mail à l’adresse ngs.lab@curie.fr. Si le projet est déjà bien cadré, la plateforme transmettra un fichier Excel à remplir et à renvoyer par mail avec les informations relatives à la demande et les principaux contacts (responsable de projet, chef d’équipe, bioinformaticien et gestionnaire administratif). Si au contraire, les utilisateurs ont besoin de conseils, la plateforme peut transmettre un certain nombre de documents et de fiches informatives, ou organiser un rendez-vous pour discuter du projet. La prestation démarre après validation du devis, réception du bon de commande et des échantillons.

Conditions tarifaires : Après validation de la faisabilité techn1200ab8bfaab15aeae56b670b094db3e

Certification/Label :IBiSA (https://www.ibisa.net/trouver-plateforme/)

ISO 9001:2015 (https://qualite.ibisa.net/certificats/certificat ISO 667.pdf)

NFX 50-900:2016 (https://qualite.ibisa.net/certificats/certificat NFX 667.pdf)

Conditions générales d'utilisation :

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
CurieCoreTech	ICGex CUBIC
France Génomique	GeT LIGAN-PM GenomiqueENS TGML MGX GenomEast GENOMAX UCA Genomix PSI2BC Biomics ICGex