POPS (IPS2)

  IPS2 : POPS

Type de service	Plateforme de calcul
Statut	En production
Autres noms	Plateforme transcriptOmique de l’iPS2
URL	https://www.pluginlabs-universiteparissaclay.fr/fiche/ips2-plateforme-de-transcriptomique-pops/
Contact	contact.ips2@u-psud.fr
Localisation	Gif-sur-Yvette
Structure d'appartenance	IPS2
Tutelles	Université Paris-Saclay

Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :

Collecte

Analyse

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POPS est la plateforme de transcriptomique des plantes de Paris-Saclay localisée à l'institut de science des plantes Paris-Saclay (IPS2). Elle offre une expertise pour le développement de l’analyse du transcriptome chez les végétaux par l’utilisation du séquençage à haut débit d’ARN (RNA-Seq).

La plateforme est impliquée dans de nombreux projets de recherche et réalise des analyses de transcriptome en collaboration avec des laboratoires partenaires. Ses experts conseillent les utilisateurs sur les technologies à utiliser en tenant compte de leurs contraintes et établissent des plans d’expérience efficaces. Leur savoir-faire s’étend de la préparation des échantillons à l’analyse bioinformatique et statistiques des données.

La versatilité de la plateforme POPS se traduit par la diversité des organismes végétaux, la nature et le nombre d’échantillons par projet pouvant être pris en charge. La gamme d’analyse proposée s’enrichit grâce aux activités de développement de la plateforme qui lui permettent de proposer des approches de transcriptomique toujours plus innovantes.

Domaines scientifiques :Vie & Santé

LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes; LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution Thématique et/ou mots clés :

• Plateforme de bioinformatique
• Végétaux

Type de données :Données génomiques

Communauté d'utilisateurs : Usagers et bénéficiaires :

Conditions d'usage :

Conditions tarifaires :

Certification/Label :ISO 9001:2015 (http://IBiSA)

Conditions générales d'utilisation :

POPS (IPS2) est en lien avec les services et structures

France Génomique

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
IPS2	CATdb POPS (IPS2)

2015

Systèmes de management de la qualité