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M
MetaShARK est l’interface de saisie de données et métadonnées du PNDB. MetaShARK est une application R Shiny permettant de parcourir facilement les spécifications de l’EML et de saisir des métadonnées. Cette application est accessible sur l’espace Github dédié [https://github.com/earnaud/MetaShARK-v2] et utilisable sur [metashark.test.pndb.fr].
L'application permet de générer un fichier.xml EML-valide et un data package téléchargeable emldown qui est proto-datapaper qui peut être publié et mis en ligne vers MetaCAT de DataOne. +
La '''plateforme Metatoul''' fournit à la communauté scientifique des '''installations à grande échelle (RMN, spectroscopie de masse, systèmes robotiques…), des outils et une expertise''' pour soutenir les projets de recherche nécessitant des investigations du métabolisme, de sa régulation ou de son ingénierie, dans les domaines de la microbiologie, des biotechnologies, de la santé humaine et de la sécurité alimentaire.
Metatoul développe en particulier des '''méthodes permettant de mesurer qualitativement et quantitativement la réponse du métabolisme à des perturbations génétiques ou environnementales''' sur l'ensemble du système biologique considéré. Toutes les '''données générées sont post-traitées et interprétées selon des méthodes de modélisation''' mettant l’accent sur les réseaux. +
'''MetaboHUB''' est l''''infrastructure nationale en métabolomique et fluxomique'''. MetaboHUB a pour objectif de fournir des outils technologiques de pointe et des services en métabolomique et fluxomique aux équipes de recherche académiques et à des partenaires industriels dans les domaines de la santé, de la nutrition, de l'agriculture, de l'environnement et des biotechnologies.
MetaboHUB offre des laboratoires de grandes capacités (comprenant des équipements de Résonnance Magnétique Nucléaire – RMN, et de Spectrométrie de Masse, MS), proposant des outils et de l’expertise pour aider les scientifiques des laboratoires académiques et privés dont les projets nécessitent l’étude approfondie du métabolisme, de sa régulation ou de son ingénierie.
Les codes sources produits par l’infrastructure sont ouverts sur une forge logicielle https://github.com/eMetaboHUB. es données validées et décrites sont publiées sur un entrepôt de données https://metabohub.peakforest.org/webapp +
'''Meteo.data.gouv.fr''' a pour objectif de référencer, héberger et diffuser les données publiques météorologiques produites par Météo-France. Les données sont téléchargeables et utilisables de manière libre et gratuite.
Sur ce portail, vous pouvez accéder aux jeux de données suivants :
* '''Données climatologiques de base''' : ce sont des données climatologiques pour toutes les stations françaises depuis leur ouverture, pour tous les paramètres disponibles.
* '''Données climatologiques de référence pour le changement climatique''' : ce sont des données recommandées par Météo-France pour réaliser des diagnostics et études climatiques.
* '''Données de Prévision Numérique du Temps (PNT)''' : Ce sont les résultats des dernières prévisions des modèles de prévision numériques jusqu'à 4 jours d'échéance.
La plateforme sera enrichie de nouvelles données au cours de l’année 2024 avec notamment l’'''ajout d’un téléchargement de masse des paquets de données des modèles de prévision numérique du temps ARPEGE et AROME'''. De nouvelles fonctionnalités facilitant le '''tri et l’accès aux données hébergées''' seront également proposées pour simplifier l’utilisation de ces données. Notamment, la mise en place de nouvelles possibilités techniques d’'''accès par API''' aux données d’observation, climatologiques et radar, sans aucun frais. Cela comprendra un accès temps réel, et à la fréquence de 6 minutes, aux données de plus de 2 000 stations d’observation et à l’ensemble de ses données de radars en temps réel et toutes les 5 minutes.
Ce service est une '''déclinaison thématique de data.gouv.fr''' sur les données relatives à la météo et au climat réalisé en collaboration avec Météo-France. +
Le service '''MeteoNet''' mis en place par Météo-France met à disposition des jeux de données afin de faciliter l'accès à des '''données météorologiques d'archives sélectionnées et formatées'''. Ce service a pour objectif de rendre leur exploitation aisée par des ''data scientists'' non experts en météorologie.
MeteoNet c'est donc:
* 3 ans de données de 2016 à 2018, sur deux zones géographiques de 550 x 550 km sur le nord-ouest et le sud-est de la France
* Des images radar de précipitations mesurées toutes les 5 minutes
* Les observations de 500 stations météorologiques toutes les 6 minutes
* Des prévisions de modèles météorologiques 2D et 3D issus des modèles météorologiques AROME et ARPEGE
* Des masques terre/mer et relief +
Le projet '''Mezanno''', collaboration de la BnF, l'IGN et l'EHESS, a pour objectif de '''faciliter l'annotation collaborative des ressources textuelles publiées avec l'API IIIF''', principalement en améliorant le visualisateur Mirador.
Le projet Mezanno vise à '''créer une suite d'outils ouverts et interopérables pour l'annotation assistée de corpus personnalisés''', soutenus par une communauté d'utilisateurs et de contributeurs. Ces outils sont conçus pour répondre à trois étapes clés :
* '''Construction du corpus''',
* '''Extraction des données brutes''',
* '''Structuration des données selon un modèle pertinent pour l'analyse''', tout en assurant l'interopérabilité des données exportées.
Il s'appuiera fortement sur la '''norme IIIF pour assembler facilement des corpus à partir de ressources publiques et intégrera des modules d'intelligence artificielle''' pour aider les utilisateurs à extraire ou à transcrire le contenu brut des documents. +
'''MicMac''' est une '''suite photogrammétrique libre et gratuite''' (licence Cecill-B) qui peut être utilisée dans une variété de scénarios de reconstruction 3D.
Il peut en effet être utilisé dans des domaines variés : cartographie, environnement, industrie, sylviculture, patrimoine, archéologie,...
MicMac permet à la fois la '''création de modèles 3D et d'ortho-imagerie''' le cas échéant.
Le logiciel est adapté à tous les types d'objets et à toutes les échelles. Les outils permettent également le '''géoréférencement des produits finis dans un système de coordonnées locales/globales/absolues'''. Certains outils complémentaires ouvrent les champs de la métrologie et du relevé de site. +
La '''plateforme MicroMat''' est une des trois plateformes technologiques du LEM3 et a pour vocation de permettre '''la caractérisation de la microstructure des matériaux'''.
Elle dispose de quatre plateaux techniques permettant la caractérisation de la microstructure des matériaux notamment:
* Un '''plateau de microscopie''' (Microscopie électronique à balayage et Microscopie électronique en transmission) qui dispose de compétence en analyse chimique (EDS) et d'orientation (EBSD et EBSD 3D couplé avec un FIB).
* Un '''plateau de nanoindentation''' qui permet la caractérisation mécanique des matériaux en surface.
* Un '''plateau d'analyse Thermo-physique''' (DSC et Dilatométrie) ainsi qu'un four de traitements thermiques sous vide primaire.
* Un '''plateau d'analyse non destructive''' en diffraction à rayons X et en tomographie à rayons X.
La complémentarité des équipements disponibles sur la plateforme favorise une caractérisation multi-échelle, allant de quelques centimètres à quelques nanomètres.
La plateforme est reconnue nationalement pour son expertise en '''analyse des données d’orientations cristallographiques'''. En couplant les '''analyses par tomographie à rayons X et microscopie double faisceau''', elle a développé une compétence unique au sein de l’université en '''analyse 3D multi-échelle des matériaux'''. La plateforme développe aussi de '''nouvelles techniques d’analyse des microstructures (hardware et/ou software).''' +
La '''plateforme MicroScope (MaGe)''' est une '''infrastructure informatique dédiée à l’annotation et l’analyse comparative de génomes ou méta-génomes de microorganismes'''.
Plateforme web d'annotation et d'analyses comparatives de génomes procaryotes développée par l'équipe LABGeM, laboratoire Analyses Bio-informatique pour la Génomique et le Métabolisme du CEA/Genoscope. Cette infrastructure informatique intègre des données (génomes, annotations automatiques et expertes, résultats d'analyses et données expérimentales), et des interfaces graphiques Web permettant d'explorer ces données et d'utiliser les outils méthodologiques régulièrement intégrés à la plateforme.
MicroScope combine des '''outils et des interfaces graphiques pour analyser les génomes dans un contexte comparatif et métabolique'''. Cette plateforme fournit des données provenant de milliers de projets sur le génome ainsi que des expériences post-génomiques permettant aux utilisateurs d'améliorer la compréhension des fonctions des gènes. Des annotations d'experts sont continuellement rassemblées dans la '''base de données MicroScope''', ce qui contribue à l'amélioration de la qualité des annotations du génome microbien. MicroScope peut être utilisé comme une '''ressource communautaire pour l'analyse comparative et l'annotation des génomes accessibles au public''', mais aussi comme une ressource privée avec des droits d'accès limités aux données génomiques. +
La '''plateforme bioinformatique Migale''' est une équipe de l'unité de recherche INRAE MaIAGE (Mathématiques appliquées et informatique, du génome à l'environnement).
Depuis 2003, elle fournit quatre types de services à la communauté des sciences de la vie :
* Une '''infrastructure ouverte dédiée à l'analyse des données des sciences de la vie''' (750 To, 2000 CPU équivalents)
* La diffusion de l'expertise en bio-informatique (session annuelle de formation "Bio-informatique par la pratique")
* La conception et le '''développement d'applications bioinformatiques''' (navigateur de génome, bases de données)
* L''''analyse de données en génomique, métagénomique et métatranscriptomique'''. +
'''Migrinter''' est un laboratoire de recherche spécialisé dans l’étude des migrations internationales. Le projet de l’équipe trouve sa cohésion scientifique autour de l’objet « migration ». Il se construit dans l’articulation entre recherche, formation, documentation, et information scientifique et technique.
Il se compose de 3 axes :
* Mobilité, ancrage et dynamiques spatiales
* Normes en migration et migration des normes
* Les représentations des spatialités migratoires +
Le portail '''[https://www.milieumarinfrance.fr milieumarinfrance]''', est le portail du Système d’information sur le milieu marin ([[SIMM]]). Ce dernier est l’un des trois Systèmes d’information fédérateurs pilotés techniquement par l’OFB. Le site milieumarinfrance propose des liens vers les sites diffusant de la donnée, ainsi que des informations générales sur l’état des écosystèmes marins en France, les différentes activités et usages en mer, et les actions de protection et de restauration du milieu. Son objectif est l’accès centralisé aux données sur le milieu marin. La prochaine version proposera des fonctionnalités supplémentaires permettant la recherche, la visualisation et le téléchargement de données directement sur le portail. +
'''Mines Paris – PSL''' ('''École nationale supérieure des mines de Paris''') est un établissement public à caractère scientifique, culturel et professionnel qui propose '''des formations variées allant du cycle ingénieur au doctorat'''.
Les 18 centres de recherche de Mines Paris – PSL sont organisés au sein de 5 départements d’enseignement et de recherche, correspondant au cinq grandes thématiques et enjeux d’avenir portés par l’École :
* Économie, Management & Société
* Énergétiques & procédés
* Mathématiques & systèmes
* Mécanique & matériaux
* Sciences de la Terre & de l’Environnement. +
La '''bibliothèque des Mines Paris-PSL''' joue aussi un rôle pédagogique important en participant à la formation des élèves, mastériens, doctorants, chercheurs et enseignants à l’'''ouverture des données de la recherche et, en particulier, à la rédaction de plan de gestion de données.''' +
Membre de l’Institut Mines-Télécom, rattachée au Ministère en charge de l’industrie, l’'''École des mines de Saint-Étienne''' est dédiée à la formation d’ingénieurs généralistes et de spécialités de haut niveau.
Elle déploie une '''recherche orientée vers l’industrie''' et joue un rôle prépondérant dans l’'''accompagnement des entreprises à la transition industrielle''' via son programme Mines Saint-Étienne Tech. +
Le '''Ministère de la Culture''' a pour principale mission de "rendre accessibles au plus grand nombre les œuvres capitales de l'humanité et d'abord de la France".
A ce titre, il :
* Conduit la politique de '''sauvegarde, de protection et de mise en valeur du patrimoine culturel dans toutes ses composantes'''.
* Contribue au '''développement de l'éducation artistique et culturelle''' des enfants et des jeunes adultes.
* Encourage les initiatives culturelles locales.
* Veille au '''développement des industries culturelles'''.
* Met en œuvre les actions de l’État destinées à '''assurer le rayonnement dans le monde de la culture et de la création artistique françaises et de la francophonie'''.
* Contribue à l''''action culturelle extérieure de la France''' et aux actions relatives aux implantations culturelles françaises à l'étranger. +
Le '''Ministère de la Justice''' administre la justice qui est l’une des grandes fonctions régaliennes assurées par l’État.
Il a pour missions de :
* '''Préparer les textes de loi'''
* '''Garantir le bon fonctionnement des juridictions'''
* '''Prendre en charge les personnes qui lui sont confiées par l'autorité judiciaire''' +
Le '''Ministère des Armées''' est d’assurer la '''protection du territoire, de la population et des intérêts français'''. Il répond aussi à d’autres missions dans le cadre des accords et traités internationaux (OTAN) ou régionaux (Europe de la défense).
La stratégie de défense et de sécurité nationale est aujourd’hui définie grâce à six grandes fonctions stratégiques :
* Connaissance-compréhension-anticipation
* Dissuasion
* Protection-résilience
* Prévention
* Intervention
* Influence.
Au delà de ces missions, le ministère des Armées s’implique également dans des '''missions de service public'''. Ses moyens humains et matériels soutiennent ou suppléent les actions d’autres ministères, au quotidien ou dans l’urgence, sur le territoire national et à l’étranger. +
La '''Mission logiciels libres''' accompagne les administrations pour renforcer leur utilisation de logiciels libres, soutenir leurs démarches de publication et de mutualisation de codes sources et créer des liens avec l'écosystème open source.
Le pôle logiciels libres publie ses codes sources sur [https://github.com/codegouvfr Github] et sur la forge [https://sr.ht/~codegouvfr/ SourceHut]. +
Le laboratoire '''Modèles, Dynamiques, Corpus''' ('''MoDyCo''') a pour objectif d’étudier '''le fonctionnement linguistique et l’impact que peuvent avoir les variations langagières sur la grammaire et sur le fonctionnement des mécanismes langagiers'''.
Le projet de recherche de MoDyCo est structuré en trois pôles et trois axes transversaux :
* Pôle 1 : Modélisation et linguistique fondée sur les corpus
* Pôle 2 : Pratiques langagières : Discours, textes, grammaires
* Pôle 3 : Psycholinguistique, Neurocognition, Acquisitions et Variations
* Axe Corpus de données multidimensionnelles
* Axe Épistémologie des Sciences du Langage
* Axe Méthodologie de la Recherche et Analyses Statistiques. +