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L''''Atelier de Bretagne Occidentale pour la Recherche et ses Données''' de l’Université de Bretagne Occidentale (UBO) est un dispositif d''''accompagnement''' à la gestion des données de recherche destiné à la communauté de recherche et personnels d'appui à la recherche dans toutes les disciplines et domaines de l’Université de Bretagne Occidentale (UBO), incluant l’Institut National Polytechnique de Bretagne (Bretagne INP).
Les services proposés sont :
* Guichet unique de contact
* Conseil, orientation et sensibilisation
* Accompagnement personnalisé sur les données
* Formation généraliste : science ouverte, plan de gestion de données et RGPD
* Formation renforcée : gestion FAIR des données à toutes les étapes des activités de recherche en SHS et Sciences de la Mer
* Outils pour les données : présentation, mise à disposition et accès. +
La '''plateforme ABiMS, Analysis and Bioinformatics for Marine Science''', met à disposition une infrastructure dédiée au calcul scientifique: ressources matérielles (calcul et stockage) et environnement de workflows (outils, portail,...) .
ABiMS est partie intégrante de la Station Biologique de Roscoffet est rattachée au Service Informatique et Bioinformatique. Elle est intégrée à l’Institut Français de Bio-informatique (IFB) et à l’axe bio-informatique de Biogenouest. Les thématiques abordées par la plateforme concernent '''l’étude et l’analyse des données issues du monde marin''' (algues, poissons, cyanobactéries, picoplancton...), et sont en lien direct avec les 2 axes de recherche de la Station Biologique que sont la '''biologie''' et l''''écologie'''. ABiMS interagit avec les équipes de recherche dans le cadre de collaborations scientifiques formalisées, ou sous la forme de prestations. +
Le laboratoire '''ACP''', '''Analyse Comparée des Pouvoirs''', a pour mission de développer la recherche scientifique fondamentale et appliquée, de diffuser la culture et l'information scientifique et de contribuer à la coopération internationale dans les champs disciplinaires représentés : Aménagement et études urbaines, Géographie, Histoire, Histoire de l’art et Sociologie.
Axes de recherche :
* Transformations spatiales et rapports sociaux
* Institutions, actions et logiques de pouvoir
* Travail, emploi, pouvoir
* Circulations des personnes, des objets matériels et culturels. +
ACTRIS est l'infrastructure de recherche paneuropéenne pour l’observation et l’exploration des aérosols, des nuages et des gaz réactifs et de leurs interactions. L'infrastructure produit des données et des informations de haute qualité sur les constituants atmosphériques à courte durée de vie et sur les processus conduisant à la variabilité de ces constituants dans les atmosphères naturelles et contrôlées. +
ACTRIS Data Centre, ACTRIS DC, est le centre de données et de services de l'infractucture de recherche ACTRIS pour la recherche atmosphérique.
Le portail ACTRIS DC ACTRIS DC fournit un accès libre et gratuit à toutes les données résultant des activités du réseau d'infrastructure ACTRIS, complétées par des données provenant d'autres réseaux et bases de données pertinents. +
ACTRIS est une infrastructure de recherche distribuée, en support des recherches sur le '''climat''' et la '''qualité de l’air'''. Elle permet d’améliorer la compréhension de l’évolution passée, présente et future de la '''composition atmosphérique'''. ACTRIS-FR est la composante française d’[[:ACTRIS|ACTRIS]], l’initiative Européenne pour l’'''observation''' et l’'''exploration''' des '''aérosols''', des '''nuages''' et des '''gaz réactifs''' et de leurs interactions.
ACTRIS fournit des informations sur la variabilité 4-D des espèces à temps de vie court avec la précision et la qualité requises par les utilisateurs ainsi que des moyens d’exploration sur les processus atmosphériques.
ACTRIS opère des plateformes centrales (centres de données, centres d’expertise) et fournit des services destinés à une large communauté d’utilisateurs travaillant sur les modèles de chimie atmosphériques et de climat, sur la validation des données satellitaires ou sur l’analyse de la prévision du temps ou de la qualité de l’air. Enfin, ACTRIS offre des modalités d’accès à des plateformes technologiques d’observation et d’exploration au service des communautés scientifiques et du secteur privé favorisant ainsi l’innovation technologique.
Une partie des publications issues de projets utilisant l’infrastructure est en accès ouvert. Les codes sources produits par l’infrastructure sont ouverts sur une forge logicielle https://git.icare.univ-lille1.fr. Infrastructure dotée d’une politique de données FAIR en application. Les données validées et décrites sont publiées sur un entrepôt de données +
L’'''Atelier de la Donnée Centre-Val de Loire (ADCVL)''' a pour objectif de fournir une expertise en gestion de données aux équipes de recherche de toutes les disciplines scientifiques de la région. Cette expertise se traduit par un '''accompagnement des chercheurs''' dans les différents domaines couverts par l’atelier (entrepôt de données, FAIRisation, plan de gestion de données, etc.), ainsi que par des '''formations et des webinaires'''.
Labellisé '''Atelier de la donnée''' en décembre 2022, il fait partie de l’écosystème '''Recherche Data Gouv''' qui œuvre au partage et à l’ouverture des données de recherche. Il est porté par la Maison des Sciences sociales et des Humanités Val de Loire en partenariat avec les universités d’Orléans et de Tours, le CNRS, BRGM, l’INRAE Val de Loire, l’INSA Centre Val de Loire, l’Inserm Grand Ouest, l’IR* Huma-Num et le Réseau national des MSH. Il est également appuyé par l’OSUC.
Il offre aux 70 unités de recherche et aux 5 écoles doctorales de la région, soit environ 3000 chercheurs et personnels de recherche publique et environ 1300 doctorants, '''une expertise en gestion de données'''. Cette expertise se traduit par un accompagnement des chercheurs dans les différents domaines couverts par l’atelier ainsi que par des formations et des webinaires.
Les services de l’ADCVL se déclinent en 5 axes :
* Accompagnement au dépôt des jeux de données
* Conseils éthiques et juridiques
* FAIRisation des données
* Plan de gestion de données
* Préservation et sécurité des données +
Le guichet unique '''ADELE Helpdesk''' a été labellisé '''Atelier de la donnée''' en juin 2022. Il s'appuie sur 10 services existants d’accompagnement aux données scientifiques de 5 entités de recherche alsaciennes : l'[https://www.unistra.fr/ université de Strasbourg] (Unistra), l’[https://www.uha.fr/ université de Haute-Alsace] (UHA), l'[https://www.insa-strasbourg.fr/ INSA Strasbourg], la [https://www.misha.fr/ MISHA] et la [https://www.bnu.fr/ BNU].
En plus du personnel scientifique des 5 entités engagées dans l'atelier, le guichet s'adresse également à celui des établissements et organismes suivants : ENGEES, HEAR, ENSAS, EOST, ObAS, CNRS, INRAE, Inserm, et Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS). ADELE Helpdesk bénéficie également du soutien du CNRS, ainsi que de [[PROGEDO]] et d'[[Huma-Num|HUMA-NUM]], dont les relais locaux sont membres d'ADELE.
Les services proposés par l’atelier sont :
* l''''aide à la planification de projet''' (aide à la budgétisation lors d'une demande de financement)
* l'accompagnement au '''plan de gestion des données projet et entité''' (conseil, relecture),
* le conseil sur la '''gestion FAIR et la diffusion des données et du code''',
* le conseil sur le '''stockage et le calcul''',
* le conseil et le développement de '''bases de données et d’applications web''',
* l'accompagnement au '''dépôt de jeux de données dans un entrepôt thématique ou pluridisciplinaire'''
* la '''curation des dépôts de jeux de données dans l'[[Université de Strasbourg : Entrepôt|espace institutionnel Unistra]]''' de Recherche Data Gouv,
* des '''formations aux données de la recherche et au code logiciel'''.
Le site web d''''ADELE Helpdesk''' ouvrira début 2024 et offrira un premier niveau d'informations sur les données et les services d'accompagnement disponible sur le site alsacien.
Pour toutes questions relatives aux données de la recherche, contactez ADELE Helpdesk à contact@adele.help. Le cas échéant, les demandes seront redirigées auprès des experts techniques et juridiques des établissements porteurs.
L’ADEME participe à la mise en œuvre des politiques publiques en matière d'énergie, de protection de l'environnement et du développement durable. Elle dispose de compétences scientifiques, techniques, d’expertise, de conseil et de centres de ressources dans les domaines suivants : déchets, sols pollués et friches, énergie et climat, air et bruit, actions transversales (production et consommation durable, villes et territoires durables). Elle aide au financement de projets, de la recherche à la mise en œuvre dans ses domaines d'intervention.
L’ADEME, Agence de la transition écologique, est impliquée dans le projet de loi relatif à la transition énergétique qui concerne les domaines de la rénovation thermique des bâtiments, l’adaptation des transports et de l’aménagement des territoires, la production, le stockage et les usages des énergies, la préservation et la restauration des écosystèmes, l’économie circulaire, la moindre dépendance aux ressources rares.
Dans le cadre de son engagement pour la science ouverte et de la Loi pour une République numérique, l’ADEME développe son [[ADEME_Portail_open_data|Portail open data]] afin de mettre à disposition ses données collectées lors des études et des rapports. +
L’ADEME, Agence de l’environnement et de la maîtrise de l’énergie, met à disposition ses données sur son Portail open data afin permettre aux entreprises, aux collectivités locales, aux pouvoirs publics et au grand public de progresser dans leur démarche environnementale dans le cadre de la transition énergétique et écologique.
L’ADEME produit les jeux de données principalement à partir de ses études et de ses rapports dans les domaines suivants : déchets, sols pollués et friches, énergie et climat, air et bruit, actions transversales (production et consommation durable, villes et territoires durables). +
'''ADES''' est le '''portail national d’Accès aux Données sur les Eaux Souterraines''' pour la France métropolitaine et les départements d’outre-mer. Il rassemble sur un site Internet public des '''données quantitatives et qualitatives relatives aux eaux souterraines'''.
Les objectifs de cet outil sont de :
*constituer un outil de collecte et de conservation des données sur les eaux souterraines,
*être mobilisable par un large ensemble de partenaires,
*permettre les traitements nécessaires à l’action de chacun des partenaires,
*être le guichet d’accès aux informations sur les eaux souterraines,
*avoir un suivi de l’état des ressources pour répondre à la politique des eaux souterraines,
*adopter au niveau national un principe de transparence et d’accessibilité aux données sur les eaux souterraines.
ADES s’inscrit dans le système d'information sur l'eau, [[SIE]], dispositif créé par l'État pour le partage et la mise à disposition des données sur l'eau. +
Pour augmenter le succès de la découverte de candidats médicaments ou d'outils de recherche, il est nécessaire de considérer l'activité pharmacologique des composés et l'optimisation de leurs propriétés '''ADMET''' : Absorption, Distribution, Métabolisme, Excrétion et Toxicité.
Le '''Réseau des plateformes d'ADME-Tox''' propose une palette de '''prestations''' permettant d''''identifier et de développer des candidats précliniques'''. Les tests peuvent être classés en quatre catégories : caractérisation physicochimique, ADME in vitro, pharmacocinétique in vivo et toxicité'''. +
Le service '''ADN''', '''Accompagnement de la Donnée à et avec Nanterre''' a été labellisé '''Atelier de la donnée'''. C'est un service collectif de l’'''Université Paris Nanterre''' (SCD et DRED), de la MSH Mondes et de la Contemporaine qui apporte une première expertise dans '''la gestion des données de recherche''' à la communauté scientifique de l’établissement.
ADN est organisé en trois services:
* L’équipe Accueil propose un premier niveau de réponse sous forme de guichet pour toute question relative à la gestion, protection et ouverture des données issues de leurs travaux de recherche.
* L’équipe Formation articule son offre selon trois modalités : la mise à disposition raisonnée de supports d’autoformation ; un calendrier préétabli de formations introductives ; l’organisation de formations pratiques sous forme d'ateliers.
* L'équipe Accompagnement propose un accompagnement collectif ou personnalisé des projets, en fonction des besoins, sur l'ensemble du cycle de la donnée (recueil, analyse, traitement, aspect juridique, dépôt et valorisation des données). +
L’'''Atelier de la donnée en Normandie''' (ADN) s'inscrit dans la politique de science ouverte menée par Normandie Université et ses établissements membres. Il a été labellisé '''Atelier de la donnée''' en septembre 2023 et il est depuis financé avec le soutien du Fonds National pour la Science Ouverte. L’ADN est coordonné par l’université de Caen Normandie et fait intervenir des personnels de la documentation, d’appui à la recherche et des ingénieurs des établissements d’enseignement supérieur normands (Université de Caen Normandie, Université de Rouen Normandie, Université Le Havre Normandie, INSA de Rouen Normandie, Normandie Université)
Il propose un '''accompagnement à la rédaction de plans de gestion de données''' qui repose sur la constitution de '''trois guichets de proximité''', positionnés dans chacun des trois principaux sites normands :
* [https://bibliotheque.unicaen.fr/appui-a-la-recherche/donnees-de-la-recherche/guichet-unique/ Data UNICAEN]
* Le [https://bu.univ-lehavre.fr/enseignant-chercheur-doctorant/donnees-de-la-recherche/article/gerer-ses-donnees-de-la-recherche Guichet unique havrais]
* Le [https://documentation.univ-rouen.fr/des-bu-pour-les-chercheurs-768667.kjsp Guichet unique rouennais]
Des ateliers d’aide à la rédaction de PGD sont proposés localement, avec une programmation régulière et des séances à la demande.
L'Atelier de la donnée en Normandie se structure aussi autour d'une offre de formation avec un premier module de formation intitulé « '''Sensibilisation aux données de la recherche – gestion et bonnes pratiques''' » qui aborde les thèmes suivants :
* Contexte et enjeux autour des données de la recherche
* Cycle de vie des données et principes d’ouverture
* Le cadre éthique et juridique des données de la recherche
* La gestion des données au quotidien (métadonnées, stockage, partage et archivage, publier ses données, plans de gestion de données)
Une formation spécifique est dédiée et adaptée aux doctorants. En outre, à compter du début de l’année 2024, deux nouveaux modules de formation, intitulés respectivement « '''Diffuser ses données grâce aux data papers''' » et « '''Les entrepôts de données de recherche''' », seront également proposés par l'atelier.
Le service '''ADOC Lorraine''', '''Accompagner aux Données les Chercheurs et Chercheuses en Lorraine''', a été labellisé '''Atelier de la donnée''' dans le cadre d''''un partenariat''' entre l''''Université de Lorraine, la MSH Lorraine, le CNRS, Inria et AgroParisTech'''.
Les services proposés au sein de l’atelier sont :
* Formation aux données de la recherche
* Recherche de jeux de données
* '''Guichet unique''' et conseils spécialisés sur les données
* Accompagnement : plan de gestion de données, calcul intensif, stockage des données, dépôt dans des entrepôts, codes sources et algorithmes liés aux données
* Accompagnement thématique par le réseau d’ambassadeurs des données
* Curation des données déposées dans [[DOREL]]
* Accompagnement aux services de l’EOSC (European Open Science Cloud)
* Formation à l’usage du '''cahier de laboratoire électronique''' ([https://scienceouverte.univ-lorraine.fr/donnees-de-la-recherche-ul/cahier-de-laboratoire-electronique-la-solution-elabftw/ eLabFTW])
* Accompagnement à la publication de '''data papers'''
* Conseils sur le RGPD
* Nœud thématique en Géosciences
* Noeud thématique en SHS : valorisation des projets de recherche en SHS sur la plateforme [[CENHTOR]] et aide au traitement des données textuelles en SHS
Dans le cadre de la mise en place d'un '''service d’accompagnement Science Ouverte pour le portage des projets''' par la Mission Appui Recherche de la Direction de la Documentation de l'Université de Lorraine, l'atelier de la donnée ADOC Lorraine propose un '''accompagnement sur les PDG et un appui à la diffusion et à l’archivage des données dans un entrepôt'''.
Le service '''ADOO''', '''Atelier de la Donnée d’Occitanie Ouest''' a été labellisé '''Atelier de la donnée'''. Il propose un dispositif complet d’assistance et d’accompagnement des équipes de recherche de la métropole toulousaine sur l’ensemble des volets concernant '''la gestion des données, des codes et des logiciels de la recherche'''.
Les services proposés sont :
* La '''gestion raisonnée des données de la recherche, algorithmes et codes sources'''
* L'accompagnement à la '''rédaction de plan de gestion de données''' : formation, conseils, aide à la création ou demande de relecture
* L'orientation sur le '''stockage des données'''
* L'accompagnement au '''dépôt et au partage''' : formation, conseil, aide au dépôt et au partage
* La coordination de l’accompagnement autour de la mise en réseau et de l’animation des compétences pluri-métiers
* La mise à disposition d'un '''point d'entrée unique''' pour accéder à l'aide de proximité et pour formuler des demandes
Les partenaires impliqués dans l'atelier de la donnée sont Université Toulouse Capitole, Université Toulouse- Jean Jaurès et Université de Toulouse, Toulouse INP, Toulouse School of Economics, IMT Mines Albi, INSA, INU Champollion, ISAE-SUPAERO, ENAC, ENSFEA, CNRS, ONERA ainsi que le Mésocentre CALMIP, le Data Center Drocc, la MSHS-Toulouse en lien avec le pôle qualité des données de l'IR* Huma-Num et la PUD-T. +
L’'''Atelier de la Donnée du Roussillon ADOR''' s’adresse à l’ensemble des chercheurs, enseignants-chercheurs, doctorants et personnels d'appui à la recherche de l’université de Perpignan Via Domitia et de ses 16 laboratoires de recherche et 3 plateformes. L'objectif est de fournir un soutien et un '''accompagnement''' plus proche des équipes de recherche, tout en s'inscrivant dans une dynamique nationale.
Les services proposés sont :
* Accueil / Orientation / Informations générales sur les données
* Sensibilisation et formation à la gestion et valorisation des données
* Montage et suivi des projets financés
* Accompagnement à la rédaction des plans de gestion de données
* Accompagnement à la sécurisation et au stockage des données
* Accompagnement sur les aspects éthiques et juridiques liés aux données
* Accompagnement à la rédaction de data papers. +
Le service '''l'Atelier de la donnée de la Seine-Saint-Denis (ADSSD)''', porté par l’Université Paris 8 (SCD Université Paris 8), propose des services aux chercheurs sous la forme d’un guichet unique.
Les accompagnements proposés sont :
* Un suivi personnalisé des chercheurs de Paris 8 sur les données de la recherche
* Un accompagnement au dépôt des données et à la gestion des projets de la recherche
* Un accompagnement dans la rédaction d’un '''plan de gestion des données''' (Data Management Plan) +
Le laboratoire Architecture et Fonction des Macromolécules Biologiques, AFMB, est un centre de biologie structurale. Les thématiques des équipes de recherche sont : Complexes Macromoléculaires Viraux ; Désordre Structural et Reconnaissance Moléculaire ; Glycobiologie et Neurobiologie Structurales ; Glycogénomique ; Interactions hôte-pathogène ; Réplicases Virales : Structure Mécanisme et Drug-Design. L'objectif de ces recherches est d'acquérir une connaissance détaillée de la structure à l’échelle moléculaire et de la fonction des protéines ou assemblages macromoléculaires en se basant sur des approches pluridisciplinaires (bioinformatique, génie génétique, biochimie, biophysique, chimie et biologie structurale). L’AFMB a développé trois plateformes technologiques labellisées IBiSA (Bioinformatique CAZy, Biologie Structurale, Plateforme de Criblage Marseille-Luminy), une collection de ressources biologiques (Biobanque de produits dérivés viraux) et un service pour la production d’anticorps à domaine unique (Sélection et production de VHH/nanobodies de camélidés). +
L''''Institut Amélioration Génétique et Adaptation des Plantes méditerranéennes et Tropicales''', '''AGAP''', cherche à comprendre les facteurs du développement des plantes et de leur adaptation aux contraintes environnementales, analyse l'organisation et la diversité des génomes et étudie l'agrobiodiversité.
Cette UMR mobilise et intègre ressources et connaissances sur :
*l’organisation et la diversité des génomes ;
*la gestion et la valorisation de l’agro-biodiversité ;
*les bases génétiques et fonctionnelles du développement et de l’adaptation à l’environnement ainsi que de la qualité des produits ;
*l’intégration des données et la modélisation (des plantes en peuplement) pour l’aide à la définition d’idéotypes variétaux ;
*les méthodologies les plus récentes de phénotypage et de génotypage ;
*l’intégration des connaissances vers l’innovation variétale et les méthodes de sélection innovantes. +