EcoTaxa

De Cat OPIDoR
  EcoTaxa
Type de service Plateforme d'accès
Statut En production
URL https://ecotaxa.obs-vlfr.fr/
Contact marc.picheral@obs-vlfr.fr
Localisation Villefranche-sur-Mer
Structure d'appartenance IMEV
Tutelles CNRS, Sorbonne Université


Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :


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EcoTaxa est une application web qui permet de stocker et classer des images d'organismes individuels, principalement du plancton, en utilisant une taxonomie de référence. Les images et les métadonnées associées aux organismes qu'elles représentent sont chargées dans l'application afin de prédire leur identification (classification automatique). Les utilisateurs enregistrés peuvent ensuite valider cette classification ou améliorer le tri en visualisant celles-ci via un interface web dédié. Toutes les activités sont enregistrées afin de permettre un contrôle qualité. ECOTAXA accueille aujourd'hui plus de 50 millions d'images acquises avec différents types d'instruments. Environ 30% sont déjà validées. Ecotaxa est aujourd'hui la plus grande base d'images de plancton triée.


L'application web EcoTaxa est hébergée et maintenue par la plateforme d’imagerie quantitative de Villefranche-sur-Mer - PIQv (Laboratoire d'Océanographie de Villefranche LOV - Institut de la Mer de Villefranche IMEV dédiée à l’analyse d’imagerie quantitative du plancton et des détritus aquatiques. Cette plateforme est intégrée dans l’offre de services de l’Infrastructure de Recherche EMBRC France, nœud français d’EMBRC.


Domaines scientifiques :Vie & Santé


LS3 Biologie cellulaire, du développement et régénérative; LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution Thématique et/ou mots clés :

  • Plancton
  • Imagerie quantitative

Type de données :Images

Communauté d'utilisateurs : Usagers et bénéficiaires :


Conditions d'usage : Accès libre. Accès avec login/mot de passe. Cependant la création d'un compte n'est pas nécessaire pour la simple consultation, mais obligatoire pour la contribution.

Conditions tarifaires : Accès gratuit

Certification/Label :

Conditions générales d'utilisation :

EcoTaxa est en lien avec les services et structures

EMBRC France, Tara Océan



Services proposés par la structure d'appartenance
StructureServices proposés
IMEVEcoTaxa
MICA