PBM
| Type de service | Plateforme d'acquisition |
|---|---|
| Statut | En production |
| Nom développé | Plateforme de Biologie Moléculaire de Villefranche (PBM) |
| Autres noms | PBM |
| URL | https://www.imev-mer.fr/web/plateforme-de-biologie-moleculaire-de-villefranche-pbm/ |
| Contact | alessandra.contento@imev-mer.fr |
| Localisation | Villefranche-sur-Mer |
| Structure d'appartenance | IMEV, OSU STAMAR, EMBRC France |
| Tutelles | Sorbonne Université, CNRS |
Cycle de vie des données
Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :
Elle est labellisée au sein de l’IR EMBRC-France. PBM propose des services de génotypage, de clonage de cDNA et de soutien technique à différents appareils.
Services offerts :Texte en italique
Maitrise des techniques - Génotypage par PCR, - Clonage dans différents vecteurs plasmidiques (pGEM-Teasy, système Gateway, vecteur d’expression pCS2+), - Mise à disposition d’équipements (Nanodrop, qPCR, Bioanalyseur).
Maitrise de logiciels d’analyse de séquence ADN - Choix des amorces - Analyse des séquences brutes après séquençage - Recherche dans des banques de données - Alignement de séquences, arbres phylogénétiques
La plateforme garantit la confidentialité des données et des résultats
Domaines scientifiques :Vie & Santé
LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions; LS3 Biologie cellulaire, développement, cellules souches et régénération; LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution Thématique et/ou mots clés :
- Séquençage génomique
- Génomique environnementale
- Métagénomique
- Métabarcoding
Type de données :Données génomiques (FASTA, FASTQ)
Communauté d'utilisateurs : Usagers et bénéficiaires :
Conditions d'usage :
Conditions tarifaires :
Certification/Label :
Conditions générales d'utilisation :
| Structure | Services proposés |
|---|---|
| EMBRC France | Plateforme GENOMER PBM |
| IMEV | EcoTaxa MICA PBM |
| OSU STAMAR | EcoTaxa MICA Plateforme GENOMER ABiMS PBM |