GenoA

  GenoA

Type de service	Plateforme d'acquisition
Statut	En production
Nom développé	Genomics Atlantic
Autres noms	Plateforme génomique de Nantes
URL	https://pf-genomique.univ-nantes.fr
Contact	genoa-at-univ-nantes.fr
Localisation	Nantes
Structure d'appartenance	Institut du thorax
Tutelles	Inserm, CNRS, Nantes Université

Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :

Collecte

Analyse

Documentation

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La plateforme GenoA possède une expertise dans l'analyse de données à grande échelle et développe des pipelines d'analyse bioinformatique dédiés afin de standardiser l'analyse des données brutes jusqu'à l'interprétation biologique.

La GenoA offre deux types de services :

• Gestion de projet
• Mise à disposition d'équipements génomiques

Elle est reconnue pour son expertise dans les applications suivantes :

• Analyse du transcriptome : RNA-seq, 3'seq
• Profilage de l'ARN
• Séquençage à haut débit : génomes entiers
• Analyse des microbiotes : 16S, métagénomique Shotgun
• Séquençage de toute librairie (MiSeq, NovaSeq)

Les ressources de calcul et de stockage de la plateforme BiRD sont accessibles et ouvertes pour les projets issus de la plateforme GenoA.

Domaines scientifiques :Vie & Santé

LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes Thématique et/ou mots clés :

• Plateforme de bioinformatique

Type de données :Données de séquençage, Données brutes, Données génomiques

Périmètre de communauté : ESR, thématique, privé, national

Communauté d'utilisateurs : Communautés scientifiques académiques et médicales et laboratoires privés dans le domaine de la génomique.

Usagers et bénéficiaires :Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Médecins

Conditions d'usage : Toutes les demandes de projet sont discutées lors d'une réunion avec le chef de projet et ses collègues, afin d'établir une feuille d'engagement dans laquelle sont décrites les spécifications, ainsi que les modalités de livraison des résultats et le calendrier de la prestation.

Conditions tarifaires :

Certification/Label :IBiSA (https://www.ibisa.net/trouver-plateforme/)

Conditions générales d'utilisation :

GenoA est en lien avec les services et structures

France Génomique, Biogenouest, BiRD

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
Institut du thorax	BiRD GenoA

Enseignement Supérieur et Recherche

Le GIS Infrastructure en Biologie Santé et Agronomie a pour vocation de structurer et de financer les infrastructures de recherche en sciences de la vie, en mutualisant leurs moyens.