« CATdb » : différence entre les versions
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|Description='''CATdb''' met à disposition les '''analyses de transcriptome réalisées par la plateforme POPS de l’IPS2''' (cf. [https://ips2.u-psud.fr/fr/plateformes/spomics-interatome-metabolome-transcriptome.html SPOMICS]), depuis les plans expérimentaux jusqu’aux analyses différentielles en passant par les descriptions complètes des échantillons et leurs traitements, pour plusieurs espèces végétales. | |Description='''CATdb''' met à disposition les '''analyses de transcriptome réalisées par la plateforme POPS de l’IPS2''' (cf. [https://ips2.u-psud.fr/fr/plateformes/spomics-interatome-metabolome-transcriptome.html SPOMICS]), depuis les plans expérimentaux jusqu’aux analyses différentielles en passant par les descriptions complètes des échantillons et leurs traitements, pour plusieurs espèces végétales. | ||
Le module [ | Le module [https://tools.ips2.universite-paris-saclay.fr/GEM2Net/ GEM2Net] donne accès aux méta-analyses du transcriptome d’Arabidopsis thaliana sous conditions de stress variées. | ||
|Discipline=Vie & Santé | |Discipline=Vie & Santé | ||
|SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes | |SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes | ||
Version du 2 février 2026 à 16:05
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|---|---|
| Type de service | Plateforme d'accès |
| Statut | En production |
| Nom développé | Complete Arabidopsis Trancriptome database |
| URL | https://catdb.ips2.universite-paris-saclay.fr |
| Contact | gnet.db@ips2.upsaclay.fr |
| Localisation | Gif-sur-Yvette |
| Structure d'appartenance | IPS2 |
| Tutelles | CNRS, INRAE |
Cycle de vie des données
Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :
CATdb met à disposition les analyses de transcriptome réalisées par la plateforme POPS de l’IPS2 (cf. SPOMICS), depuis les plans expérimentaux jusqu’aux analyses différentielles en passant par les descriptions complètes des échantillons et leurs traitements, pour plusieurs espèces végétales.
Le module GEM2Net donne accès aux méta-analyses du transcriptome d’Arabidopsis thaliana sous conditions de stress variées.
Domaines scientifiques :Vie & Santé
LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes Thématique et/ou mots clés :
Type de données :Données et Analyses transcriptomiques
Usagers et bénéficiaires :
Conditions d'usage :
Conditions tarifaires :
Certification/Label :
Conditions générales d'utilisation : https://catdb.ips2.universite-paris-saclay.fr/notices/tfr/
| Structure | Services proposés |
|---|---|
| IPS2 | CATdb POPS (IPS2) |